Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04966
• Subject: XM_005273782.3
• Aligned Length: 1144
• Identities: 990
• Gaps: 134

Alignment

Query    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74

Query   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148

Query  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222

Query  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296

Query  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370

Query  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444

Query  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518

Query  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCAGGCCCAGGGGACTCCGCC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCCGGCCCAGGGGACTCCGCC  592

Query  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666

Query  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740

Query  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814

Query  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888

Query  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGCTCCCCCTCCGGGGCTCCGCGGGACACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAG----------------------------  934

Query  963  GGATCTCCAGGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTCCTGCAAG-ACTGGTCCAGGCAC  1035
                                          |||||||.||            .|.|||| .||||    ||.||
Sbjct  935  ------------------------------GGAGCCCTCA------------TTTCAAGTCCTGG----GGTAC  962

Query 1036  CCCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGTTCTGTCAGAATCCAGCACCAC  1109
            ||               ||||              |.||.|||   |||    |||.||.|.|           
Sbjct  963  CC---------------TGTG--------------CGCAAACT---CCA----TCTATCTGGA-----------  989

Query 1110  TGTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTG  1143
             ||||.|...|.||.|||...||           
Sbjct  990  -GTGGTATATAGGCTGGAGGCAG-----------  1011