Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04738
• Subject: XM_005269525.5
• Aligned Length: 1011
• Identities: 983
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGTCCCTGGAACAGGAGGAGGAAACGCAACCTGGGCGGCTCCTAGGACGCAGAGACGCCGTCCCCGCCTTCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGGAACAGGAGGAGGAAACGCAACCTGGGCGGCTCCTAGGACGCAGAGACGCCGTCCCCGCCTTCAT  74

Query   75  TGAGCCCAACGTGCGCTTCTGGATCACCGAGCGCCAATCCTTTATTCGACGATTTCTTCAATGGACAGAATTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGCCCAACGTGCGCTTCTGGATCACCGAGCGCCAATCCTTTATTCGACGATTTCTTCAATGGACAGAATTAT  148

Query  149  TAGATCCTACAAATGTGTTCATTTCAGTTGAAAGTATAGAAAACTCGAGGCAACTATTGTGCACAAATGAAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGATCCTACAAATGTGTTCATTTCAGTTGAAAGTATAGAAAACTCGAGGCAACTATTGTGCACAAATGAAGAT  222

Query  223  GTTTCCAGCCCTGCCTCGGCGGACCAAAGGATACAAGAAGCTTGGAAGCGGAGTCTTGCAACAGTGCATCCCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||                           |||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTTCCAGCCCTGCCTCGGCGGACCAAAGG---------------------------GCAACAGTGCATCCCGA  269

Query  297  CAGCAGCAACCTGATCCCCAAGCTTTTTCGACCTGCAGCGTTCCTGCCTTTCATGGCGCCCACGGTATTTTTGT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  270  CAGCAGCAACCTGATCCCCAAGCTTTTTCGACCTGCAGCGTTCCTGCCTTTCATGGCACCCACGGTATTTTTGT  343

Query  371  CAATGACGCCACTGAAAGGGATCAAGTCCGTGATTTTACCTCAGGTTTTCCTCTGTGCCTACATGGCAGCGTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  CAATGACGCCACTGAAAGGGATCAAGTCCGTGATTTTACCTCAGGTTTTCCTCTGTGCCTACATGGCAGCGTTC  417

Query  445  AACAGCATCAATGGAAACAGAAGTTACACTTGTAAGCCACTAGAAAGATCATTACTAATGGCGGGAGCCGTTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  AACAGCATCAATGGAAACAGAAGTTACACTTGTAAGCCACTAGAAAGATCATTACTAATGGCGGGAGCCGTTGC  491

Query  519  TTCTTCAACTTTCTTAGGAGTAATCCCTCAGTTTGTCCAGATGAAGTATGGCCTGACTGGCCCTTGGATTAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  TTCTTCAACTTTCTTAGGAGTAATCCCTCAGTTTGTCCAGATGAAGTATGGCCTGACTGGCCCTTGGATTAAAA  565

Query  593  GACTCTTACCTGTGATCTTCCTCGTGCAAGCCAGTGGAATGAATGTCTACATGTCCCGAAGTCTTGAATCCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  GACTCTTACCTGTGATCTTCCTCGTGCAAGCCAGTGGAATGAATGTCTACATGTCCCGAAGTCTTGAATCCATT  639

Query  667  AAGGGGATTGCGGTCATGGACAAGGAAGGCAATGTCCTGGGTCATTCCAGAATTGCTGGGACAAAGGCTGTTAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  AAGGGGATTGCGGTCATGGACAAGGAAGGCAATGTCCTGGGTCATTCCAGAATTGCTGGGACAAAGGCTGTTAG  713

Query  741  AGAAACGCTAGCATCCAGAATAGTGCTGTTTGGGACCTCAGCTCTGATTCCTGAAGTCTTCACCTACTTTTTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  AGAAACGCTAGCATCCAGAATAGTGCTGTTTGGGACCTCAGCTCTGATTCCTGAAGTCTTCACCTACTTTTTTA  787

Query  815  AAAGGACCCAGTATTTCAGGAAAAACCCAGGGTCATTGTGGATTTTGAAACTGTCTTGTACTGTCCTGGCAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  AAAGGACCCAGTATTTCAGGAAAAACCCAGGGTCATTGTGGATTTTGAAACTGTCTTGTACTGTCCTGGCAATG  861

Query  889  GGACTGATGGTGCCATTTTCTTTTAGTATATTTCCACAGATTGGACAGATACAGTACTGTAGTCTTGAAGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GGACTGATGGTGCCATTTTCTTTTAGTATATTTCCACAGATTGGACAGATACAGTACTGTAGTCTTGAAGAGAA  935

Query  963  AATTCAGTCTCCAACAGAAGAAACAGAAATCTTTTATCACAGAGGGGTG  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  AATTCAGTCTCCAACAGAAGAAACAGAAATCTTTTATCACAGAGGGGTG  984