Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05272
• Subject: NM_178675.4
• Aligned Length: 1227
• Identities: 1107
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGATCCCCCCTGAGCAGCCGCAGCAGCAGCTGCAGCCGCCGTCGCCA---GCCCCGCCGAACCATGTGGTGAC  71
            |||||.|||||.||||..|||||||..||.||||||||.||..|.|||   |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATTCCCCCCGAGCCTCCGCAGCCCCAACTGCAGCCACCACCTCCACCGGCCCCGCCGAACCATGTGGTGAC  74

Query   72  CACCATCGAGAACCTGCCGGCCGAGGGCAGCGGCGGCGGCGGGAGCCTGTCCGCCTCCTCCCGGGCTGGCGTGC  145
            ||||||||||||||||||.||.|||||||   |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct   75  CACCATCGAGAACCTGCCAGCTGAGGGCA---GCGGCGGCGTGAGCCTGTCCGCCTCCTCCCGGGCTAGCATGC  145

Query  146  GCCAGAGGATCCGCAAAGTGCTGAACAGGGAGATGTTAATCTCTGTGGCCCTAGGCCAGGTGTTATCCCTCCTT  219
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  146  GCCAGAGGATCCGCAAAGTGCTGAACAGGGAGATGTTAATCTCTGTGGCTTTGGGTCAAGTGTTATCCCTTCTC  219

Query  220  ATTTGTGGAATTGGCTTGACTAGCAAGTATCTGTCAGAAGATTTCCACGCCAACACACCAGTCTTCCAGAGTTT  293
            .|||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  220  GTTTGTGGAATTGGCTTGACGAGCAAGTACCTGGCAGAGGATTTTCATGCGAACACACCAGTCTTCCAGAGCTT  293

Query  294  CCTCAATTACATTCTTCTCTTCTTGGTCTATACCACCACACTAGCCGTCAGACAAGGAGAAGAAAACCTCCTGG  367
            .||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TCTGAACTACATCCTCCTCTTCTTGGTATACACCACCACCCTAGCTGTCCGACAAGGAGAAGAAAACCTCCTGG  367

Query  368  CAATTTTACGACGAAGATGGTGGAAGTACATGATTTTGGGACTCATAGACCTGGAAGCAAATTATCTGGTGGTC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  368  CAATTTTACGACGAAGATGGTGGAAGTATATGATCCTTGGACTCATAGACTTGGAAGCTAATTACCTGGTGGTC  441

Query  442  AAGGCTTACCAATACACAACTCTGACCAGTATCCAGCTCCTGGACTGTTTTGTGATCCCAGTCGTGATTTTGCT  515
            |||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  442  AAGGCTTACCAGTACACAACTCTGACCAGTGTCCAGCTCCTGGACTGTTTTGTGATCCCGGTGGTGATTTTGCT  515

Query  516  CTCCTGGTTCTTCCTGCTGATCCGGTACAAGGCTGTGCATTTCATCGGCATCGTTGTCTGCATCCTGGGAATGG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  516  CTCCTGGTTCTTCCTGCTGATCCGGTACAAGGCTGTGCATTTCATCGGCATCGTAGTCTGCATCCTGGGTATGG  589

Query  590  GCTGCATGGTGGGAGCAGATGTGCTTGTGGGAAGACATCAGGGAGCAGGGGAAAATAAGCTGGTAGGGGACCTT  663
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  590  GCTGCATGGTGGGAGCGGATGTGCTCGTGGGAAGGCACCAGGGAGCAGGAGAAAATAAGCTGGTAGGAGACCTT  663

Query  664  CTGGTCTTAGGAGGAGCCACACTCTATGGTATTTCTAACGTCTGGGAAGAATACATCATCCGAACTCTGAGCCG  737
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||.|||.||||||||.||||||||
Sbjct  664  CTGGTCTTAGGAGGAGCCACCCTGTACGGGATCTCAAATGTCTGGGAAGAATCCATTATCCGAACCCTGAGCCG  737

Query  738  AGTGGAATTCCTGGGAATGATTGGTCTCTTTGGAGCATTTTTCAGTGGAATTCAATTAGCTATAATGGAGCATA  811
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  738  TGTGGAGTTCCTGGGAATGATTGGTCTCTTTGGTGCATTTTTCAGTGGAATTCAATTAGCCATCATGGAACACA  811

Query  812  AGGAACTGTTGAAGGTGCCCTGGGACTGGCAAATAGGACTGCTCTACGTTGGCTTTAGTGCCTGCATGTTTGGT  885
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AGGAACTGTTAAAGGTACCATGGGATTGGCAAATAGGACTGCTCTATGTTGGCTTTAGTGCCTGCATGTTTGGT  885

Query  886  CTCTACAGCTTTATGCCAGTCGTCATAAAGAAAACCAGTGCCACTTCAGTCAACCTCTCCTTGCTCACAGCAGA  959
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct  886  CTCTACAGCTTTATGCCAGTTGTCATAAAGAAAACGAGTGCCACCTCGGTCAACCTTTCTCTGCTCACAGCAGA  959

Query  960  CTTGTACAGCCTGTTCTGTGGATTGTTTCTCTTCCACTACAAGTTTTCAGGACTTTATCTCCTGTCTTTCTTCA  1033
            ..||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  960  TCTGTACAGCCTGTTCTGTGGACTCTTTCTCTTCCACTACAAGTTTTCAGGTCTTTACCTCCTGTCTTTCTTCA  1033

Query 1034  CCATCCTCATTGGGCTGGTGCTCTACTCCTCCACCTCCACCTACATAGCCCAGGACCCCCGAGTGTATAAGCAG  1107
            ||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1034  CCATCCTCATCGGGCTGGTGCTGTATTCCTCCACCTCTACATACATAGCCCAGGATCCCCGAGTGTACAAGCAG  1107

Query 1108  TTCCGCAATCCTTCAGGACCTGTTGTGGACTTACCGACCACAGCTCAGGTGGAACCCTCAGTCACCTACACCAG  1181
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108  TTCCGCAATCCTTCAGGACCTGTCGTGGACTTACCCAGCACGGCTCAGGTAGAGCCTTCAGTCACCTACACCAG  1181

Query 1182  CCTGGGCCAGGAGACCGAAGAGGAGCCTCATGTTCGTGTGGCC  1224
            |||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1182  CCTGGGCCAGGAGACAGAAGAAGAGCCCCATGTACGTGTGGCC  1224