Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04772
• Subject: NM_001321678.2
• Aligned Length: 1108
• Identities: 790
• Gaps: 314

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA  148
                                               ||  ||||                     |||||     
Sbjct    1  -----------------------------------AT--GGGA---------------------TATAT-----  11

Query  149  GGAACTC---CCTGACATC----CTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCT  215
                 ||   |.||.|.||    |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  -----TCAGTCATGGCGTCCGAACTTTCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCT  80

Query  216  GCACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTG  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   81  GCACTCAAATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTG  154

Query  290  ACAATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAAC  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  ACAATGCCTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAAC  228

Query  364  CAACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTT  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  CAACTGCAATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTT  302

Query  438  GCTAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGT  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  GCTAACTTTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGT  376

Query  512  ATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTG  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  ATGTGCCGCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTG  450

Query  586  CCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCC  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451  CCACTTGATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCC  524

Query  660  ATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  ATCTTATCTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGC  598

Query  734  TTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCAC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  TTTCCTTTTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCAC  672

Query  808  GTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAAGATTTGAACTT  881
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  673  GTCCTCCCTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCTGAAA-----------  735

Query  882  TCTGTCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTA  955
                                                                                      
Sbjct  736  --------------------------------------------------------------------------  735

Query  956  GTGAGCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAG  1029
                                                                                      
Sbjct  736  --------------------------------------------------------------------------  735

Query 1030  TGGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT  1101
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  736  -GGAAGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGC-----  801