Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04170
• Subject: XM_017319298.1
• Aligned Length: 838
• Identities: 774
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGCCTGCTTTTATTCAAATGGGCAGAGATAAAAACTTCTCGAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGG  74
           |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCTGCTTTTATTCAGATGGGCAGAGATAAAAACTTCTCAAGTCTCCACACTGTCTTTTGTGCCACTGGAGG  74

Query  75  TGGAGCGTACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAGGTGATCTTCAGCTTTGCAAACTGGATGAACTAGATT  148
           ||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGGATCATACAAATTTGAGCAGGATTTTCTCACAATAGGTGACCTTCAGCTTCGAAAACTGGATGAACTAGATT  148

Query 149  GCTTGATCAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTCGGATTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTACTTTGAAAAC  222
           ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149  GCTTAATAAAAGGAATTTTATACATTGACTCAGTTGGATTCAATGGACGGTCACAGTGCTATTATTTTGAAAAC  222

Query 223  CCTGCTGATTCTGAAAAGTGTCAGAAGTTACCATTTGATTTGAAAAATCCGTATCCTCTGCTTCTGGTGAACAT  296
           |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CCTGCTGATTCTGAAAAATGTCAGAAGTTACCATTTGATTTAAAAAATCCATATCCTCTGCTTCTGGTGAACAT  296

Query 297  TGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTATATTCCAAAGATAATTACAAACGGGTCACAGGTACTAGTCTTGGAG  370
           .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297  CGGCTCAGGGGTTAGCATCTTAGCAGTGTATTCCAAAGATAATTATAAGAGGGTCACAGGCACCAGTCTTGGAG  370

Query 371  GAGGAACTTTTTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGCTGTACCACTTTTGAAGAAGCTCTTGAAATGGCATCT  444
           ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371  GAGGAACTTTCTTTGGTCTCTGCTGTCTTCTTACTGGCTGTAGTACTTTTGAAGAAGCTCTTGAGATGGCATCT  444

Query 445  CGTGGAGATAGCACCAAAGTGGATAAACTAGTACGAGATATTTATGGAGGGGACTATGAGAGGTTTGGACTGCC  518
           |||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct 445  CGTGGAGATAGCACCAAAGTGGACAAATTAGTTCGAGACATTTATGGAGGAGACTATGAGAGGTTTGGCTTGCC  518

Query 519  AGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGCTTTGGAAACATGATGAGCAAGGAGAAGCGAGAGGCTGTCAGTAAAGAGGACC  592
           |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||.|||||.|
Sbjct 519  AGGCTGGGCTGTGGCTTCAAGTTTTGGAAACATGATGAGCAAGGAGAAGAGAGAGGCGGCCAGTAAGGAGGATC  592

Query 593  TGGCCAGAGCGACTTTGATCACCATCACCAACAACATTGGCTCAATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAAC  666
           |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TTGCCAGAGCAACTTTGATCACCATCACCAACAACATTGGCTCCATAGCAAGAATGTGTGCCCTTAATGAAAAC  666

Query 667  ATTAACCAGGTGGTATTTGTTGGAAATTTCTTGAGAATTAATACGATCGCCATGCGGCTTTTGGCATATGCTTT  740
           |||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||.|.||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||..|
Sbjct 667  ATTAACCAGGTCGTATTTGTCGGCAATTTCCTGAGAGTCAACACGATTGCTATGCGGCTTCTGGCGTATGCGCT  740

Query 741  GGATTATTGGTCCAAGGGGCAGTTGAAAGCACTTTTTTCGGAACACGAGGGTTATTTTGGAGCTGTTGGAGCAC  814
           ||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 741  GGATTACTGGTCCAAGGGGCAGCTGAAAGCACTGTTTTCCGAGCACGAGGGATATTTTGGAGCCGTTGGAGCAC  814

Query 815  TCCTTGAGCTGTTGAAGAT-CCCG  837
           ||||.|||||||||||||| ||| 
Sbjct 815  TCCTCGAGCTGTTGAAGATACCC-  837