Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05418
- Subject:
- NM_001103182.2
- Aligned Length:
- 1674
- Identities:
- 1510
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA 74
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCACCGGGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA 74
Query 75 CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAGGGAAGTTTATCTAACACATGGAATGAAAAGTACA 148
Query 149 GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA 222
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|..||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTTCTTTACAGAAAACTCCTGTTTGGAAAGGCAGGAATGCGGGCCCTGCTGTAGAAATGCCTTTCAGAAATTCA 222
Query 223 AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT 296
|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 AAAAGAAGTCGACTCTTTTCTGATGAAGATGACAGACAAATAAATACAAAGTCACCTAAAAGAAACCAGAGAGT 296
Query 297 TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC 370
.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCAATGATCCCACAGAAATTTACAGCAACGATGTCAACACCAGATAAGAAAGCATCACAGAAGATTGGTTTTC 370
Query 371 GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT 444
|||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 371 GATTACGGAACCTACTCAAGCTTCCCAAAGCACATAAGTGGTGCATATATGAGTGGTTCTACTCAAACATAGAC 444
Query 445 AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 518
||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCCACTTTTTGAAGGAGATAATGACTTTTGTGTATGCCTAAAGGAATCCTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 518
Query 519 GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 592
.||||||||||||||||||||||||||..||.|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATCAGGAGACTGATGGGAAAACCTCGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 592
Query 593 AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 666
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGAAGAGAGATCAGCCTTAAAACAGAAGCGGCAGAAAATCAGGCTGTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 666
Query 667 TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG 740
|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 667 TCACAGTTCAAAGATCTCCCCGATGAAATCCCTCTACCCCTGGTTATTGGAACCAAAGTTACAGCGCGGTTACG 740
Query 741 TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT 814
|||..||||.|||||..||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 TGGCATTCACGATGGCCTGTTTACTGGTCAGATAGATGCAGTGGACACTCTTAATGCTACTTACAGAGTAACTT 814
Query 815 TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG 888
|.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 TCGATAGGACAGGCCTTGGGACTCACACCATTCCTGACTATGAAGTTCTTAGTAATGAGCCTCATGAGACAATG 888
Query 889 CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC 962
|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CCAATCTCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGGTTTTTTATGACCCCCCCACGGTTACATTATACCCC 962
Query 963 TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT 1036
||||||||||||||||||||.||||...|||||||||.|.||.|||||.||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 963 TCCTCTCCAGTCACCAATTACAGATGGCGATCCTTTACTGGGGCAGTCACCTTGGAGAAGTAAAGTTTCTGGCT 1036
Query 1037 CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG 1110
|||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|..||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGACACGGAGACGTTAGGAGGCTTTCCAGTGGAATTCCTTATCCAGGTGACTAAGTTATCAAAAATTCTCATG 1110
Query 1111 ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC 1184
||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 ATTAAAAAAGAGCATATAAAGAAATTAAGGGAGATGAACACAGAAGCAGAAAAGCTGAAATCCTATTCCATGCC 1184
Query 1185 CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA 1258
|||..|||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 CATTGGCATTGAGTTTCAGCGGAGATACGCAACGATCGTCCTGGAGCTTGAGCAGCTGAACAAGGACCTGAACA 1258
Query 1259 AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA 1332
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 AAGTTCTGCATAAAGTTCAGCAGTATTGCTATGAGCTTGCACCAGACCAGGGACTCCAGCCTGCCGATCAGCCA 1332
Query 1333 ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC 1406
|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|..|.||||||||
Sbjct 1333 ACAGACATGAGACGGAGGTGTGAGGAAGAAGCCCAGGAAATCGTCCGGCAAGCCAACTCTGCTTCCGGACAGCC 1406
Query 1407 CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG 1480
|||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 CTGTGTAGAAAACGAAAATCTGACGGACTTGATCTCCAGGCTCACTGCGATTTTATTACAAATTAAGTGTCTGG 1480
Query 1481 CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA 1554
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|..||||||
Sbjct 1481 CAGAGGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCTCTCACAGATTCATTAAATGACATAAAAAACACAATA 1554
Query 1555 GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA 1628
||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1555 GATGCTTCTAATATCAGTTGTTTTCAGAATAACGTAGAAATCCATGTTGCACATATCCAGAGTGGCCTGAGTCA 1628
Query 1629 GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC 1674
|||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1629 GATGGGAAACTTACACGCCTTTGCAGCCAACAACACGAACAGAGAC 1674