Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05008
• Subject: NM_001044387.2
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1038
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGTCATCCTGCCCTCGACTGCTGCTCCGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCAAAAAGGACACAC  74
            ||||||||||||.||||||||.|.|||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGTCGTCCTGCCCCCAACTGCCGCTCTGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCGAGAAGGACACAC  74

Query   75  ACAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGACAAGCTGGCTACGGGGCTTGGTAACCTTCGAGGATGTGGCCG  148
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGAAAAGCTGGCTAAAGGGCTTGGTGACCTTTGAGGATGTGGCCG  148

Query  149  TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCGTTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGATGTGATGCTGGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCATTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGACGTGATGCTGGAG  222

Query  223  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||...|..|||.|||||||.||.|||||.||||||.||||.|||||..|
Sbjct  223  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTGGGGAACCAAGTTGATAAACCTAGGCTGATCTCCCAGCTGGAGCAAGAAGA  296

Query  297  GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT  370
            .||.|||.|||||||.||.|||||||||||..||.|.||||||||||||.||||||.||.|.|||||||||||.
Sbjct  297  TAAAGTGATGACAGAAGAGAGAGGAATTCTCTCAGGTACCTGTCCAGATGTGGAGAATCCATTTAAAGCCAAAG  370

Query  371  GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA  444
            ||||||||||||||..|.|||||||..||||||||||.||||.|..|.|.||||.|||.||.|.|||||.||||
Sbjct  371  GGTTAACTCCTAAGCTGCATGTTTTTCGAAAAGAACAATCTAGAAATATGAAAATGGAGAGGAATCATCTTGGA  444

Query  445  GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT  518
            |..|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||.||.|.|||||.||..||
Sbjct  445  GCAACACTCAACGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACAAAATCTTCCCTTACACGGCACAGGAAGAT  518

Query  519  TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGT------------------------------  562
            ||||||||||||||.||||||||.|||.|||.||||||||||.|                              
Sbjct  519  TCATACTGGAGAAAGACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAATCCTACAGCAGTAGATCTTACCTTGCTGTTC  592

Query  563  ------------------------------------------------------CCTTCAGTAGCAGATCTTAC  582
                                                                  |||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAGCAGATCTTAC  666

Query  583  CTTACTATTCATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGA  656
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||.|.||.||..|
Sbjct  667  CTTACTGTTCATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTACGAATGCAGTGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAA  740

Query  657  TCCCTCATCCCTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACG  730
            |.||||||.|||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||..|
Sbjct  741  TTCCTCATACCTCAGACCGCACTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCGTACAAATGTAACCAGTGTTTTCGTG  814

Query  731  TTTTCCGCAC-CAGTTGTAA-CCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATC  802
            ..|||||||| ||||  .|| |.|||.|||.||||||||..||||.|||||||||..|||..|||.||||||||
Sbjct  815  AGTTCCGCACTCAGT--CAATCTTCACAAGGCACAAGAGAGTTCATACGGGGGAGGGTCATTATGTATGTAATC  886

Query  803  AGTGTGGAAAAGCTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTAT  876
            ||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||..||..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||.
Sbjct  887  AGTGTGGAAAGGCTTTCGGCACGAGGTCATCTCTTTCTTCGCACTATAGCATTCATACAGGGGAGTACCCTTAC  960

Query  877  GAATGTCACGATTGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGA  950
            |||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||.||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  961  GAATGCCACGATTGTGGGAGAACCTTCAGGAGGAGGTCGAATCTGACACAGCACATAAGAACTCATACTGGAGA  1034

Query  951  AAAACCCTATGAATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATAC  1024
            |||||||||...||||||.|||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||..|.||||.||||||||
Sbjct 1035  AAAACCCTACACATGTAATGAGTGTGGGAAATCCTTTACCAATAGCTTTTCTCTTACAATTCACAGGAGAATAC  1108

Query 1025  ATACCGGAGAGAAACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACAC  1098
            |||..|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||..|||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 1109  ATAATGGAGAGAAATCCTATGAGTGCAGTGATTGTGGAAAATCCTTTAATGTTCTCTCATCCGTTAAGAAACAC  1182

Query 1099  TTAAGAACTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCT  1172
            .|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1183  ATGAGAACTCACACTGGAAAAAAACCCTATGAATGTAATTATTGCGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTACCT  1256

Query 1173  TTCTGTGCACAAGAGAATACATAATAG----ATGGATA  1206
            |||||||||.|.||||||.||||||||    |||    
Sbjct 1257  TTCTGTGCATACGAGAATGCATAATAGGCAAATG----  1290