Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: XM_011543541.2
• Aligned Length: 818
• Identities: 593
• Gaps: 214

Alignment

Query   1  ATGAATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGAACTTAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATG---------CAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTC  213
                                              |||         ||.||.|.||     ||.|||.|..||
Sbjct   1  -----------------------------------ATGACCCTCTTCCAGGTTACAT-----ACAGCTTACATC  34

Query 214  AGTCAATGGCAGAAAAAAACACCTGAA--ACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAA  285
                 |.|||         .|||.||  .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  35  ------TTGCA---------TCCTCAAGCGCAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAA  93

Query 286  GAGTTCCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGA  359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  94  GAGTTCCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGA  167

Query 360  AGACTTAGAAAGGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTG  433
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 168  AGACTTAGAAAGGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTG  241

Query 434  AATTGAAAAATAAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATA  507
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242  AATTGAAAAATAAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATA  315

Query 508  AAAGAATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAG  581
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316  AAAGAATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAG  389

Query 582  TGTTAAAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTC  655
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390  TGTTAAAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTC  463

Query 656  TTATAAATAGATTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTT  729
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464  TTATAAATAGATTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTT  537

Query 730  GAGCTGCTGCTGCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCA  803
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538  GAGCTGCTGCTGCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCA  611

Query 804  TCAG  807
           ||||
Sbjct 612  TCAG  615