Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04013
• Subject: NM_001255986.1
• Aligned Length: 816
• Identities: 722
• Gaps: 84

Alignment

Query   1  ATGAGGGGGAATCTGGCCCTGGTGGGCGTTCTAATCAGCCTGGCCTTCCTGTC---ACTGCTGCCATCTGGACA  71
           |||                |||||||               .||||.|..|||   ||.|.||.|.||      
Sbjct   1  ATG----------------TGGTGGG---------------TGCCTCCGAGTCCCTACGGTTGTCTTC------  37

Query  72  TCCTCAGCCGGCTGGCGATGACGCCTGCTCTGTGCAGATCCTCGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCGGGAGAGA  145
                                  |||||                .|||||.|     |||||||||||||||||
Sbjct  38  -----------------------CCTGC----------------GCCCTGCC-----AGGGGATGCGGGAGAGA  67

Query 146  AGGGAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGACAAA  219
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  68  AGGGAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGACAAA  141

Query 220  GGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTCCGG  293
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142  GGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTCCGG  215

Query 294  TGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCATCG  367
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216  TGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCATCG  289

Query 368  GGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAATGCTGTCGCCGGTGTGCGC  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290  GGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAATGCTGTCGCCGGTGTGCGC  363

Query 442  GAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGACGCCCAGCTGTCCTGCCAGGG  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364  GAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGACGCCCAGCTGTCCTGCCAGGG  437

Query 516  CCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGGCCGCATACCTGGCGCAAGCCG  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438  CCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGGCCGCATACCTGGCGCAAGCCG  511

Query 590  GCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTCGTGTACTCTGACCACTCCCCC  663
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512  GCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTCGTGTACTCTGACCACTCCCCC  585

Query 664  ATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGAGGAGGACTGCGTGGAGATGGT  737
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586  ATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGAGGAGGACTGCGTGGAGATGGT  659

Query 738  GGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGTGTGAGTTTGACAAGGAGAACA  811
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660  GGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGTGTGAGTTTGACAAGGAGAACA  733

Query 812  TG  813
           ||
Sbjct 734  TG  735