Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05245
• Subject: XM_024447870.1
• Aligned Length: 2484
• Identities: 2484
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGAATTCTGTATCAGTACCACCAAAAGATGAAGGTGAATCAAACATCCCTTCTGGAACAATACAGAGTAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGAATTCTGTATCAGTACCACCAAAAGATGAAGGTGAATCAAACATCCCTTCTGGAACAATACAGAGTAG  74

Query   75  GAAAGGTTTGCAGAATAAGAGTCAGTTTAGGACCATTGCACCAAAAATTGTGCCCAAAGTCCTAACGTCCAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAGGTTTGCAGAATAAGAGTCAGTTTAGGACCATTGCACCAAAAATTGTGCCCAAAGTCCTAACGTCCAGAA  148

Query  149  TGCTGCCATGTCATTCACCATCACGCTCTGATCAGGTGAATCTGGGACCCTCCATCAACTCCAAGCTGCTGGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGCCATGTCATTCACCATCACGCTCTGATCAGGTGAATCTGGGACCCTCCATCAACTCCAAGCTGCTGGGG  222

Query  223  ATGTCCACCCAGAACTATGCCCTGATGCAGGTTGCTGGCCAGGAGGGGACATTTTCTCTTGTTGCTCTGCCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGTCCACCCAGAACTATGCCCTGATGCAGGTTGCTGGCCAGGAGGGGACATTTTCTCTTGTTGCTCTGCCACA  296

Query  297  TGTTGCCTCAGCTCAGCCAATTCAGAAACCCAGAATGTCCCTACCTGAAAACCTGAAACTTCCTATTCCTAGAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTGCCTCAGCTCAGCCAATTCAGAAACCCAGAATGTCCCTACCTGAAAACCTGAAACTTCCTATTCCTAGAT  370

Query  371  ATCAACCCCCTAGAAATAGCAAAGCATCAAGAAAGAAACCCATCCTGATCTTTCCTAAGAGTGGCTGTAGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCAACCCCCTAGAAATAGCAAAGCATCAAGAAAGAAACCCATCCTGATCTTTCCTAAGAGTGGCTGTAGCAAA  444

Query  445  GCTCCTGCCCAAACCCAAATGTGTCCTCAGATGTCCCCTTCCCCACCTCACCACCCTGAACTCCTGTACAAACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCCTGCCCAAACCCAAATGTGTCCTCAGATGTCCCCTTCCCCACCTCACCACCCTGAACTCCTGTACAAACC  518

Query  519  CAGTCCATTTGAGGAAGTACCATCACTAGAGCAAGCCCCAGCCAGCATTAGCACAGCTGCGCTGACCAATGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTCCATTTGAGGAAGTACCATCACTAGAGCAAGCCCCAGCCAGCATTAGCACAGCTGCGCTGACCAATGGAA  592

Query  593  GTGACCATGGGGACTTGAGACCACCAGTGACCAACACCCATGGCAGTCTGAACCCTCCTGCTACCCCAGCATCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGACCATGGGGACTTGAGACCACCAGTGACCAACACCCATGGCAGTCTGAACCCTCCTGCTACCCCAGCATCA  666

Query  667  TCCACACCAGAGGAGCCTGCCAAGCAGGACCTCACAGCTCTTTCAGGGAAAGCACACTTTGTAAGCAAGATAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCACACCAGAGGAGCCTGCCAAGCAGGACCTCACAGCTCTTTCAGGGAAAGCACACTTTGTAAGCAAGATAAC  740

Query  741  ATCTAGTAAACCTTCTGCTGTTGCCAGTGAAAAATTTAAAGAACAAGTTGATCTTGCAAAAACCATGACCAATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTAGTAAACCTTCTGCTGTTGCCAGTGAAAAATTTAAAGAACAAGTTGATCTTGCAAAAACCATGACCAATT  814

Query  815  TATCACCAACCATTCTTGGCAATGCAGTTCAGTTGATCTCTTCAGTCCCCAAAGGGAAACTGCCAATCCCACCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATCACCAACCATTCTTGGCAATGCAGTTCAGTTGATCTCTTCAGTCCCCAAAGGGAAACTGCCAATCCCACCC  888

Query  889  TACTCAAGAATGAAGACAATGGAGGTTTACAAAATCAAATCAGATGCTAACATTGCAGGTTTTTCTTTACCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACTCAAGAATGAAGACAATGGAGGTTTACAAAATCAAATCAGATGCTAACATTGCAGGTTTTTCTTTACCAGG  962

Query  963  ACCTAAGGCCGACTGTGATAAGATACCCTCCACCACAGAAGGCTTTAATGCAGCCACCAAGGTGGCAAGCAGGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCTAAGGCCGACTGTGATAAGATACCCTCCACCACAGAAGGCTTTAATGCAGCCACCAAGGTGGCAAGCAGGC  1036

Query 1037  TACCTGTTCCACAAGTGTCACAGCAGAGTGCCTGTGAAAGTGCCTTTTGTCCACCCACCAAACTTGATCTTAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TACCTGTTCCACAAGTGTCACAGCAGAGTGCCTGTGAAAGTGCCTTTTGTCCACCCACCAAACTTGATCTTAAC  1110

Query 1111  CACAAAACAAAACTGAACAGTGGAGCAGCAAAGAGAAAAGGAAGAAAACGGAAGGTACCAGATGAAATTTTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACAAAACAAAACTGAACAGTGGAGCAGCAAAGAGAAAAGGAAGAAAACGGAAGGTACCAGATGAAATTTTGGC  1184

Query 1185  ATTTCAGGGAAAAAGGAGGAAATATATCATTAATAAGTGTAGAGATGGTAAAGAAAGAGTAAAAAATGATCCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTCAGGGAAAAAGGAGGAAATATATCATTAATAAGTGTAGAGATGGTAAAGAAAGAGTAAAAAATGATCCCC  1258

Query 1259  AAGAATTCAGAGACCAAAAGCTGGGGACCCTGAAAAAATACCGTAGCATTATGCCCAAACCTATCATGGTCATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGAATTCAGAGACCAAAAGCTGGGGACCCTGAAAAAATACCGTAGCATTATGCCCAAACCTATCATGGTCATA  1332

Query 1333  CCCACTTTGGCCTCCCTGGCTTCTCCAACTACACTACAGTCCCAGATGCTTGGGGGCCTAGGACAGGATGTTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCACTTTGGCCTCCCTGGCTTCTCCAACTACACTACAGTCCCAGATGCTTGGGGGCCTAGGACAGGATGTTTT  1406

Query 1407  GTTAAATAATTCACTCACTCCTAAATATCTTGGCTGTAAGCAAGACAACAGCTCTTCCCCTAAGCCCAGCTCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTAAATAATTCACTCACTCCTAAATATCTTGGCTGTAAGCAAGACAACAGCTCTTCCCCTAAGCCCAGCTCCG  1480

Query 1481  TGTTCAGAAATGGATTCTCTGGCATTAAGAAGCCTTGGCACAGATGTCACGTCTGCAACCACCACTTCCAGTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTTCAGAAATGGATTCTCTGGCATTAAGAAGCCTTGGCACAGATGTCACGTCTGCAACCACCACTTCCAGTTC  1554

Query 1555  AAACAGCACCTTCGAGACCACATGAATACACACACCAACAGACGCCCTTACAGTTGTCGGATTTGTCGCAAGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAACAGCACCTTCGAGACCACATGAATACACACACCAACAGACGCCCTTACAGTTGTCGGATTTGTCGCAAGTC  1628

Query 1629  CTATGTACGTCCTGGCAGCCTGAGCACACACATGAAACTTCATCATGGTGAGAACCGTCTGAAGAAACTCATGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTATGTACGTCCTGGCAGCCTGAGCACACACATGAAACTTCATCATGGTGAGAACCGTCTGAAGAAACTCATGT  1702

Query 1703  GTTGTGAGTTTTGTGCAAAAGTGTTTGGCCACATCCGAGTCTATTTTGGCCATCTGAAAGAAGTGCATAGGGTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTGTGAGTTTTGTGCAAAAGTGTTTGGCCACATCCGAGTCTATTTTGGCCATCTGAAAGAAGTGCATAGGGTT  1776

Query 1777  GTGATCAGCACTGAGCCTGCGCCCAGTGAACTGCAGCCAGGAGACATACCAAAGAACAGAGACATGAGTGTGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGATCAGCACTGAGCCTGCGCCCAGTGAACTGCAGCCAGGAGACATACCAAAGAACAGAGACATGAGTGTGCG  1850

Query 1851  AGGCATGGAGGGATCATTGGAGAGGGAAAACAAGTCCAACCTGGAAGAAGACTTCCTTCTAAACCAGGCAGACG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGCATGGAGGGATCATTGGAGAGGGAAAACAAGTCCAACCTGGAAGAAGACTTCCTTCTAAACCAGGCAGACG  1924

Query 1925  AAGTCAAATTACAAATCAAATGTGGTCGTTGTCAGATTACTGCTCAGTCTTTTGCGGAAATAAAATTTCATTTA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGTCAAATTACAAATCAAATGTGGTCGTTGTCAGATTACTGCTCAGTCTTTTGCGGAAATAAAATTTCATTTA  1998

Query 1999  CTTGATGTTCATGGAGAGGAAATTGAGGGCAGGCTACAAGAAGGGACCTTCCCAGGAAGCAAGGGGACTCAGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTTGATGTTCATGGAGAGGAAATTGAGGGCAGGCTACAAGAAGGGACCTTCCCAGGAAGCAAGGGGACTCAGGA  2072

Query 2073  AGAGTTGGTGCAGCACGCTAGCCCCGACTGGAAAAGGCATCCTGAGAGAGGGAAGCCGGAGAAGGTTCATTCCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGAGTTGGTGCAGCACGCTAGCCCCGACTGGAAAAGGCATCCTGAGAGAGGGAAGCCGGAGAAGGTTCATTCCT  2146

Query 2147  CCTCCGAGGAATCACATGCATGTCCAAGACTGAAAAGGCAGCTCCACCTTCATCAGAATGGCGTGGAAATGCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCTCCGAGGAATCACATGCATGTCCAAGACTGAAAAGGCAGCTCCACCTTCATCAGAATGGCGTGGAAATGCTC  2220

Query 2221  ATGGAAAATGAAGGACCCCAGTCAGGAACCAACAAGCCAAGGGAAACCTGCCAGGGCCCTGAGTGTCCTGGCCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGGAAAATGAAGGACCCCAGTCAGGAACCAACAAGCCAAGGGAAACCTGCCAGGGCCCTGAGTGTCCTGGCCT  2294

Query 2295  CCACACGTTTCTCTTGTGGTCCCATTCAGGCTTTAACTGCCTGCTTTGTGCAGAGATGCTGGGACGGAAAGAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCACACGTTTCTCTTGTGGTCCCATTCAGGCTTTAACTGCCTGCTTTGTGCAGAGATGCTGGGACGGAAAGAGG  2368

Query 2369  ACCTCCTCCACCACTGGAAGCACCAGCATAACTGTGAGGACCCTTCCAAACTGTGGGCTATTTTAAATACGGTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCTCCTCCACCACTGGAAGCACCAGCATAACTGTGAGGACCCTTCCAAACTGTGGGCTATTTTAAATACGGTC  2442

Query 2443  TCCAACCAGGGAGTGATCGAACTTTCCAGTGAAGCTGAGAAA  2484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TCCAACCAGGGAGTGATCGAACTTTCCAGTGAAGCTGAGAAA  2484