Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05019
- Subject:
- XM_006711749.3
- Aligned Length:
- 1769
- Identities:
- 1487
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC 74
Query 75 CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTC 148
Query 149 ACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGG 222
Query 223 ATGAGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGAGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTG 296
Query 297 TGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAAGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATC 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAGGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATC 370
Query 371 AGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCCGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCCGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGT 444
Query 445 TTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAG 518
Query 519 GAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCT 592
Query 593 GTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACA 666
Query 667 ATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGG 740
Query 741 GGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTG 814
Query 815 CAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTT 888
Query 889 ATTGATCATATAAGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGATCATATAAGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGT 962
Query 963 TTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAA 1036
Query 1037 CAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATT 1110
Query 1111 GTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGG 1184
Query 1185 AAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCA 1258
Query 1259 AGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGC 1332
Query 1333 ATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGG 1406
Query 1407 AATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATC 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1407 AATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTG------TC 1474
Query 1481 CTTGTCGATGTCA-----AGCAAGA------------------------------------------------- 1500
|| || .||| |||||||
Sbjct 1475 CT----GA-CTCAAAACTAGCAAGAGAAGACTGCCTTCAAATACTTCAAATGTTTTCCCCGAGTGTCACCTTTG 1543
Query 1501 -------------------------------------------------------------------------- 1500
Sbjct 1544 GTAACAGTTCTCTTTCTGCGCTGACAGAAACCTGGTGCCACCTGAGACACGATCCACAGGACACTTCTCACGTT 1617
Query 1501 -------------------------------------------------------------------------- 1500
Sbjct 1618 TCCACCAGACCGTGCAGTGCCAGGCTGGGTGCTCAGTACCATACTGCAAACCAGTTCCTAGGCCTGGACCACAG 1691
Query 1501 ------------------------------------------------------------------- 1500
Sbjct 1692 CCTCCACAGGAGAGGAGGAAAGCAGTACTTTTTTCCTGCTCTAGGCCAAACAGTGACAACATTTCTC 1758