Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05175
• Subject: NM_027570.3
• Aligned Length: 1528
• Identities: 1199
• Gaps: 83

Alignment

Query    1  ATGGCCCGACTGC-TCAGGTCTGCAACCTGGGAGCTGTTCCCCTGGAGGGGCTACTGCTCCCAGAAGG----CA  69
            ||||||...||.| ||.||| .||.|||..|..|||||..|||||||||.|.|.|||||||    |||    |.
Sbjct    1  ATGGCCATGCTCCTTCGGGT-GGCCACCCAGAGGCTGTCTCCCTGGAGGAGTTTCTGCTCC----AGGGGGTCG  69

Query   70  AAGGGAGAGCTCTGCAGGGACTTCGTAGAGGCTCTGAAGGCCGTGGTGGGCGGCTCCCACGTGTCCACTGCCGC  143
            .||||.|..|||.||..||||||.||.||||||||||||||.||.||.||..||.||||||||||||||||..|
Sbjct   70  CAGGGTGGACTCAGCCAGGACTTTGTGGAGGCTCTGAAGGCAGTTGTAGGGAGCCCCCACGTGTCCACTGCTTC  143

Query  144  GGTGGTCCGAGAGCAGCACGGGCGCGATGAGTCGGTGCACAGGTGCGAACCTCCTGATGCTGTGGTGTGGCCCC  217
            .|..|||.|||||||.|||||||..|||||.|||.||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  144  TGCAGTCAGAGAGCAACACGGGCATGATGAATCGATGCACAGGTGTCAACCTCCTGATGCTGTGGTTTGGCCTC  217

Query  218  AGAACGTGGAGCAGGTCAGCCGGCTGGCAGCCCTGTGCTATCGCCAAGGTGTGCCCATCATCCCATTCGGCACC  291
            ||||.|||||.|||||||||||..|||||..|||||||||....||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  218  AGAATGTGGACCAGGTCAGCCGAGTGGCAAGCCTGTGCTACAATCAAGGTGTTCCCATCATCCCATTTGGCACA  291

Query  292  GGCACCGGGCTTGAGGGTGGCGTCTGTGCTGTGCAGGGCGGCGTCTGCGTTAACCTGACGCATATGGACCGAAT  365
            ||||||||..|||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.|.||||||||.||||||||||..||
Sbjct  292  GGCACCGGTGTTGAGGGGGGAGTCTGTGCTGTGCAGGGTGGAGTGTGCATCAACCTGACCCATATGGACCAGAT  365

Query  366  CCTGGAGCTGAA-CCAGGAGGACTTCTCTGTGGTGGTGGAGCCAGGTGTCACCCGCAAAGCCCTCAACGCCCAC  438
            |..||||||||| .|| ||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||
Sbjct  366  CACGGAGCTGAATACA-GAAGACTTCTCCGTGGTGGTGGAGCCTGGAGTCACCCGTAAAGCTCTCAATACCCAC  438

Query  439  CTGCGGGACAGCGGCCTCTGGTTTCCCGTGGACCCAGGCGCGGACGCCTCTCTCTGTGGCATGGCGGCCACCGG  512
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  439  CTGCGTGACAGTGGCCTTTGGTTTCCTGTTGACCCAGGCGCAGATGCTTCTCTGTGTGGCATGGCAGCCACCGG  512

Query  513  GGCGTCGGGGACCAACGCGGTCCGCTACGGCACCATGCGGGACAACGTGCTCAACCTGGAGGTGGTGCTGCCCG  586
            |||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct  513  GGCCTCGGGCACCAATGCTGTGCGCTATGGAACCATGCGGGACAACGTGATTAACCTGGAGGTAGTGCTGCCTG  586

Query  587  ACGGGCGGCTGCTGCACACGGCGGGCCGAGGCCGGCATTTCCGCTTCGGCTTCTGGCCAGAAATCCCTCATCAC  660
            ||||..|||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||.|                                 
Sbjct  587  ACGGCAGGCTGCTTCACACCGCAGGCCGGGGCCGCCATTAC---------------------------------  627

Query  661  ACAGCCTGGTACTCACCTTGTGTGTCCCTGGGACGTAGGAAGAGTGCAGCCGGCTACAACCTCACGGGGCTCTT  734
                                                ||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  628  ------------------------------------AGGAAGAGTGCAGCTGGCTACAATCTCACAGGACTCTT  665

Query  735  CGTGGGCTCCGAGGGGACGCTGGGCCTCATCACAGCCACCACCCTGCGCCTGCACCCTGCCCCTGAGGCCACAG  808
            .||||||||.||||||||.||||||.||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct  666  TGTGGGCTCTGAGGGGACCCTGGGCATCATTACATCAACCACCCTGCGCCTGCACCCTGCGCCGGAAGCAACGG  739

Query  809  TGGCCGCCACGTGTGCGTTCCCCAGTGTCCAGGCTGCTGTGGACAGCACTGTACACATCCTCCAGGCTGCAGTG  882
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  740  TGGCTGCCACCTGTGCGTTCCCCAGTGTTCAAGCGGCTGTGGACAGCACAGTTCAGATCCTCCAGGCTGCAGTG  813

Query  883  CCCGTAGCCCGCATTGAGTTCCTGGATGAAGTCATGATGGATGCCTGCAACAGGTACAGCAAGCTGAATTGCTT  956
            |||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||.|||..
Sbjct  814  CCCGTGGCTCGCATTGAGTTCCTAGATGATGTCATGATGGATGCCTGCAACAGACACAGCAAACTTAACTGCCC  887

Query  957  AGTGGCGCCCACACTCTTCCTGGAGTTCCATGGCTCCCAGCAGGCACTGGAGGAGCAGCTGCAGCGCACAGAGG  1030
            .|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct  888  CGTGGCACCCACGCTTTTCCTGGAGTTCCACGGTTCCCAGCAGACACTGGCGGAACAGCTGCAGCGCACAGAGG  961

Query 1031  AGAT-AGTCCAGCAGAACGGAGCCTCTGACTTCTCCTGGGCCAAGGAGGCCGAGGAGCGCAGCCGGCTTTGGAC  1103
            ..|| |.| |||.|.||.||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||.....||||||.|
Sbjct  962  CAATCACT-CAGGATAATGGTGGCTCTCACTTCTCCTGGGCCAAGGAGGCCGAAAAGCGCAATGAACTTTGGGC  1034

Query 1104  AGCACGGCACAATGCCTGGTACGCAGCCCTGGCCACGCGGCCAGGCTGCAAGGGCTACTCCACGGATGTGTGTG  1177
            |||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||..|.|.|||||..|.||||.|||.||||||||.|||||||
Sbjct 1035  AGCGCGGCACAATGCTTGGTATGCAGCCTTGGCCCTGAGTCCAGGAAGTAAGGCCTATTCCACGGACGTGTGTG  1108

Query 1178  TGCCCATCTCCCGGCTGCCGGAGATCGTGGTGCAGACCAAGGAGGATCTGAATGCCTCAGGACTCACAGGAAGC  1251
            |.|||||||||||||||||.||||||.||||..|||||||||||||..|.||.||.|||..||||||||||..|
Sbjct 1109  TACCCATCTCCCGGCTGCCAGAGATCTTGGTAGAGACCAAGGAGGAGATTAAAGCTTCAAAACTCACAGGAGCC  1182

Query 1252  ATTGTCGGGCATGTGGGTGACGGCAACTTCCACTGCATCCTGCTGGTCAACCCTGATGACGCCGAGGAACTGGG  1325
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.||.|||||.|.|.|
Sbjct 1183  ATCGTTGGGCATGTGGGTGATGGCAACTTTCACTGCATCCTCCTGGTCGACCCAGATGATGCAGAGGAGCAGAG  1256

Query 1326  CAGGGTCAAGGCTTTTGCAGAACAGCTGGGCAGGCGGGCACTGGCTCTCCACGGAACGTGCACGGGGGAGCATG  1399
            .|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||...||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1257  GAGGGTCAAGGCCTTTGCAGAAAATCTGGGCAGGCGGGCCCTGGCACTCGGTGGGACATGCACTGGAGAACATG  1330

Query 1400  GCATCGGAATGGGCAAGCGGCAGCTGCTGCAGGAGGAGGTGGGCGCCGTGGGCGTGGAGACCATGCGGCAGCTC  1473
            ||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  GCATCGGACTGGGCAAGCGACAGCTGCTCCAAGAGGAAGTGGGCCCCGTGGGCGTGGAGACCATGCGGCAGCTC  1404

Query 1474  AAGGCCGTGCTAGACCCCCAAGGCCTCATGAATCCAGGCAAAGTGCTG  1521
            ||...|...||.||.||||..||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1405  AAAAACACACTGGATCCCCGTGGTCTCATGAACCCAGGCAAAGTGCTA  1452