Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05039
• Subject: XM_011529927.2
• Aligned Length: 1821
• Identities: 1758
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74

Query   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148

Query  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222

Query  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296

Query  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  370

Query  371  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  444

Query  445  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  518

Query  519  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  592

Query  593  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  666

Query  667  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  740

Query  741  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  814

Query  815  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  888

Query  889  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  962

Query  963  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  1036

Query 1037  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  1110

Query 1111  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1184

Query 1185  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 1185  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGG----------------------------------------  1218

Query 1259  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1332
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  -----------------------GCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1269

Query 1333  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1343

Query 1407  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1417

Query 1481  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1491

Query 1555  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1565

Query 1629  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1639

Query 1703  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1713

Query 1777  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1821
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1758