Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05008
- Subject:
- NM_001304350.1
- Aligned Length:
- 1206
- Identities:
- 993
- Gaps:
- 213
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGTCATCCTGCCCTCGACTGCTGCTCCGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCAAAAAGGACACAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGACAAGCTGGCTACGGGGCTTGGTAACCTTCGAGGATGTGGCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCGTTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGATGTGATGCTGGAG 222
|||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATGCTGGAG 9
Query 223 AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA 83
Query 297 GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT 157
Query 371 GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA 231
Query 445 GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT 305
Query 519 TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGTCCTTCAGTAGCAGATCTTACCTTACTATTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGTCCTTCAGTAGCAGATCTTACCTTACTATTC 379
Query 593 ATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGATCCCTCATCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 ATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGATCCCTCATCC 453
Query 667 CTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACGTTTTCCGCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 CTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACGTTTTCCGCAC 527
Query 741 CAGTTGTAACCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATCAGTGTGGAAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 CAGTTGTAACCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATCAGTGTGGAAAAG 601
Query 815 CTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTCACGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 CTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTCACGAT 675
Query 889 TGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 TGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGA 749
Query 963 ATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATACATACCGGAGAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 ATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATACATACCGGAGAGA 823
Query 1037 AACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACACTTAAGAACTCAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 AACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACACTTAAGAACTCAC 897
Query 1111 ACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCTTTCTGTGCACAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 ACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCTTTCTGTGCACAA 971
Query 1185 GAGAATACATAATAGATGGATA 1206
||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 GAGAATACATAATAGATGGATA 993