Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05740
- Subject:
- XR_873756.3
- Aligned Length:
- 1686
- Identities:
- 1075
- Gaps:
- 501
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AATTTTGGCGGCGCACTCAGACTGCCGGTACTTCCGGTGAGGGTCGTCTCGTCGAGGCTGGTGGGTCTACGCGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGACCTGCGGGGTCCTGAGGCTGTGGAGGGCTGGAGTGAGGCGGACAGGAGAAGAAGCCTGGAGCTGAGGAC 148
Query 1 -------------------------------------ATGGATGAAGAACCTGAAAGAACTAAGCGATGGGAAG 37
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 149 CGAGAGTTGAATAAGCATATATATCATTATAAGCACCATGGATGAAGAACCTGAGAGAACCAAGCGGTGGGAAG 222
Query 38 GAGGCTATGAAAGAACATGGGAGATTCTTAAAGAAGATGAATCTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGACATT 111
||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 GAGGCTATGAGAGAACCTGGGAAATTCTTAAAGAAGATGAAACTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGATATT 296
Query 112 CTATTCAAGGCAAAGAGAAAAAGAGTATTTGAGCACCATGGACAAGTTCGACTTGGAATGATGCGCCACCTTTA 185
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 297 CTCTTCAAGGCAAAGAGGAAAAGAGTGTTTGAGCACCATGGACAAGTCCGACTTGGAATGATGCGCCACCTGTA 370
Query 186 TGTGGTAGTAGATGGATCAAGAACAATGGAAGACCAAGATTTAAAGCCTAATAGACTGACGTGTACTTTAAAGT 259
||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 371 TGTGGTGGTGGATGGATCGAGAACAATGGAAGATCAGGATTTAAAGCCCAATAGACTGACTTGCACTTTAAAGT 444
Query 260 TGTTGGAATACTTTGTAGAGGAATATTTTGATCAAAATCCTATTAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGT 333
||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCTGGAATACTTTGTAGAAGAATATTTTGATCAAAACCCTATCAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGT 518
Query 334 AAAAGAGCTGAAAAATTGACTGAACTTTCAGGAAACCCAAGAAAACATATAACGTCTTTGAAGGAAGCTGTGGA 407
|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||
Sbjct 519 AAAAGAGCTGAAAAACTGACTGAACTCTCAGGAAACCCAAGGAAACATATAACATCTTTGAAGAAAGCTGTAGA 592
Query 408 TATGACCTGCCATGGAGAGCCATCTCTTTATAATTCCCTAAGCATGGCTATGCAGACTCTAAAACACATGCCTG 481
||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 593 TATGACCTGCCATGGAGAACCATCGCTCTATAATTCCTTAAGCATGGCTATGCAGACCCTAAAACACATGCCTG 666
Query 482 GACATACAAGTCGAGAAGTACTAATCATCTTTAGCAGCCTTACAACTTGCGATCCATCTAATATTTATGATTTA 555
|||||||||||.|||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 667 GACATACAAGTAGAGAAGTGCTCATCATCTTCAGCAGCCTCACCACCTGTGATCCATCTAATATTTACGATCTC 740
Query 556 ATCAAGACCCTAAAGGCAGCTAAAATTAGAGTATCTGTTATTGGATTGTCTGCAGAAGTTCGCGTTTGCACTGT 629
|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 741 ATCAAGACCCTGAAGACAGCTAAAATTAGAGTGTCTGTTATTGGATTATCTGCGGAGGTTCGAGTTTGTACTGT 814
Query 630 ACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACGTACCATGTTATTTTAGATGAAAGCCATTACAAAGAGTTGCTCACACATC 703
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||||.|..||||||
Sbjct 815 ACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACATACCATGTTATCTTAGATGAAACCCATTACAAGGAGTTGTTGGCACATC 888
Query 704 ATCTTAGTCCTCCTCCTGCTAGCTCAAGTTCTGAATGCTCACTTATTCGTATGGGATTTCCTCAGCACACCATT 777
||.|.||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 889 ATGTGAGCCCCCCTCCTGCCAGCTCAAGCTCCGAGTGCTCACTCATTCGCATGGGATTCCCTCAGCATACCATT 962
Query 778 GCTTCTTTATCTGACCAGGATGCAAAACCCTCTTTCAGCATGGCGCATTTGGATGGCAA---TACTGAGCCAGG 848
||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||..||| .|||||||||||
Sbjct 963 GCTTCTTTGTCTGATCAGGATGCAAAACCATCCTTCAGCATGGCGCATTTGGATAACAACAGCACTGAGCCAGG 1036
Query 849 GCTTACATTAGGAGGCTATTTCTGCCCACAGTGTCGGGCAAAGTACTGTGAGCTACCTGTTGAATGTAAAATCT 922
|||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1037 GCTTACACTGGGAGGCTACTTCTGCCCACAGTGCCGAGCAAAGTACTGCGAGCTTCCTGTTGAATGTAAAATAT 1110
Query 923 GTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCTCCCCACTTGGCACGGTCTTACCATCATTTGTTTCCTTTGGATGCTTTTCAA 996
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCACCTCATTTGGCAAGATCTTACCATCATTTATTTCCTTTGGATGCTTTTCAA 1184
Query 997 GAAATTCCCCTAGAAGAATATAATGGAGAAAGATTTTGTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGT 1070
||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAATTTCCCTAGAAGAATATAAAGGAGAAAGGTTTTGTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGT 1258
Query 1071 TTATGTTTGTGCTGTGTGCCAAAATGTTTTCTGTGTGGACTGTGATGTTTTTGTTCATGATTCTCTACACTGTT 1144
.||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1259 CTATGTTTGCACAGTGTGCCAAAATGTTTTTTGTGTGGACTGTGATGTCTTTGTTCATGACTCTCTCCATTGTT 1332
Query 1145 GCCCTGGCTGTATTCATAAGATTCCAGCTCCTTCAGGT--------------GTT------------------- 1185
|.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||| |||
Sbjct 1333 GTCCTGGCTGTATTCATAAGATCCCAACTCCTTCAGGTCCATCTCTGTAATGGTTAGAAAATTTACACCATGAA 1406
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1407 GCAGCATCCTGAATGTGGAGAAAGAAGGGCACTACCAGCCGTTTGGGAAATATGTTAGTGGAATCTCCAGACCT 1480
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1481 TCACGCATCATGACTGATCAGCTAGCTGAAAACAAACTGCTGAACTAAAGAAGTTTTCTCCTTAGTGGATGAAG 1554
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1555 ATGGAGATGGCAATGGGAACATGAACTTGGCCCTCCCATATGGTCACTGAAAAACCCCAACAAGCCAATTCAGG 1628
Query 1186 ---------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1629 ATATCCCAGAATCTTTACTCTGATGGAAAAAAAGAAGAAAGAAGAAAGAAAAAAAGAA 1686
