Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04898
• Subject: XM_011535462.3
• Aligned Length: 848
• Identities: 702
• Gaps: 121

Alignment

Query   1  ATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGC  74

Query  75  ACAACAGCCGCTCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACAACAGCCGCTCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAA  148

Query 149  ACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTGCAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTGCAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAA  222

Query 223  TTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATTCGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGGTAGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATTCGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGGTAGA  296

Query 297  AATTGAGAAGCTGGATTACCATCATTATCTGCCTCTGTTTTTTGATGGGCTTTGTGAAATGACATTTCCCTATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATTGAGAAGCTGGATTACCATCATTATCTGCCTCTGTTTTTTGATGGGCTTTGTGAAATGACATTTCCCTATG  370

Query 371  AGTTTTTTGCTCGGCAAGGAATCCACGACATGCTGGAACACGGTGGGAACAAGATCCTACCTGTCCTTCCACAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGTTTTTTGCTCGGCAAGGAATCCACGACATGCTGGAACACGGTGGGAACAAGATCCTACCTGTCCTTCCACAG  444

Query 445  CTCATTATCCCGATAAAAAATGCCTTGAACCTCCGAAACCGACAGGTCATCTGTGTCACTCTCAAGGTCCTCCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTCATTATCCCGATAAAAAATGCCTTGAACCTCCGAAACCGACAGGTCATCTGTGTCACTCTCAAGGTCCTCCA  518

Query 519  GCATCTGGTTGTGTCAGCTGAGATGGTGGGCAAGGCCTTGGTGCCTTATTACCGTCAAATCCTCCCTGTCCTGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GCATCTGGTTGTGTCAGCTGAGATGGTGGGCAAGGCCTTGGTGCCTTATTACCGTCAAATCCTCCCTGTCCTGA  592

Query 593  ACATCTTTAAGAATATGAATG---TGAA--------CTCCGGAGACGGCATTGACTACAGCC--AGCAGAAG--  651
           |||||||||||||||||||||   ||||        .|||..|||       ||.|.|.|||  || |||||  
Sbjct 593  ACATCTTTAAGAATATGAATGTCTTGAAGCTGTTGCATCCAAAGA-------GAGTGCTGCCAAAG-AGAAGTT  658

Query 652  -------AGGGAGAACATTGGGGACTTGATCCAGGAGACACTGGAGGCCTTCGAGCGCTA------CGGAGGAG  712
                  |||        ||..|.|.|||.|      |||        ||||.|...|||      |       
Sbjct 659  TAACCACAGG--------TGCCGCCCTGACC------ACA--------CTTCCAAGACTATCTCCTC-------  703

Query 713  AAAATG--------CCTT-TATCA-ACATTAAGTACGTG------------------GTCCCAACCT----ACG  754
              |||        |||| .|||| ||||| .|..||||                  ||||.|   |    |.|
Sbjct 704  ---ATGTGGGTTCTCCTTACATCATACATT-TGACCGTGAAACCCATGAAGACAGGCGTCCAA---TGGAGAGG  770

Query 755  AGTCTTG-------CTTGC---TAAAC-------  771
           |||.|||       |||.|   |..||       
Sbjct 771  AGTGTTGGAGGCCTCTTCCCTTTCCACATGGCCC  804