Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05241
Subject:
NM_001145307.4
Aligned Length:
580
Identities:
465
Gaps:
110

Alignment

Query   1  ATGAACAAACGGGACTATATGAACACTTCGGTACAGGAGCCCCCTCTTGACTACTCCTTCAGAAGCATCCACGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAACAAACGGGACTATATGAACACTTCGGTACAGGAGCCCCCTCTTGACTACTCCTTCAGAAGCATCCACGT  74

Query  75  CATTCAAGATCTGGTAAATGAGGAGCCAAGGACAGGACTACGACCACTGAAGCGTTCAAAGTCGGGGAAATCAC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CATTCAAGATCTGGTAAATGAGGAGCCAAGGACAGGACTACGACCACTGAAGCGTTCAAAGTCGGGGAAATCAC  148

Query 149  TGACCCAGTCCCTGTGGCTGAATAACAATGTTCTCAATGATCTGAGAGACTTCAACCAGGTGGCTTCACAGCTG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGACCCAGTCCCTGTGGCTGAATAACAATGTTCTCAATGATCTGAGAGACTTCAACCAGGTGGCTTCACAGCTG  222

Query 223  TTGGAGCACCCAGAGAACCTGGCCTGGATCGACCTGTCCTTTAATGACCTGACTTCCATTGACCCTGTCCTAAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTGGAGCACCCAGAGAACCTGGCCTGGATCGACCTGTCCTTTAATGACCTGACTTCCATTGACCCTGTCCTAAC  296

Query 297  AACTTTCTTCAACCTGAGTGTCCTCTATCTTCACGGCAACAGCATCCAGCGCCTGGGGGAGGTGAATAAGCTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACTTTCTTCAACCTGAGTGTCCTCTATCTTCACGGCAACAGCATCCAGCGCCTGGGGGAGGTGAATAAGCTGG  370

Query 371  CTGTCCTTCCTCGGCTCCGTAGCCTGACACTCCATGGGAACCCCATGGAGGAAGAGAAAGGGTATAGGCAATAT  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 371  CTGTCCTTCCTCGGCTCCGTAGCCTGACACTCCATGGGAACCCCATGGAGGAAGAGAAAGGGTATAG-------  437

Query 445  GTGCTGTGCACCCTGTCCCGTATCACCACGTTCGACTTCAGTGGGGTCACCAAAGCAGA----CCGCACCACAG  514
                             .|||.||                  |||||     .|.|||    ||.|||     
Sbjct 438  ------------------AGTACCA------------------GGGTC-----TGTAGAGATGCCTCAC-----  465

Query 515  CTGAAGTCTGGAAACGCATGAACATCAAGCCCAAGAAGGCCTGGACCAAGCAGAATACACTT  576
                                               ||||||   |||              
Sbjct 466  ------------------------------------AGGCCT---CCA--------------  474