Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03940
- Subject:
- XM_017002060.2
- Aligned Length:
- 2335
- Identities:
- 2159
- Gaps:
- 164
Alignment
Query 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
Query 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
Query 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
Query 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
Query 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
Query 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
Query 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
Query 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
Query 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCA------------AATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 654
Query 667 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 728
Query 741 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 802
Query 815 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 876
Query 889 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 950
Query 963 ACACAG------------------------------------------------------TAGTATTATTGATT 982
|||||| ||||||||||||||
Sbjct 951 ACACAGCCTTGAATTCAGTTCTGATATGCACAGGATCTTTGTCAATGGAATACTTATTATTAGTATTATTGATT 1024
Query 983 CCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACG 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACG 1098
Query 1057 TTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCTACAAGGATGTC 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 TTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCTACAAGGATGTC 1172
Query 1131 TCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGAT 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 TCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGAT 1246
Query 1205 ATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGTTCCAGTATAGTCTCTAGT 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 ATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGTTCCAGTATAGTCTCTAGT 1320
Query 1279 ATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATGA 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATGA 1394
Query 1353 CACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTGCAATTCGAAAATCAGCTGTA 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 CACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTGCAATTCGAAAATCAGCTGTA 1468
Query 1427 TCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTATGGGATGGA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTATGGGATGGA 1542
Query 1501 TTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGA 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 TTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGA 1616
Query 1575 TCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTACCAATCTAGACAACTCAGTGG 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 TCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTACCAATCTAGACAACTCAGTGG 1690
Query 1649 CAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGC 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 CAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGC 1764
Query 1723 TGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCG 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 TGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCG 1838
Query 1797 TAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTCAACAGACAGTCAGCTAAAAC 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 TAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTCAACAGACAGTCAGCTAAAAC 1912
Query 1871 TGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTG 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 TGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTG 1986
Query 1945 GCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTGTACTATAAAGGACTTTCTAA 2018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 GCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTGTACTATAAAGGACTTTCTAA 2060
Query 2019 GACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATG 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 GACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATG 2134
Query 2093 AATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCC---AATGTGC-TG-------------- 2148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||| ||| ||| ||
Sbjct 2135 AATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGTA-TCCTAGAAT-TGCATGGGAGAAGCAAAGAT 2206
Query 2149 ---ATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGC--------------TAGAATTGGTA------------ 2193
||..||| |.||| |.||||...||.|| |||||.||..|
Sbjct 2207 CCCATCTCTG-TCACA-------TCCAATCTTGGAGCCACCGGTGGAAATTTAGAAGTGCCAAAGTGTTTCCAA 2272
Query 2194 ----------------------------------------- 2193
Sbjct 2273 CAGTCGCTGCCGCAAACCTATTCTTTCTTTACAGGAGTGAT 2313