Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05039
• Subject: XM_011529928.2
• Aligned Length: 1821
• Identities: 1578
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTTCAGGAGACAAGTGAAAAACTTTGTGAAAAATTACTCAGATGCTGAAATAAAAGTCAGGGAAGCAAC  74

Query   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTAACGACCCTTGGGGTCCCTCTAGTTCTCTGATGTTAGATATCAGTGACTTGACTTTCAACACAATTTCTC  148

Query  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCAGAGATTATGAATATGCTGTGGCACAGACTCAATGACCATGGGAAGAACTGGCGCCACGTGTATAAATCC  222

Query  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTACCCTAATGGATTATCTCATCAAGAATGGATCAAAGAAAGTTATTCAGCATTGCAGAGAGGGGTTCTGTAA  296

Query  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAGGTTATTATATCCGGGAAAAAT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  297  CCTTCAAACACTAAAAGATTTTCAGCACATAGATGAAGCTGGAAAAGACCAAG---------------------  349

Query  371  CTAAGCAAGTCATCACATTGCTGATGGATGAACCATTGCTGTGTAAAGAGAGGGAAGTGGCATGTCGGACTAGA  444
                                                                                      
Sbjct  350  --------------------------------------------------------------------------  349

Query  445  CAGCGTACCTCCCACTCTATATTGTTTTCTAAAAGACAACTTGGTTCAAGTAACTCACTGACAGCGTGCACTTC  518
                                                                                      
Sbjct  350  --------------------------------------------------------------------------  349

Query  519  TGCCCCCACACCGGATATTTCTGCTTCAGAGAAGAAGTATAAGCTTCCTAAGTTTGGAAGGTTACATAATAAAA  592
                                                                                      
Sbjct  350  --------------------------------------------------------------------------  349

Query  593  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  GAAATGTGTGCAAGGCAGGATTGAAACAAGAGCATTGCCAAGATGTTCATTTGCCTACAGAAACTATGTTGTCC  423

Query  667  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CAGGAAACACTTCCACTCAAGATTCATGGTTGGAAATCAACAGAGGACCTGATGACATTTTTGGATGATGATCC  497

Query  741  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AGAGCTGCCTTTACTAGCAACACCTCCTTCCATTGTCTCTCCAATCACTTGCTTGTCAGAAGCAGAAGAAGTTT  571

Query  815  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  GTAATCTTTCGGGTGCAGATGCTGTGCCTACTCTCTCAGAAAATAGTCCTTCTGGGCAGAGAGATGTGAGTTTG  645

Query  889  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  GACAAGAGATCAGATGGTATCTTTACAAATACTGTCACAGAAAACCTCTTGGAAACACCTTTAGAAAAGCAATC  719

Query  963  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  AGCTGCAGAAGGTCTTAAAACATTGACAATTTTACCAGCATGTTGGTCAAGTAAAGAGGAGTTTATCAGCCCCG  793

Query 1037  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  ACTTAAGGGTATCAAAGTCAGATTCTACTTTCCATAACCAGGCCTCTGTAGAAACACTCTGTCTCTCTCCCTCA  867

Query 1111  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  TTCAAAATATTTGACCGAGTGAAGGAGATTGTAATCAACAAGGCCTACCAGAAACCAGCACAATCCAGCATTCA  941

Query 1185  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GATGGATGATAAAATCCTCAAGACAACCACACGGGTTTCAACTGCTTCTGAGGGAGCATCTTCCTTTTCTCCTT  1015

Query 1259  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  TATCCATGTCATCTCCTGATTTAGCCTCTCCAGAGAAGTCAGCTCATCTCTTATCACCAATTCTGGCCGGACCT  1089

Query 1333  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  TCCTTCTGGACTCTGTCCCATCAACAGTTGTCTTCTACCTCCTTTAAAGATGAAGATAAGACAGCCAAGCTGCA  1163

Query 1407  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  TCACTCCTTTGCTTCTAGGGGCCCAGTGTCTTCTGATGTAGAGGAAAATGATAGCCTCAATCTACTGGGAATTC  1237

Query 1481  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  TTCCAAATAACTCTGATTCTGCTAAAAAGAATATAAGTCACATTTCTAGTAGTCACTGGGGGGAGTTTTCCACC  1311

Query 1555  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  CAAAATGTAGACCAGTTCATCCCTCTGTCCTGTTCTGGTTTTCAGTCAACCAAAGACTTCCCCCAGGAACCTGA  1385

Query 1629  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  AGCAAAGAATTCCATTAGTGTTCTTTTAAGGGAGGTAAAACGTGCGATCGCTAGATTACATGAAGATCTGAGCA  1459

Query 1703  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  CAGTGATCCAAGAACTTAATGTCATCAATAACATCTTGATGAGCATGAGTCTGAATAGTTCACAAATAAGCCAG  1533

Query 1777  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1821
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  TCTTCCCAGGTCCCCCAGTCTTCTGAGGGGAGCTCAGATCAGATC  1578