Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04834
• Subject: NM_001163170.1
• Aligned Length: 1011
• Identities: 914
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGACTATGCGAGCGCAGCGGCTGCAGCCTGGTGTGGGCACCAGCGGGAGGGGCACTCTCCGAGCGCTGCG  74
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||..|.|.|||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACGATGCGAGCACAGCGGCTGCAGCCCGGTGTAGGCGTCGGTGGGAGAGGCACTTTGCGAGCGCTGCG  74

Query   75  GCCCGGAGTGACTGGGGCCGCGGCTGCCACCGCCACACCCCCTGCGGGCCCCCCGCCTGCCCCGCCGCCTCCCG  148
            |||.||.|||||.||||||.||.||..|.|||||||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  GCCAGGGGTGACCGGGGCCCCGACTAGCGCCGCCACACCCCCCGTGGGCCCGCCGCCCGCCCCGCCGCCCCCCG  148

Query  149  CACCGCCCCCGCCGCCGCTGCTCCTGTCTGGGGCCCCAGGACTACCCCTGCCCCCCGGCGCCGCCGGCAGCCCG  222
            |.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  CCCCGCCCCCGCCTCCGCTGCTTCTGGCTGGGGCCCCCGGGCTGCCCCTGCCCCCCGGCGCCGCGGGTAGCCCT  222

Query  223  GCAGTGCTGCGAGAGGCCGTGGAGGCCGTGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTATGGCCGAGTGAA  296
            ||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  GCGGTGCTGCGCGAGGCTGTGGAGGCGGTGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTACGGTCGAGTGAA  296

Query  297  TGTGGTGGAGGCACTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAGCAGTCCCGTGGTGCTGACTTAAAGAATGGGGCTCTAG  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  297  TGTGGTGGAGGCCCTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAACAGTCTCGGGGCGCTGACTTGAAGAACGGGGCTCTGG  370

Query  371  TGGTTTATGAGATGGTTCCCTCCAACAGCCCTCCTTATGTCTGCTATGTCACCCTGCCTGGGGGAAGCTGCTTT  444
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TGGTGTACGAGATGGTCCCCTCCAACAGCCCTCCCTACGTCTGCTATGTCACTCTGCCTGGGGGGAGCTGCTTC  444

Query  445  GGGAGTTTCCAGTTTTGCCCCACAAAAGCTGAGGCCCGGAGGAGTGCTGCAAAGATTGCGCTAATGAATTCTGT  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||..|||||||.|||||
Sbjct  445  GGGAGTTTCCAGTTTTGTCCCACAAAAGCTGAGGCCCGGCGAAGTGCTGCAAAGATTGCATTAATGAACTCTGT  518

Query  519  GTTTAATGAACATCCTTCCCGAAGAATCACTGATGAGTTCATCGAGAAGAGTGTCTCTGAGGCCCTGGCATCTT  592
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTAATGAGCATCCATCCCGAAGAATTACTGATGAGTTTATTGAGAAGAGTGTCTCAGAGGCCCTGGCATCTT  592

Query  593  TTAATGGCAACAGGGAGGAAGCTGACAACCCAAATACAGGGATTGGTGCCTTCCGATTCATGCTGGAATCCAAC  666
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  593  TCAATGGTAACAGAGAGGAAGCTGACAACCCAAATACGGGGATTGGTGCCTTCCGATTCATGTTGGAATCTAAC  666

Query  667  AAGGGCAAATCAATGTTGGAGTTCCAGGAGCTAATGACAGTTTTTCAACTGCTACACTGGAATGGCAGCCTTAA  740
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGCAAGTCAATGCTGGAGTTCCAGGAGCTGATGACAGTTTTTCAGCTGCTGCACTGGAATGGCAGCCTTAA  740

Query  741  GGCCATGAGGGAACGACAATGCTCTCGGCAGGAGGTGTTGGCTCATTATTCGCACCGGGCCCTGGATGATGATA  814
            |||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCATGAGGGAAAGACAGTGCTCTCGACAGGAGGTGTTGGCTCATTATTCACATCGGGCCCTGGATGATGATA  814

Query  815  TTCGCCACCAAATGGCCTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAGAGTGTGCCGGGGGCACTGTCTAGAGAGCTGGCC  888
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TTCGCCACCAAATGGCTTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAGAGTGTGCCAGGGGCACTGTCAAGAGAGCTGGCT  888

Query  889  TCTACTGAGCGGGAGCTGGATGAAGCCCGACTGGCAGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGAAAGATAT  962
            ||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCACTGAACGGGAACTCGATGAAGCCCGGCTGGCGGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGAAAGATAT  962

Query  963  TCTTGTGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCCAACTGC  1011
            |||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  TCTCATGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCCAGCTGC  1011