Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05418
- Subject:
- NM_001366245.2
- Aligned Length:
- 1674
- Identities:
- 1626
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGCGCGGCTCGTTCAAGATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA 74
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------ATGGCGGAGCTCGACCAGTTGCCTGA 26
Query 75 CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAAAGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACA 100
Query 149 GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 GTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGAATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCA 174
Query 223 AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 AAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGGCAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGT 248
Query 297 TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 TGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTCAACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTC 322
Query 371 GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 GATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATAAATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGAT 396
Query 445 AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 AAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTATGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAA 470
Query 519 GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 GTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCTTATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTG 544
Query 593 AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 AGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGAAAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTT 618
Query 667 TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 TCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTGCCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACG 692
Query 741 TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 TGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGATGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTT 766
Query 815 TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 TTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTGACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATG 840
Query 889 CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCTCGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCC 914
Query 963 TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTTATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCT 988
Query 1037 CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 CTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAATTTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATG 1062
Query 1111 ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 ATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATGAACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCC 1136
Query 1185 CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 CATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAATTGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACA 1210
Query 1259 AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 AAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGCTTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCA 1284
Query 1333 ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 ACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAGGAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCC 1358
Query 1407 CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 CTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTCCAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAG 1432
Query 1481 CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAATCACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATA 1506
Query 1555 GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTAGAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCA 1580
Query 1629 GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 GATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACACCAACAGAGAC 1626