Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04996
• Subject: NM_133237.3
• Aligned Length: 1551
• Identities: 1327
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGTCCTGGCCGCGCCGCCTCCTGCTCAGATACCTGTTCCCGGCCCTCCTGCTTCACGGGCTGGGAGAGGGTTC  74
            ||||||.|...|||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||.|.||.||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGTCCCGTGTGCGCCGCCTTCTGCTTGGATACCTGTTCCCAGCCCTCCTGTTGCATGGGCTGGGAGAGGGCTC  74

Query   75  TGCCCTCCTTCATCCAGACAGCAGGTCTCATCCTAGGTCCTTAGAGAAAAGTGCCTGGAGGGCTTTTAAGGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  TGCCCTCCTTCATCCAGACAGCAGATCGCACCCTCGGTCCTTAGAGAAAAGCGCCTGGAGGGCTTTCAAGGAGT  148

Query  149  CACAGTGCCATCACATGCTCAAACATCTCCACAATGGTGCAAGGATCACAGTGCAGATGCCACCTACAATCGAG  222
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  149  CACAGTGTCATCACATGCTGAAGCATCTCCACAACGGTGCGCGGATCACAGTGCAGATGCCCCCGACCATCGAG  222

Query  223  GGCCACTGGGTCTCCACAGGCTGTGAAGTAAGGTCAGGCCCAGAGTTCATCACAAGGTCCTACAGATTCTACCA  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct  223  GGCCACTGGGTGTCCACAGGCTGTGAAGTAAGGTCGGGTCCGGAGTTCATGACAAGGTCTTACAGGTTCTACAA  296

Query  297  CAATAACACCTTCAAGGCCTACCAATTTTATTATGGCAGCAACCGGTGCACAAATCCCACTTATACTCTCATCA  370
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  297  CAATAATACCTTCAAGGCCTACCAGTTTTACTATGGCAGCAACCGCTGTACAAACCCCACCTACACCCTCATCA  370

Query  371  TCCGGGGCAAGATCCGCCTCCGCCAGGCCTCCTGGATCATCCGAGGGGGCACGGAAGCCGACTACCAGCTGCAC  444
            ||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  TCCGAGGCAAGATCCGGCTTCGCCAGGCGTCCTGGATCATCCGTGGGGGCACCGAAGCTGACTACCAGCTTCAC  444

Query  445  AACGTCCAGGTGATCTGCCACACAGAGGCGGTGGCCGAGAAGCTCGGCCAGCAGGTGAACCGCACATGCCCGGG  518
            ..||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||..|||||.|||..|.|||||||||.||.|||||.||
Sbjct  445  GGCGTCCAAGTCATCTGCCACACAGAGGCAGTCGCTGAACAGCTCAGCCGACTGGTGAACCGAACTTGCCCAGG  518

Query  519  CTTCCTCGCAGACGGGGGTCCCTGGGTGCAGGACGTGGCCTATGACCTCTGGCGAGAGGAGAACGGCTGT----  588
            ||||||.||....||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||..|||||||      ||    
Sbjct  519  CTTCCTGGCTCCTGGTGGTCCCTGGGTACAGGACGTAGCCTATGACCTGTGGCAGGAGGAGA------GTAACC  586

Query  589  --GAGTGCACCAAGGCCGTGAACTTTGCCATGCATGAACTTCAGCTCATCCGGGTGGAGAAGCAGTACCTTCAC  660
              ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|..|||
Sbjct  587  ACGAGTGCACCAAGGCTGTGAACTTTGCCATGCACGAGCTGCAGCTCATCCGTGTGGAGAAGCAGTATCCCCAC  660

Query  661  CACAACCTCGACCACCTGGTCGAGGAGCTCTTCCTTGGTGACATTCACACTGATGCCACCCAGAGGATGTTCTA  734
            ||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||
Sbjct  661  CACAGCCTGGACCACCTGGTGGAGGAGCTCTTCCTGGGCGACATCCACACGGACGCTACCCAGAGGGTGTTCTA  734

Query  735  CCGGCCCTCCAGTTACCAGCCCCCTCTGCAGAATGCCAAGAACCACGACCATGCCTGCATCGCCTGTCGGATCA  808
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  735  CCGGCCGTCCAGTTACCAGCCGCCCCTGCAGAATGCCAAGAACCACAACCATGCGTGCATAGCCTGCCGCATCA  808

Query  809  TCTATCGGTCAGACGAGCACCACCCTCCCATCCTGCCCCCAAAGGCAGACCTGACCATCGGCCTGCACGGGGAG  882
            |.|..||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  809  TTTTCCGGTCAGATGAACACCACCCTCCCATACTGCCCCCCAAGGCTGACCTGACCATTGGCCTCCACGGGGAA  882

Query  883  TGGGTGAGCCAGCGCTGTGAGGTGCGCCCCGAAGTCCTCTTCCTCACCCGCCACTTCATCTTCCATGACAACAA  956
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  883  TGGGTGAGCCAGCGCTGCGAGGTACGCCCCGAGGTCCTCTTCCTCACCCGCCACTTCATCTTCCACGACAACAA  956

Query  957  CAACACCTGGGAGGGCCACTACTACCACTACTCAGACCCGGTGTGCAAGCACCCCACCTTCTCCATCTACGCCC  1030
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|
Sbjct  957  CAACACCTGGGAAGGGCATTACTACCACTACTCAGACCCTGTCTGCAAGCACCCCACATTCACCATCTACGCTC  1030

Query 1031  GGGGCCGCTACAGCCGCGGCGTCCTCTCGTCCAGGGTCATGGGAGGCACCGAGTTCGTGTTCAAAGTGAATCAC  1104
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GAGGCCGCTACAGCCGCGGTGTGCTCTCATCTAAGGTCATGGGTGGCACGGAGTTTGTGTTCAAAGTGAATCAC  1104

Query 1105  ATGAAGGTCACCCCCATGGATGCGGCCACAGCCTCACTGCTCAACGTCTTCAACGGGAATGAGTGCGGGGCCGA  1178
            ||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||..|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1105  ATGAAGGTTACTCCCATGGACGCAGCCACAGCCTCCCTCCTCAATGTCTTCAGTGGGAATGAGTGTGGGGCTGA  1178

Query 1179  GGGCTCCTGGCAGGTGGGCATCCAGCAGGATGTGACCCACACCAATGGCTGCGTGGCCCTGGGCATCAAACTAC  1252
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1179  GGGCTCCTGGCAGGTGGGTATCCAACAGGATGTGACACATACCAATGGCTGCGTGGCTCTGGGCATCAAACTAC  1252

Query 1253  CTCACACGGAGTACGAGATCTTCAAAATGGAACAGGATGCCCGGGGGCGCTATCTGCTGTTCAACGGTCAGAGG  1326
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1253  CTCACACAGAATATGAGATCTTCAAAATGGAGCAAGACACCCGAGGCCGCTACCTGCTGTTCAATGGCCAGAGG  1326

Query 1327  CCCAGCGACGGGTCCAGCCCAGACAGGCCAGAGAAGAGAGCCACGTCCTACCAGATGCCCTTGGTCCAGTGTGC  1400
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  CCCAGCGATGGCTCCAGCCCAGACAGACCAGAGAAGAGAGCCACATCCTACCAGATGCCCTTGGTCCAGTGTGC  1400

Query 1401  CTCCTCTTCGCCGAGGGCAGAGGACCTCGCAGAAGACAGTGGAAG--CAGCCTGTATGGCCGGGCCCCTGGGAG  1472
            |||.||.||.||.||.||.||.||..|....||||||||| .|||  || .|||||||||.||||..|.|||||
Sbjct 1401  CTCTTCCTCACCAAGAGCTGAAGAGTTGTTGGAAGACAGT-CAAGGTCA-TCTGTATGGCAGGGCAGCAGGGAG  1472

Query 1473  GCACACCT-GGTCCCTGCTGCTGGCTGCACTTGCCTGCCTTGTCCCTCTGCTGCATTGGAACATCCGCAGA  1542
            | |||.|| ||||||||.||||..||||..|||.|.|||||....||||.|..||||||..|||||.||||
Sbjct 1473  G-ACAGCTGGGTCCCTGTTGCTTCCTGCCTTTGTCAGCCTTTGGACTCTCCCACATTGGCGCATCCTCAGA  1542