Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: XM_017009693.1
• Aligned Length: 828
• Identities: 704
• Gaps: 105

Alignment

Query   1  ATGA------ATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGA  68
           ||||      ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACCCTCTTCCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGA  74

Query  69  ACTTATTAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTG  142
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACTTATTAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTG  148

Query 143  AAACACTCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGT  216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AAACACTCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGT  222

Query 217  CAATGGCAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTT  290
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CAATGGCAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTT  296

Query 291  CCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACT  364
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACT  370

Query 365  TAGAAAGGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTG  438
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TAGAAAGGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTG  444

Query 439  AAAAATAAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGA  512
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AAAAATAAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGA  518

Query 513  ATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTA  586
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTA  592

Query 587  AAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATA  660
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 593  AAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAG---------  657

Query 661  AATAGATTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCT  734
                                |.||..||             ||||             .|||.|||..|||||
Sbjct 658  ---------------------CCTGCACC-------------AGTG-------------GCCTCATGGGGAGCT  684

Query 735  GCTGCTGCG---------TAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAA---CCCGAATAAGATT--AGA  794
           .|  |||.|         .||.||||               .||||||  |||   ||.|     |.||  |||
Sbjct 685  CC--CTGTGAACAGTTGAAAAAGGAA---------------GAGAAGA--CAAGGGCCTG-----GTTTACAGA  734

Query 795  AGCTT-TCCATCAG  807
           .|.|| |.||    
Sbjct 735  TGGTTCTGCA----  744