Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04249
• Subject: NM_001042517.2
• Aligned Length: 1193
• Identities: 844
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MERHQPRLHHPAQGSAAGTPYPSSASLRGCRESKMPRRKGPQHPPPPSGPEEPGEKRPKFHLNIRTLTDDMLDK  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  FASIRIPGSKKERPPLPNLKTAFASSDCSAAPLEMMENFPKPLSENELLELFEKMMEDMNLNEDKKAPLREKDF  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  SIKKEMVMQYINTASKTGSLKRSRQISPQEFIHELKMGSADERLVTCLESLRVSLTSNPVSWVESFGHEGLGLL  222

Query    1  -----------------------------------------MSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVC  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LDILEKLISGKIQEKVVKKNQHKVIQCLKALMNTQYGLERIMSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVC  296

Query   34  IVGEESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNSVQLQVACMQLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGL  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  IVGEESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNSVQLQVACMQLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGL  370

Query  108  KEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDEAYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHL  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  KEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDEAYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHL  444

Query  182  LLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEK  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEK  518

Query  256  EFTDHQETQAELQKKEAKINELQAELQAFKSQFGALPADCNIPLPPSKEGGTGHSALPPPPPLPSGGGVPPPPP  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  EFTDHQETQAELQKKEAKINELQAELQAFKSQFGALPADCNIPLPPSKEGGTGHSALPPPPPLPSGGGVPPPPP  592

Query  330  PPPPPPLPGMRMPFSGPVPPPPPLGFLGGQNSPPLPILPFGLKPKKEFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWI  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PPPPPPLPGMRMPFSGPVPPPPPLGFLGGQNSPPLPILPFGLKPKKEFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWI  666

Query  404  KVNENKYENVDLLCKLENTFCCQQKERREEEDIEEKKSIKKKIKELKFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMM  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  KVNENKYENVDLLCKLENTFCCQQKERREEEDIEEKKSIKKKIKELKFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMM  740

Query  478  ILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQFVVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVN  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQFVVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVN  814

Query  552  NIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVE  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  NIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVE  888

Query  626  ICEEKYPDILNFVDDLEPLDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEKELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKE  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ICEEKYPDILNFVDDLEPLDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEKELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKE  962

Query  700  QYETLSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAE  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  QYETLSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAE  1036

Query  774  RERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRTPMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHGNKP  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..
Sbjct 1037  RERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRTPMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHENQK  1110

Query  848  YL------------------------------------------------------------------------  849
            ..                                                                        
Sbjct 1111  VQLTEGSRSHYNINCNSTRTPVAKELNYNLDTHTSTGRIKAAEKKEACNVESNRKKETELLGSFSKNESVPEVE  1184

Query  850  ---------  849
                     
Sbjct 1185  ALLARLRAL  1193