Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05264
• Subject: XM_017315482.1
• Aligned Length: 1740
• Identities: 1560
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATTATCCCAAAATGGATTATTTTCTGGATGTAGAGTCTGCTCACAGACTCTTGGATGTTGAGTCAGCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGGATTATCCCAAAATGGATTATTTTCTGGACGTTGAGTCTGCTCACAGACTCTTGGATGTGGAGTCGGCGCA  74

Query   75  AAGATTCTTCTACAGTCAAGGAGCTCAAGCTCGCCGGGCGACCCTGCTCCTGCCTCCCACATTAATGGCGGCAT  148
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GAGGTTCTTCTACAGTCAAGGAGCTCAAGCTCGCCGGGCGACCCTGCTCCTGCCTCCCACATTAATGGCGGCTT  148

Query  149  CCTCGGAGGATGATATAGACCGGCGGCCCATCCGGAGAGTGCGCTCCAAGAGCGACACGCCGTACCTCGCAGAG  222
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  CTTCGGAGGATGACATAGACCGGCGGCCCATCAGAAGAGTCCGCTCCAAGAGCGACACGCCATATCTCGCAGAG  222

Query  223  GCCAGGATCTCCTTTAACCTGGGGGCAGCTGAGGAAGTGGAGAGGCTGGCGGCGATGCGTTCTGACTCCCTCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  GCCAGGATCTCCTTTAACCTGGGGGCAGCCGAGGAAGTGGAGAGGCTGGCAGCCATGCGTTCCGACTCGCTGGT  296

Query  297  CCCAGGCACCCACACCCCACCCATCCGCAGGAGAAGTAAGTTTGCCAACCTGGGAAGGATTTTCAAGCCTTGGA  370
            ||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  297  CCCAGGTACGCACACCCCGCCCATCCGGAGGAGGAGTAAGTTTGCCAACCTGGGGAGGATTTTCAAACCCTGGA  370

Query  371  AATGGAGGAAGAAGAAAAGCGAAAAGTTCAAACACACGTCAGCAGCCCTGGAAAGGAAAATATCTATGAGGCAA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct  371  AATGGAGGAAGAAGAAAAGTGAAAAGTTCAAGCACACGTCAGCAGCTCTGGAAAGGAAGATTTCGATGAGGCAG  444

Query  445  AGCAGAGAAGAGCTGATAAAGCGAGGAGTCCTGAAGGAAATCTATGATAAAGATGGGGAACTCTCTATATCCAA  518
            ||||||||.||||||||.|||.||||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  AGCAGAGAGGAGCTGATCAAGAGAGGGGTCTTGAAGGAGATCTACGATAAAGATGGAGAACTCTCTATATCAAA  518

Query  519  TGAAGAGGACTCCCTAGAAAATGGGCAGTCCCTGAGCTCCAGCCAGCTGTCTCTGCCTGCCCTGTCCGAAATGG  592
            ||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  TGAAGATGACTCCCTGGAGAACGGACAGTCCCTGAGCTCCAGCCAACTCTCTTTGCCTGCTCTGTCGGAAATGG  592

Query  593  AGCCAGTCCCAATGCCCAGGGATCCCTGCTCATATGAGGTGCTCCAACCGTCAGACATCATGGATGGGCCAGAT  666
            ||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  AGCCTGTCCCAATGCCCAGGGACCCATGCTCATATGAGGTGCTCCAAGCTTCAGACATTATGGATGGACCAGAT  666

Query  667  CCTGGCGCCCCTGTGAAATTGCCTTGTCTGCCAGTGAAACTGTCGCCTCCGCTACCTCCAAAGAAAGTCATGAT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  667  CCTGGCGCCCCTGTGAAATTGCCTTGTCTGCCAGTGAAACTGTCGCCTCCGCTACCTCCAAAGAAAGTCCTGAT  740

Query  741  CTGTATGCCCGTGGGGGGGCCAGACCTCTCACTGGTGTCCTACACAGCCCAGAAGAGTGGCCAGCAGGGTGTGG  814
            |||||||||.||.|||||||||||.|||.|.||||..|||||..|||||||||||||..|||||||||..||||
Sbjct  741  CTGTATGCCTGTAGGGGGGCCAGAGCTCACTCTGGCATCCTATGCAGCCCAGAAGAGCAGCCAGCAGGCCGTGG  814

Query  815  CCCAGCACCACCACACTGTCCTGCCCTCCCAGATCCAGCACCAGCTGCAGTACGGCAGCCACGGCCAGCACCTC  888
            ||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  CCCAGCACCACCACACCGTCCTACCATCCCAGATGCAGCACCAGCTGCAGTATGGCAGTCACGGCCAGCATCTC  888

Query  889  CCCTCCACCACCGGCTCCCTCCCCATGCACCCCTCGGGCTGCAGAATGATAGACGAGCTCAACAAAACGCTGGC  962
            ||.|||.||||||||.||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  889  CCATCCTCCACCGGCACCTTGCCCATGCACCCCTCAGGCTGCAGGATGATCGACGAGCTGAACAAGACACTCGC  962

Query  963  CATGACCATGCAGAGGCTGGAAAGCTCTGAGCAGCGGGTCCCCTGTTCCACTTCTTACCACAGCTCTGGGTTGC  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  CATGACGATGCAGAGGCTGGAAAGCTCCGAGCAACGAGTCCCCTGTTCCACGTCTTACCACAGTTCTGGTTTGC  1036

Query 1037  ACTCGGGTGATGGGGTCACCAAAGCAGGACCTATGGGCCTTCCAGAAATAAGACAAGTGCCAACTGTTGTGATT  1110
            ||||..|.||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTCAAGCGACGGCATCACAAAAGCAGGACCCATGGGCCTTCCGGAAATAAGACAAGTGCCAACTGTTGTGATT  1110

Query 1111  GAATGTGATGACAATAAAGAAAATGTGCCTCATGAGTCAGACTACGAAGACTCTTCTTGCCTGTATACAAGAGA  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||||.||||||||..|.|||||||||....|.||
Sbjct 1111  GAATGTGATGACAATAAGGAAAATGTGCCTCATGAACCCGACTATGAAGACTCGCCCTGCCTGTATGGCCGGGA  1184

Query 1185  AGAGGAGGAAGAGGAGGAGGACGAAGACGACGACAGCTCATTATACACCAGCTCCCTGGCCATGAAGGTCTGCA  1258
            .|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||..|||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  GGAGGAGGAAGAGGAGGAAGATGAAGATGATGACGCCTCTTTGTACACCAGCTCACTGGCCATGAAGGTGTGCA  1258

Query 1259  GGAAGGACTCCTTAGCCATCAAACTCAGCAACAGGCCCTCCAAGCGAGAGCTGGAAGAAAAGAACATCCTTCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  GGAAGGACTCCTTAGCCATCAAACTCAGCAACAGGCCCTCTAAGCGAGAGCTAGAAGAAAAGAACATCCTCCCC  1332

Query 1333  AGGCAGACGGATGAGGAGCGGCTGGAGCTGAGGCAACAGATTGGCACCAAGCTCACCAGGCGGCTGAGCCAGAG  1406
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGACAGACGGATGAGGAACGGCTGGAGCTCAGACAGCAGATTGGCACCAAGCTCACCAGGCGGCTGAGCCAGAG  1406

Query 1407  GCCAACTGCAGAGGAACTGGAACAGAGGAACATTTTGAAACCTCGGAATGAACAAGAGGAACAGGAGGAGAAGA  1480
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct 1407  ACCAACTGCAGAGGAACTGGAACAGAGGAACATTTTGAAGCCTCGGAATGAACAAGAAGAACAGGAGGAGAAGC  1480

Query 1481  GAGAGATCAAGAGGAGGCTAACCCGAAAGCTCAGTCAAAGGCCCACGGTGGAAGAGCTTCGGGAAAGAAAGATC  1554
            |.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1481  GGGAAATCAAGAGGAGGCTGACTCGCAAGCTCAGCCAAAGGCCCACAGTGGAAGAACTCCGGGAGAGGAAGATC  1554

Query 1555  CTCATCCGCTTCAGTGACTACGTGGAGGTGGCTGACGCTCAGGACTATGACCGCAGGGCAGATAAGCCGTGGAC  1628
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1555  CTTATCCGCTTCAGTGACTACGTGGAAGTGGCAGATGCCCAAGACTATGACCGAAGGGCAGACAAGCCATGGAC  1628

Query 1629  CCGCCTCACCGCTGCAGACAAAGCTGCCATCCGAAAGGAGCTCAATGAATTCAAAAGCACTGAGATGGAAGTTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1629  CCGCCTCACCGCTGCAGACAAAGCTGCCATTCGGAAGGAACTCAATGAGTTTAAAAGTACCGAGATGGAAGTCC  1702

Query 1703  ATGAATTGAGTAGACACTTAACAAGGTTTCACCGACCT  1740
            |.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1703  ACGAGTTAAGTAGACACTTAACCAGGTTTCATCGACCT  1740