Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: XM_011543539.2
• Aligned Length: 807
• Identities: 708
• Gaps: 99

Alignment

Query   1  ATGAATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGAACTTAT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGAACTTAT  74

Query  75  TAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  148

Query 149  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  222

Query 223  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  296

Query 297  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGAAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 297  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGA--  368

Query 371  GGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTGAAAAAT  444
                                                                                     
Sbjct 369  --------------------------------------------------------------------------  368

Query 445  AAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  518
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  -----------------------AAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  419

Query 519  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  493

Query 593  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATAAATAGA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATAAATAGA  567

Query 667  TTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCTGCTGCT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568  TTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCTGCTGCT  641

Query 741  GCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  807
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642  GCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  708