Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04966
• Subject: XM_011544771.1
• Aligned Length: 1199
• Identities: 1003
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74

Query   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148

Query  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222

Query  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296

Query  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370

Query  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444

Query  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518

Query  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCAGGCCCAGGGGACTCCGCC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCCGGCCCAGGGGACTCCGCC  592

Query  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  593  CCCTCGAGCTTCCT------------------------------------------------------------  606

Query  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740
                                                                              ||||||||
Sbjct  607  ------------------------------------------------------------------GAGCCCCC  614

Query  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  688

Query  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  762

Query  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGCTCCCCCTC----CGGGGCTCC-GCGGG  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....|||||    |..|  ||| |.||.
Sbjct  763  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGGGAGCCCTCATTTCAAG--TCCTGGGGT  834

Query  958  ACACTG-----GATCTCCA------------GGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTC  1014
            ||.|||     .|.|||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  ACCCTGTGCGCAAACTCCATCTATCTGGAGTGGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTC  908

Query 1015  CTGCAAGACTGGTCCAGGCACCCCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGT  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  CTGCAAGACTGGTCCAGGCACCCCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGT  982

Query 1089  TCTGTCAGAATCCAGCACCACTGTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTG-------------------  1143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  983  TCTGTCAGAATCCAGCACCACTGTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTGTAAATTCTTGCTTTCCTGG  1056

Query 1144  ---------------  1143
                           
Sbjct 1057  GGAGGGAGGGAGGGA  1071