Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04013
• Subject: NM_199235.3
• Aligned Length: 892
• Identities: 725
• Gaps: 167

Alignment

Query   1  ATGAGGGGGAATCTGGCCCTGGTGGGCGTTCTAATCAGCCTGGCCTTCCTGTCACTGCTGCCATCTGGACATCC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TCAGCCGGCTGGCGATGACGCCTGCTCTGTGCAGATCCTCGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCGGGAGAGAAGG  148
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------------ATGACGCCTGCTCTGTGCAGATCCTCGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCGGGAGAGAAGG  60

Query 149  GAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAA---------------------  201
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  61  GAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAAGCAGTCACAGCCAGTCGTGAC  134

Query 202  ----------------------------------------------------------GGAGACATGGGGGACA  217
                                                                     ||||||||||||||||
Sbjct 135  AGCTTCTGACATCTCCAAAAGGAAGTGCACCTCGTCCTTTGTAGAAATGGGATCACAGGGAGACATGGGGGACA  208

Query 218  AAGGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTCC  291
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209  AAGGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTCC  282

Query 292  GGTGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCAT  365
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283  GGTGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCAT  356

Query 366  CGGGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAATGCTGTCGCCGGTGTGC  439
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  CGGGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAATGCTGTCGCCGGTGTGC  430

Query 440  GCGAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGACGCCCAGCTGTCCTGCCAG  513
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431  GCGAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGACGCCCAGCTGTCCTGCCAG  504

Query 514  GGCCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGGCCGCATACCTGGCGCAAGC  587
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505  GGCCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGGCCGCATACCTGGCGCAAGC  578

Query 588  CGGCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTCGTGTACTCTGACCACTCCC  661
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579  CGGCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTCGTGTACTCTGACCACTCCC  652

Query 662  CCATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGAGGAGGACTGCGTGGAGATG  735
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653  CCATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGAGGAGGACTGCGTGGAGATG  726

Query 736  GTGGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGTGTGAGTTTGACAAGGAGAA  809
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727  GTGGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGTGTGAGTTTGACAAGGAGAA  800

Query 810  CATG  813
           ||||
Sbjct 801  CATG  804