Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05309
• Subject: NM_147061.1
• Aligned Length: 972
• Identities: 819
• Gaps: 9

Alignment

Query   1  ATGAGTCACACCAATGTTACCATCTTCCATCCTGCAGTTTTTGTCCTTCCTGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTA  74
           ||||.|||.|.|||..|.|||..|.||||.||||||.|||||||.||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGATTCATAGCAACATCACCCCCATCCACCCTGCATTTTTTGTGCTAGTTGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTA  74

Query  75  TCACATTTGGCTGTCAATACCTCTTTGCCTCATTTACATCACTGCAGTCCTGGGAAACAGCATCCTGATAGTGG  148
           |||.|..|||.||||.|||||.||.||||||||.||..|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct  75  TCATACCTGGTTGTCTATACCCCTGTGCCTCATGTATGTCACTGCAGTCCTTGGAAACAGCATCCTGATAATGG  148

Query 149  TTATTGTCATGGAACGTAACCTTCATGTGCCCATGTATTTCTTCCTCTCAATGCTGGCCGTCATGGACATCCTG  222
           |.||..|||..|||||.||||||||||..|||||||||||.||||||||.|||.|||||.|||.|||||||.|.
Sbjct 149  TGATCATCACAGAACGGAACCTTCATGAACCCATGTATTTTTTCCTCTCCATGTTGGCCATCACGGACATCTTA  222

Query 223  CTGTCTACCACCACTGTGCCCAAGGCCCTAGCCATCTTTTGGCTTCAAGCACATAACATTGCTTTTGATGCCTG  296
           |||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223  CTGTCCACCACAACTGTGCCCAAGGCCCTCACCATCTTTTGGCTCCATGCCCACAACATTGCCTTTGATGCCTG  296

Query 297  TGTCACCCAAGGCTTCTTTGTCCATATGATGTTTGTGGGGGAGTCAGCTATCCTGTTAGCCATGGCCTTTGATC  370
           |||||||||||.||||||||||||.|..|||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 297  TGTCACCCAAGTCTTCTTTGTCCACACAATGTTCGTGGGGGAGTCGGCCATCTTGTTAGCCATGGCCTTTGACC  370

Query 371  GCTTTGTGGCCATTTGTGCCCCACTGAGATATACAACAGTGCTAACATGGCCTGTTGTGGGGAGGATTGCTCTG  444
           |||||.|.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|....||.||||||||||||||.
Sbjct 371  GCTTTATAGCCATCTGTGCCCCACTGAGATATGCAACAGTGCTAACATGGTCCACAGTTGGGAGGATTGCTCTA  444

Query 445  GCC---GTCATCACCCGAAGCTTCTGCATCATCTTCCCAGTCATATTCTTGCTGAAGCGGCTGCCCTTCTGCCT  515
           |||   |||||||   |||||.||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 445  GCCATTGTCATCA---GAAGCATCTGTATTATCTTTCCTGTGATTTTCTTGCTGAAGCGGCTGCCGTTCTGCCG  515

Query 516  AACCAACATTGTTCCTCACTCCTACTGTGAGCATATTGGAGTGGCTCGTTTAGCCTGTGCTGACATCACTGTTA  589
           |||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 516  AACCAACATCGTCCCCCATTCCTACTGTGAGCACATTGGGGTGGCCCGCTTAGCTTGTGCAGATATAACTGTTA  589

Query 590  ACATTTGGTATGGCTTCTCAGTGCCCATTGTCATGGTCATCTTGGATGTTATCCTCATCGCTGTGTCTTACTCA  663
           ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 590  ACATCTGGTACGGCTTCTCCGTGCCCATCGTCATGGTCATTGTGGATGTGATTCTCATTGCTGTGTCGTACTCG  663

Query 664  CTGATCCTCCGAGCAGTGTTTCGTTTGCCCTCCCAGGATGCTCGGCACAAGGCCCTCAGCACTTGTGGCTCCCA  737
           ||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 664  CTCATTCTCCGAGCAGTGTTTCGCTTGCCCTCCCAGGATGCTCGGCACAAAGCTCTCAGCACCTGTGGCTCGCA  737

Query 738  CCTCTGTGTCATCCTTATGTTTTATGTTCCATCCTTCTTTACCTTATTGACCCATCATTTTGGGCGTAATATTC  811
           |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||..||||||.|.||.||||
Sbjct 738  CCTCTGTGTCATCCTCATGTTTTACGTTCCATCCTTCTTTACTTTACTGACCCATCGCTTTGGGAGAAACATTC  811

Query 812  CTCAACATGTCCATATCTTGCTGGCCAATCTTTATGTGGCAGTGCCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTATGGT  885
           |.|.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 812  CCCGACACGTGCATATCCTGCTGGCCAATCTTTATGTGGTGGTACCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTACGGA  885

Query 886  GTGAAGACTAAGCAGATACGTGAGGGTGTAGCCCACCGGTTCTTTGACATCAAGACTTGGTGCTGTACCTCCCC  959
           |||||||||||.|||||.||.||||||||.|.||||.|||||||.||||||||||||..|||.|||.|.||.||
Sbjct 886  GTGAAGACTAAACAGATCCGGGAGGGTGTGGTCCACTGGTTCTTGGACATCAAGACTCTGTGTTGTTCTTCACC  959

Query 960  TCTGGGCTCA  969
           |.||||.   
Sbjct 960  TTTGGGA---  966