Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05075
• Subject: XM_005271904.4
• Aligned Length: 1608
• Identities: 1131
• Gaps: 477

Alignment

Query    1  ATGCTACTGCTGTGGGTGTCGGTGGTCGCAGCCTTGGCGCTGGCGGTACTGGCCCCCGGAGCAGGGGAGCAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGGAGAGCAGCCAAAGCGCCCAATGTGGTGCTGGTCGTGAGCGACTCCTTCGATGGAAGGTTAACATTTCATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGGAAGTCAGGTAGTGAAACTTCCTTTTATCAACTTTATGAAGACACGTGGGACTTCCTTTCTGAATGCCTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACAAACTCTCCAATTTGTTGCCCATCACGCGCAGCAATGTGGAGTGGCCTCTTCACTCACTTAACAGAATCTTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAATAATTTTAAGGGTCTAGATCCAAATTATACAACATGGATGGATGTCATGGAGAGGCATGGCTACCGAACAC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGAAATTTGGGAAACTGGACTATACTTCAGGACATCACTCCATTAGTAATCGTGTGGAAGCGTGGACAAGAGAT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GTTGCTTTCTTACTCAGACAAGAAGGCAGGCCCATGGTTAATCTTATCCGTAACAGGACTAAAGTCAGAGTGAT  518
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGTTAATCTTATCCGTAACAGGACTAAAGTCAGAGTGAT  41

Query  519  GGAAAGGGATTGGCAGAATACAGACAAAGCAGTAAACTGGTTAAGAAAGGAAGCAATTAATTACACTGAACCAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  GGAAAGGGATTGGCAGAATACAGACAAAGCAGTAAACTGGTTAAGAAAGGAAGCAATTAATTACACTGAACCAT  115

Query  593  TTGTTATTTACTTGGGATTAAATTTACCACACCCTTACCCTTCACCATCTTCTGGAGAAAATTTTGGATCTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TTGTTATTTACTTGGGATTAAATTTACCACACCCTTACCCTTCACCATCTTCTGGAGAAAATTTTGGATCTTCA  189

Query  667  ACATTTCACACATCTCTTTATTGGCTTGAAAAAGTGTCTCATGATGCCATCAAAATCCCAAAGTGGTCACCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  ACATTTCACACATCTCTTTATTGGCTTGAAAAAGTGTCTCATGATGCCATCAAAATCCCAAAGTGGTCACCTTT  263

Query  741  GTCAGAAATGCACCCTGTAGATTATTACTCTTCTTATACAAAAAACTGCACTGGAAGATTTACAAAAAAAGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  GTCAGAAATGCACCCTGTAGATTATTACTCTTCTTATACAAAAAACTGCACTGGAAGATTTACAAAAAAAGAAA  337

Query  815  TTAAGAATATTAGAGCATTTTATTATGCTATGTGTGCTGAGACAGATGCCATGCTTGGTGAAATTATTTTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  TTAAGAATATTAGAGCATTTTATTATGCTATGTGTGCTGAGACAGATGCCATGCTTGGTGAAATTATTTTGGCC  411

Query  889  CTTCATCAATTAGATCTTCTTCAGAAAACTATTGTCATATACTCCTCAGACCATGGAGAGCTGGCCATGGAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  CTTCATCAATTAGATCTTCTTCAGAAAACTATTGTCATATACTCCTCAGACCATGGAGAGCTGGCCATGGAACA  485

Query  963  TCGACAGTTTTATAAAATGAGCATGTACGAGGCTAGTGCACATGTTCCGCTTTTGATGATGGGACCAGGAATTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  TCGACAGTTTTATAAAATGAGCATGTACGAGGCTAGTGCACATGTTCCGCTTTTGATGATGGGACCAGGAATTA  559

Query 1037  AAGCCGGCCTACAAGTATCAAATGTGGTTTCTCTTGTGGATATTTACCCTACCATGCTTGATATTGCTGGAATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  AAGCCGGCCTACAAGTATCAAATGTGGTTTCTCTTGTGGATATTTACCCTACCATGCTTGATATTGCTGGAATT  633

Query 1111  CCTCTGCCTCAGAACCTGAGTGGATACTCTTTGTTGCCGTTATCATCAGAAACATTTAAGAATGAACATAAAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CCTCTGCCTCAGAACCTGAGTGGATACTCTTTGTTGCCGTTATCATCAGAAACATTTAAGAATGAACATAAAGT  707

Query 1185  CAAAAACCTGCATCCACCCTGGATTCTGAGTGAATTCCATGGATGTAATGTGAATGCCTCCACCTACATGCTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  CAAAAACCTGCATCCACCCTGGATTCTGAGTGAATTCCATGGATGTAATGTGAATGCCTCCACCTACATGCTTC  781

Query 1259  GAACTAACCACTGGAAATATATAGCCTATTCGGATGGTGCATCAATATTGCCTCAACTCTTTGATCTTTCCTCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  GAACTAACCACTGGAAATATATAGCCTATTCGGATGGTGCATCAATATTGCCTCAACTCTTTGATCTTTCCTCG  855

Query 1333  GATCCAGATGAATTAACAAATGTTGCTGTAAAATTTCCAGAAATTACTTATTCTTTGGATCAGAAGCTTCATTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  GATCCAGATGAATTAACAAATGTTGCTGTAAAATTTCCAGAAATTACTTATTCTTTGGATCAGAAGCTTCATTC  929

Query 1407  CATTATAAACTACCCTAAAGTTTCTGCTTCTGTCCACCAGTATAATAAAGAGCAGTTTATCAAGTGGAAACAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  CATTATAAACTACCCTAAAGTTTCTGCTTCTGTCCACCAGTATAATAAAGAGCAGTTTATCAAGTGGAAACAAA  1003

Query 1481  GTATAGGACAGAATTATTCAAACGTTATAGCAAATCTTAGGTGGCACCAAGACTGGCAGAAGGAACCAAGGAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  GTATAGGACAGAATTATTCAAACGTTATAGCAAATCTTAGGTGGCACCAAGACTGGCAGAAGGAACCAAGGAAG  1077

Query 1555  TATGAAAATGCAATTGATCAGTGGCTTAAAACCCATATGAATCCAAGAGCAGTT  1608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  TATGAAAATGCAATTGATCAGTGGCTTAAAACCCATATGAATCCAAGAGCAGTT  1131