Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05666
Subject:
NM_001005405.3
Aligned Length:
498
Identities:
333
Gaps:
141

Alignment

Query   1  ATGGGCTGCTGTGGCTGCTCTGGA---------------------GGCTGTGGCTCCGGCTGTGGGGGCTGTGG  53
           |||||||||||||||||.||||||                     |||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGCTGCTGTGGCTGTTCTGGAGGCTGTGGCTCTGGCTGTGGGGGCTGTGGCTCCGGCAGTGGGGGCTGTGG  74

Query  54  CTCTGGCTGTGGGGGCTGTGGGTCCAGCTGCTGTGTGCCCATCTGCTGCTGCAAGCCCGTGTGCTGCTGTGTGC  127
           |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  CTCTGGCTGTGGGGGCTGTGGCTCCAGCTGCTGTGTGCCCATTTGCTGCTGCAAGCCTGTGTGCTGCTGTGTGC  148

Query 128  CAGCCTGTTCCTGCACCAGCTGTGGCTCTTGTGGGGGCTCCAAGGGGTGCTGTGGCTCTTGTGGGGGCTCCAAA  201
           ||||||||||||||.|||                              ||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149  CAGCCTGTTCCTGCTCCA------------------------------GCTGTGGCTCCTGTGGGGGCTCCAAA  192

Query 202  GGGGGCTGTGGCTCTTGTGGGGGCTCCAAGGGAGGCTGTGGCTCTTGTGGCTGCTCCCAGTGCAGTTGCTGCAA  275
           |||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||..|||||.||
Sbjct 193  GGGGGCTGTGGCTCTTGTGGGAGCTCCAAGGGTGGGTGTGGTTCTTGTGGCTGCTCCCAGTCCAACTGCTGTAA  266

Query 276  GCCCTGCTACTGTTCCTCAGGCTGTGGGTCAT------------------------------------------  307
           ||||||||.||..|||||||||||||||||||                                          
Sbjct 267  GCCCTGCTGCTCCTCCTCAGGCTGTGGGTCATTCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTCCAAACCCTGCTGCTGCCAAT  340

Query 308  ---CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTG-------------------------------TTC---  344
              .|||||||||||||||||||||||||||||||||                               |||   
Sbjct 341  CCAGCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTGCCAATCCAGCTGCTGCCAGTCTAGCTGCTTCAAG  414

Query 345  -----------CCAGGCCAGCTGCTGTGTCCCCATTTGCTGCCAGTGCAAAATC  387
                      ||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||
Sbjct 415  CCCTGCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTGTCCCCGTGTGCTGCCAGTGTAAGATC  468