Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04249
• Subject: NM_030932.3
• Aligned Length: 2547
• Identities: 2547
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGTGAGGAGAGGAGCCTTTCCTTATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGAGGAGAGGAGCCTTTCCTTATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGT  74

Query   75  GGTTAAACTTCTCTCTGCGGTATGCATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTAAACTTCTCTCTGCGGTATGCATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTT  148

Query  149  CAGCTGGTGAAGAAAAAAAAATTGACAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGGTGAAGAAAAAAAAATTGACAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTG  222

Query  223  CAAGTAGCTTGTATGCAGCTCATCAATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGTAGCTTGTATGCAGCTCATCAATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAG  296

Query  297  AAATGAATTTATGCGTTGTGGATTGAAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATGAATTTATGCGTTGTGGATTGAAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATA  370

Query  371  TCCAACTTAAAGTCTTTGATGAGCATAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAACTTAAAGTCTTTGATGAGCATAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGA  444

Query  445  GCTGAACTTGATGAAGCATATGATGTTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGAACTTGATGAAGCATATGATGTTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATA  518

Query  519  TTTTATTTCTATTCTTCAGCATCTTTTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTATTTCTATTCTTCAGCATCTTTTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAA  592

Query  593  TTGATGAGTGTGTATCCCAGATTGTATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGATGAGTGTGTATCCCAGATTGTATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTA  666

Query  667  GATTTAGATTTAACCCAGTTTGTAGACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTTAGATTTAACCCAGTTTGTAGACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATC  740

Query  741  AGAACTTTACAAGAAATTTGAAAAAGAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAACTTTACAAGAAATTTGAAAAAGAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGG  814

Query  815  CAAAGATTAATGAGCTTCAAGCAGAGCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAAGATTAATGAGCTTCAAGCAGAGCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAAT  888

Query  889  ATTCCTTTGCCTCCCTCTAAAGAAGGTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTCCTTTGCCTCCCTCTAAAGAAGGTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGG  962

Query  963  TGGAGGGGTGCCGCCTCCACCTCCTCCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAGGGGTGCCGCCTCCACCTCCTCCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTC  1036

Query 1037  CTGTGCCTCCACCACCTCCCCTGGGATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTGCCTCCACCACCTCCCCTGGGATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGG  1110

Query 1111  TTGAAACCAAAGAAAGAATTTAAACCTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGAAACCAAAGAAAGAATTTAAACCTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGA  1184

Query 1185  AATGACTGAAAACTGTTTCTGGATAAAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATGACTGAAAACTGTTTCTGGATAAAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTG  1258

Query 1259  AGAATACATTTTGTTGCCAACAAAAAGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAATACATTTTGTTGCCAACAAAAAGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAA  1332

Query 1333  AAAATTAAAGAACTTAAGTTTTTAGATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAATTAAAGAACTTAAGTTTTTAGATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGT  1406

Query 1407  GCCATATGAGGAAATCAGAATGATGATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTCAGAACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCATATGAGGAAATCAGAATGATGATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTCAGAACT  1480

Query 1481  TAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGAGCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATAGCAACTTATGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGAGCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATAGCAACTTATGT  1554

Query 1555  GAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGATGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCTATTCTCTTTAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGATGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCTATTCTCTTTAA  1628

Query 1629  GCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAACAACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTGCGAAGAGATAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAACAACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTGCGAAGAGATAA  1702

Query 1703  AGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTTGCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATGCTGGCTCCCGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTTGCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATGCTGGCTCCCGG  1776

Query 1777  AATGCTCAAACCTTCGGATTTAACCTTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCAGATCAGAAAAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATGCTCAAACCTTCGGATTTAACCTTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCAGATCAGAAAAC  1850

Query 1851  AACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAAATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGTGGATGATTTGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAAATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGTGGATGATTTGG  1924

Query 1925  AACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGTCTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGGGAAGGCAGCTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGTCTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGGGAAGGCAGCTT  1998

Query 1999  CAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAACCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTGACAAAGATGTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAACCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTGACAAAGATGTC  2072

Query 2073  CAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAACAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGAAAAGTTATACC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAACAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGAAAAGTTATACC  2146

Query 2147  AGAGTATAATAGGATACTATGCCATTGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTGACCTGAATAAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAGTATAATAGGATACTATGCCATTGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTGACCTGAATAAC  2220

Query 2221  TTCAGAACCACATTCATGCAAGCAATAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAAGAAAAACGTGT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTCAGAACCACATTCATGCAAGCAATAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAAGAAAAACGTGT  2294

Query 2295  CAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAGCGAGAAAGACTCGAACGCCAACAAAAGAAAAAGCGTTTATTAGAAATGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAGCGAGAAAGACTCGAACGCCAACAAAAGAAAAAGCGTTTATTAGAAATGA  2368

Query 2369  AGACTGAGGGTGATGAGACAGGAGTGATGGATAATCTGCTGGAGGCCTTGCAGTCCGGGGCTGCCTTCCGCGAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGACTGAGGGTGATGAGACAGGAGTGATGGATAATCTGCTGGAGGCCTTGCAGTCCGGGGCTGCCTTCCGCGAC  2442

Query 2443  AGAAGAAAAAGGACACCGATGCCAAAAGATGTTCGGCAGAGTCTCAGTCCAATGTCTCAGAGGCCTGTTCTGAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGAAGAAAAAGGACACCGATGCCAAAAGATGTTCGGCAGAGTCTCAGTCCAATGTCTCAGAGGCCTGTTCTGAA  2516

Query 2517  AGTTTGTAACCATGGTAATAAACCGTATTTA  2547
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGTTTGTAACCATGGTAATAAACCGTATTTA  2547