Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05008
• Subject: XM_011527703.2
• Aligned Length: 1206
• Identities: 993
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGTCATCCTGCCCTCGACTGCTGCTCCGTCTTCCCTGTTCCCAGCCTCTCAGCAAAAAGGACACAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACAGGGCGGAGAGCTGGTTAATGAGCTCCTGACAAGCTGGCTACGGGGCTTGGTAACCTTCGAGGATGTGGCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGAGTTCACCCAGGAGGAGTGGGCGTTGCTGGACCCTGCCCAAAGGACACTGTACAGGGATGTGATGCTGGAG  222
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATGCTGGAG  9

Query  223  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   10  AACTGCAGGAACCTGGCCTCACTAGGGTGTCGTGTTAATAAACCCAGTCTGATATCCCAGTTGGAACAAGACAA  83

Query  297  GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  GAAGGTGGTGACAGAGGAAAGAGGAATTCTACCAAGCACCTGTCCAGATTTGGAGACTCTACTTAAAGCCAAAT  157

Query  371  GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  GGTTAACTCCTAAGAAGAATGTTTTCAGAAAAGAACAGTCTAAAGGTGTAAAAACGGAAAGAAGTCATCGTGGA  231

Query  445  GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  GTGAAACTCAATGAATGTAATCAGTGTTTTAAAGTCTTCAGCACGAAATCTAACCTAACTCAGCACAAGAGAAT  305

Query  519  TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGTCCTTCAGTAGCAGATCTTACCTTACTATTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  TCATACTGGAGAAAAACCCTATGACTGTAGTCAATGTGGGAAGTCCTTCAGTAGCAGATCTTACCTTACTATTC  379

Query  593  ATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGATCCCTCATCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  ATAAGAGAATCCATAATGGGGAGAAACCCTATGAATGCAATCACTGTGGGAAAGCATTTAGTGATCCCTCATCC  453

Query  667  CTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACGTTTTCCGCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  CTTAGACTGCATTTGAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTTTTCACGTTTTCCGCAC  527

Query  741  CAGTTGTAACCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATCAGTGTGGAAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  CAGTTGTAACCTCAAAAGCCACAAGAGGATTCACACGGGGGAGAATCACCATGAATGTAATCAGTGTGGAAAAG  601

Query  815  CTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTCACGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  CTTTCAGCACAAGGTCCTCTCTCACTGGGCACAATAGCATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGTCACGAT  675

Query  889  TGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  TGTGGGAAAACCTTCAGGAAGAGCTCCTATCTGACACAGCACGTAAGAACTCATACTGGAGAAAAACCCTATGA  749

Query  963  ATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATACATACCGGAGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  ATGTAACGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCAGTAGCTTTTCTCTTACTGTGCACAAGAGAATACATACCGGAGAGA  823

Query 1037  AACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACACTTAAGAACTCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  AACCCTACGAGTGCAGTGACTGTGGAAAAGCCTTTAATAATCTCTCAGCTGTGAAGAAACACTTAAGAACTCAC  897

Query 1111  ACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCTTTCTGTGCACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  ACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATCATTGTGGGAAATCCTTCACAAGTAACTCCTATCTTTCTGTGCACAA  971

Query 1185  GAGAATACATAATAGATGGATA  1206
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct  972  GAGAATACATAATAGATGGATA  993