Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04460
- Subject:
- NM_172673.3
- Aligned Length:
- 1731
- Identities:
- 1403
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGTCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA 74
Query 75 CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTCCTTTGCCACCACC 148
Query 149 TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT 222
||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 149 TGAACCTACTTGAGAAAGACTACTTTGGGATTCGTTTTGTGGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGTTGGAGTTT 222
Query 223 ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC 296
||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 223 ACAAAGTCAGTGGTGAAGCAGCTGAGATCCCAGCCTCCGTTCACCATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC 296
Query 297 AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG 370
.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG 370
Query 371 GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 444
||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT 444
Query 445 GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA 517
||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA 517
Query 518 GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA 591
.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 518 AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA 591
Query 592 AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT 665
||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 592 AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT 665
Query 666 GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGGAATGAGGTGA 739
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGGAATGAGGTGA 739
Query 740 CCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAATTATTCTTACA 813
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 740 CCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAAGATTATTCTCACA 813
Query 814 TATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAGCCTTCTACAAGCT 887
||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAGCCTTCTACAAGCT 887
Query 888 GGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGGTTCCGATACAGTG 961
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGGTTCCGATACAGTG 961
Query 962 GCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAATACACAGAGCAGGG 1035
||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 962 GCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAATACACAGAGCAGGG 1035
Query 1036 ATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCAGGACCCGCAGAAG 1109
|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036 ATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCAGGACACGAAGAAG 1109
Query 1110 AGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACACCAGTGCGTTCCA 1183
||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1110 AGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACCCCAGTGCGGTCCT 1183
Query 1184 CTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCGAGTAGCTGTGATT 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1184 CTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACGTGTCGCTGTGATA 1257
Query 1258 GCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCCTGGAGCTGATGTT 1331
||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1258 GCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCCTGGAGCTGATGCT 1331
Query 1332 GCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCCAGCACCCCAACTG 1405
|||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1332 GCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCCAGCACCCCGACTG 1405
Query 1406 CTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCCCGAGGAGGAACAG 1479
|.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|.||||||
Sbjct 1406 CGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTCAGAGCAAGAACAG 1479
Query 1480 ---GTGAATAAGTTTGTTCT-AAGTGTCCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCA----------------TGGGACTC 1533
|||.| ||| |||.|.||.| .|||.| |.|| ||||
Sbjct 1480 AGAGTGCA---------TCTGAAGGGACCAC----AGCTAC-----AGCAGCAGCAGTGGAAGGGGTGGG---- 1531
Query 1534 CTCTTTGTTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTGACATTGCCTTTTTCCGTGATATCCG 1607
|| .||||||.|| ||||
Sbjct 1532 ------GT----------------------------AAGTCTGTCC---------CCTT--------------- 1547
Query 1608 CCAGACCCCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCC 1681
||||
Sbjct 1548 --AGAC-------------------------------------------------------------------- 1551
Query 1682 GCTCAGTGGTGAGCCTGCTCATTGACACC 1710
Sbjct 1552 ----------------------------- 1551