Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05008
• Subject: NM_001044388.2
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1018
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGTCATCCTGCCCTCGACTGCTGCTCCGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCAAAAAGGACACAC  74
            ||||||||||||.||||||||.|.||||                     |.||||||||||.|.||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGTCGTCCTGCCCCCAACTG---------------------CCGCCTCTCAGCGAGAAGGACACAC  53

Query   75  ACAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGACAAGCTGGCTACGGGGCTTGGTAACCTTCGAGGATGTGGCCG  148
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   54  AGAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGAAAAGCTGGCTAAAGGGCTTGGTGACCTTTGAGGATGTGGCCG  127

Query  149  TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCGTTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGATGTGATGCTGGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  128  TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCATTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGACGTGATGCTGGAG  201

Query  223  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||...|..|||.|||||||.||.|||||.||||||.||||.|||||..|
Sbjct  202  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTGGGGAACCAAGTTGATAAACCTAGGCTGATCTCCCAGCTGGAGCAAGAAGA  275

Query  297  GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT  370
            .||.|||.|||||||.||.|||||||||||..||.|.||||||||||||.||||||.||.|.|||||||||||.
Sbjct  276  TAAAGTGATGACAGAAGAGAGAGGAATTCTCTCAGGTACCTGTCCAGATGTGGAGAATCCATTTAAAGCCAAAG  349

Query  371  GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA  444
            ||||||||||||||..|.|||||||..||||||||||.||||.|..|.|.||||.|||.||.|.|||||.||||
Sbjct  350  GGTTAACTCCTAAGCTGCATGTTTTTCGAAAAGAACAATCTAGAAATATGAAAATGGAGAGGAATCATCTTGGA  423

Query  445  GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT  518
            |..|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..|||.||.|.|||||.||..||
Sbjct  424  GCAACACTCAACGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACAAAATCTTCCCTTACACGGCACAGGAAGAT  497

Query  519  TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGT------------------------------  562
            ||||||||||||||.||||||||.|||.|||.||||||||||.|                              
Sbjct  498  TCATACTGGAGAAAGACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAATCCTACAGCAGTAGATCTTACCTTGCTGTTC  571

Query  563  ------------------------------------------------------CCTTCAGTAGCAGATCTTAC  582
                                                                  |||||||.||||||||||||
Sbjct  572  ATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAGCAGATCTTAC  645

Query  583  CTTACTATTCATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGA  656
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||.|.||.||..|
Sbjct  646  CTTACTGTTCATAAGAGAATCCACAATGGGGAGAAACCCTACGAATGCAGTGACTGTGGGAAAACCTTCAGCAA  719

Query  657  TCCCTCATCCCTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACG  730
            |.||||||.|||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||..|
Sbjct  720  TTCCTCATACCTCAGACCGCACTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCGTACAAATGTAACCAGTGTTTTCGTG  793

Query  731  TTTTCCGCAC-CAGTTGTAA-CCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATC  802
            ..|||||||| ||||  .|| |.|||.|||.||||||||..||||.|||||||||..|||..|||.||||||||
Sbjct  794  AGTTCCGCACTCAGT--CAATCTTCACAAGGCACAAGAGAGTTCATACGGGGGAGGGTCATTATGTATGTAATC  865

Query  803  AGTGTGGAAAAGCTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTAT  876
            ||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||..||..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||.
Sbjct  866  AGTGTGGAAAGGCTTTCGGCACGAGGTCATCTCTTTCTTCGCACTATAGCATTCATACAGGGGAGTACCCTTAC  939

Query  877  GAATGTCACGATTGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGA  950
            |||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||.||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  940  GAATGCCACGATTGTGGGAGAACCTTCAGGAGGAGGTCGAATCTGACACAGCACATAAGAACTCATACTGGAGA  1013

Query  951  AAAACCCTATGAATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATAC  1024
            |||||||||...||||||.|||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||..|.||||.||||||||
Sbjct 1014  AAAACCCTACACATGTAATGAGTGTGGGAAATCCTTTACCAATAGCTTTTCTCTTACAATTCACAGGAGAATAC  1087

Query 1025  ATACCGGAGAGAAACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACAC  1098
            |||..|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||..|||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 1088  ATAATGGAGAGAAATCCTATGAGTGCAGTGATTGTGGAAAATCCTTTAATGTTCTCTCATCCGTTAAGAAACAC  1161

Query 1099  TTAAGAACTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCT  1172
            .|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1162  ATGAGAACTCACACTGGAAAAAAACCCTATGAATGTAATTATTGCGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTACCT  1235

Query 1173  TTCTGTGCACAAGAGAATACATAATAG----ATGGATA  1206
            |||||||||.|.||||||.||||||||    |||    
Sbjct 1236  TTCTGTGCATACGAGAATGCATAATAGGCAAATG----  1269