Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04094
• Subject: NM_001285812.1
• Aligned Length: 861
• Identities: 706
• Gaps: 42

Alignment

Query   1  ATGGCCTCGGCAGAGCTGGACTACACCATCGAGATCCCGGATCAGCCCTGCTGGAGCCAGA-------------  61
           |||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct   1  ATGGCCTCGGCCGAGCTGGATTACAGCATCGAGATCCCGGATCAGCCCTGCTGGAGCCAGAGTATGGAGGGGGA  74

Query  62  --------AGAACAGCCCCAGCCCAGGTGGGAAGGA-----GGCAGAAACTCGGCAGCCTGTGGTGATTCTCTT  122
                   ||||      |||.|.||||||||||||     ||.||.||     ||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TTGGGAAGAGAA------CAGACAAGGTGGGAAGGAAGCTGGGAAGCAA-----CAGCCTGTGGTGATTCTCTT  137

Query 123  GGGCTGGGGTGGCTGCAAGGACAAGAACCTTGCCAAGTACAGTGCCATCTACCACAAAAGGGGCTGCATCGTAA  196
           |||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 138  GGGCTGGGGAGGCTGCAGGGACAAGAACCTGGCCAAGTATAGTGCTATCTACCACAAAAGGGGCTGCATTGTGA  211

Query 197  TCCGATACACAGCCCCGTGGCACATGGTCTTCTTCTCCGAGTCACTGGGTATCCCTTCACTTCGTGTTTTGGCC  270
           ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||..|.|||
Sbjct 212  TCCGATACACGGCCCCCTGGCACATGGTCTTCTTCTCTGAGTCCTTGGGCATCCCTTCACTTCGCGTGATAGCC  285

Query 271  CAGAAGCTGCTCGAGCTGCTCTTTGATTATGAGATTGAGAAGGAGCCCCTGCTCTTCCATGTCTTCAGCAACGG  344
           |||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||..||||||.|||||||||||.|||||||||||.|.
Sbjct 286  CAGAAACTGCTGGAGCTCCTCTTTGACTATGAGATTGAGCGGGAGCCTCTGCTCTTCCACGTCTTCAGCAATGC  359

Query 345  TGGCGTCATGCTGTACCGCTACGTGCTGGAGCTCCTGCAGACCC----GTCGCTTCTGCCGCCTGCGTGTGGTG  414
           .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||    | ||||||.|||...|||.|||||||
Sbjct 360  CGGCGTCATGCTCTACCGCTACGTGCTGGAGCTCCTACAGACCCACCAG-CGCTTCCGCCATTTGCATGTGGTG  432

Query 415  GGCACCATCTTTGACAGCGCTCCTGGTGACAGCAACCTGGTAGGGGCTCTGCGGGCCCTGGCAGCCATCCTGGA  488
           |||||||||||||||||.|.||||||.||.|||||||||.|||||||.|||.||||.||||||.||||||||||
Sbjct 433  GGCACCATCTTTGACAGTGGTCCTGGCGATAGCAACCTGATAGGGGCCCTGAGGGCTCTGGCAACCATCCTGGA  506

Query 489  GCGCCGGGCCGCCATGCTGCGCCTGTTGCTGCTGGTGGCCTTTGCCCTGGTGGTCGTCCTGTTCCACGTCCTGC  562
           ||||||..|.||..||||||||||||||||.||||..||.||||||||||||||..|||||||.|||.||||||
Sbjct 507  GCGCCGACCTGCGGTGCTGCGCCTGTTGCTCCTGGCAGCATTTGCCCTGGTGGTGATCCTGTTTCACTTCCTGC  580

Query 563  TTGCTCCCATCACAGCCCTCTTCCACACCCACTTCTATGACAGGCTACAGGACGCGGGCTCTCGCTGGCCCGAG  636
           |||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||..|||||||.||.
Sbjct 581  TTGCTCCATTCACTGCCCTCTTCCACACCCACTTCTACGACAGGCTGCAGGACTCAGGCTCCTGCTGGCCTGAA  654

Query 637  CTCTACCTCTACTCGAGGGCTGACGAAGTAGTCCTGGCCAGAGACATAGAACGCATGGTGGAGGCACGCCTGGC  710
           ||||||||||||||.||.|||||..|.||.|||..||||||.||..|.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 655  CTCTACCTCTACTCTAGAGCTGATAAGGTGGTCTCGGCCAGGGATGTGGAACGTATGGTAGAGGCACGCCTGGC  728

Query 711  ACGCCGGGTCCTGGCGCGTTCTGTGGATTTCGTGTCATCTGCACACGTCAGCCACCTCCGTGACTACCCTACTT  784
           .|.||.||||.|||.||||...|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 729  TCACCAGGTCATGGTGCGTGGAGTGGACTTTGTGTCATCTGCGCATGTCAGCCACCTCCGAGACTATCCTACTT  802

Query 785  ACTACACAAGCCTCTGTGTCGACTTCATGCGCAACTGCGTCCGCTGC  831
           ||||.|||||.||.|||||.||||||||||..||.||.||||..|||
Sbjct 803  ACTATACAAGTCTGTGTGTTGACTTCATGCATAATTGTGTCCAATGC  849