Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05294
- Subject:
- XR_001751888.2
- Aligned Length:
- 1260
- Identities:
- 983
- Gaps:
- 276
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGCTGCCCGGCGCCGGCTTCCGGGTGGTGCGAGCGAGATGGGGCGGAGGGCCGGTCTTGCAGAGTAGCTGCGGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAGTGGGCGTGTGCGCCGAGCGGTCTGGCCCAAGGGCTGGGGGCCGGCCGAGGGTCTTCGGGAGCAGGCCGCAG 148
Query 1 ---------------------------------------------ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGC 29
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCGCGGAGAGATCCTGGGATCGCCGTCCGCCGCTGCTACCCGGCATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGC 222
Query 30 CGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGC 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGC 296
Query 104 CGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTC 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTC 370
Query 178 ACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGT 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGT 444
Query 252 GCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGG 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGG 518
Query 326 AGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGC 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGC 592
Query 400 CAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGA 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGA 666
Query 474 GGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACAACAAGTACT 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACAACAAGTACT 740
Query 548 CCTACACC------------------------------------------------------------------ 555
||||||||
Sbjct 741 CCTACACCAGGAACTGGCAGAGTCCTCCCCCTTGAGGTCAGTACTGTTGTGAGCTCCATTTTACAGATGAGGAG 814
Query 556 --------------AGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCGC 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTCGGGACACCAAGAGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCGC 888
Query 616 TTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGTTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGG 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGCTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGG 962
Query 690 CCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTTC 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTTC 1036
Query 764 CAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTC 1110
Query 838 CTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCACCG 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCACCG 1184
Query 912 TGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAGG 985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAG- 1257
Query 986 AC 987
Sbjct 1258 -- 1257