Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04050
• Subject: XM_006718315.2
• Aligned Length: 1040
• Identities: 870
• Gaps: 160

Alignment

Query    1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74

Query   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148

Query  149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222

Query  223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296

Query  297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370

Query  371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444

Query  445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518

Query  519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592

Query  593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666

Query  667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740

Query  741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814

Query  815  AACGGCTGCTTCTTCCCTTCTTCAGGCTGG-----CCC----AGGTCCCA-----GGCCTGG-----TCAACTC  869
            ||||||| |..||.|    .||.|||  ||     |||    ||   |||     |||||.|     ||||  .
Sbjct  815  AACGGCT-CAACTCC----ATTAAGG--GGGAGAACCCGAATAG---CCACGCAGGGCCTTGCACCATCAA--G  876

Query  870  GGTCACA--------GCCAGT-CCA-GAGGCCAGTTGCCTGCCTTCCCGGACCCCTCCCCGGGTTGGCTCTCCC  933
            |||.|||        ||.||| ||| ||||.||                                         
Sbjct  877  GGTGACACCTGCGACGCAAGTACCAGGAGGACA-----------------------------------------  909

Query  934  TGGAGACCTCTCCATCATTCCCGAAAAGTGGATGGAGAGAGTGATGGCTCCACTGAAGAGACAGACGAGTCGGA  1007
                                                                                      
Sbjct  910  --------------------------------------------------------------------------  909

Query 1008  GACT  1011
                
Sbjct  910  ----  909