Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04013
- Subject:
- NM_001313978.1
- Aligned Length:
- 837
- Identities:
- 707
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ------ATGAGGGGGAATCTGGCCCTGGTGGGCGTTCTAATCAGCCTGGCCTTCCTGTCACTGCTGCCATCTGG 68
||||||| |.|||||.||.|..|||.|.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGATGAGGG---ACCTGGCTCTTGCAGGCATGCTGATTAGCCTGGCTTTCCTGTCCCTGCTGCCATCTGG 71
Query 69 ACATCCTCAGCCGGCTGGCGATGACGCCTGCTCTGTGCAGATCCTCGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCGGGAG 142
|..||||||||.|.|....||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 72 ATGTCCTCAGCAGACCACAGAGGACGCCTGCTCTGTGCAGATTCTTGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCAGGAG 145
Query 143 AGAAGGGAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGAC 216
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 AAAAGGGAGACAAAGGAGCCCCAGGACGGCCAGGAAGAGTCGGCCCTACAGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGAC 219
Query 217 AAAGGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTC 290
||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 220 AAAGGACAGAAAGGCACTGTGGGCCGCCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCGCAAAAGGTGAAAAAGGAGATTC 293
Query 291 CGGTGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCA 364
.|||||.||.|||||||||||.||.|.|||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|
Sbjct 294 TGGTGATATCGGACCCCCTGGCCCCAGTGGAGAACCTGGTATTCCATGTGAGTGCAGTCAGCTGAGGAAGGCTA 367
Query 365 TCGGGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAAT--------------- 423
|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|..|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 368 TTGGGGAGATGGACAACCAGGTCACTCAACTGACAACTGAGCTAAAATTCATAAAAAATGCACTGCCCTCCCCT 441
Query 424 ---GCTGTCGCCGGTGTGCGCGAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGA 494
|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 442 GCAGCTGTTGCTGGCGTGCGCGAGACTGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGGTACGCAGA 515
Query 495 CGCCCAGCTGTCCTGCCAGGGCCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGG 568
.|||||||||||||||||.|.|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 516 TGCCCAGCTGTCCTGCCAAGCCCGAGGCGGCACACTGAGCATGCCCAAAGACGAGGCAGCCAATGGCCTGATGG 589
Query 569 CCGCATACCTGGCGCAAGCCGGCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTC 642
|..||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 590 CTTCATACCTGGCACAGGCTGGCCTGGCCCGAGTCTTCATCGGTATCAATGACCTGGAGAAAGAAGGTGCTTTC 663
Query 643 GTGTACTCTGACCACTCCCCCATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGA 716
||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 664 GTGTACTCGGACCGCTCCCCCATGCAGACCTTCAACAAGTGGCGCAGTGGAGAGCCCAACAACGCCTATGATGA 737
Query 717 GGAGGACTGCGTGGAGATGGTGGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGT 790
|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 738 GGAGGACTGTGTGGAGATGGTGGCCTCAGGTGGCTGGAATGATGTGGCCTGCCACATTACCATGTACTTCATGT 811
Query 791 GTGAGTTTGACAAGGAGAACATG 813
|.|||||||||||.||||||.||
Sbjct 812 GCGAGTTTGACAAAGAGAACTTG 834