Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05868
• Subject: XM_017016290.1
• Aligned Length: 894
• Identities: 750
• Gaps: 144

Alignment

Query   1  ATGTTCTCTCGCGCGGGTGTCGCTGGGCTGTCGGCCTGGACCTTGCAGCCGCAATGGATTCAAGTTCGAAATAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GGCAACTTTGAAAGATATCACCAGGAGACTAAAGTCCATCAAAAACATCCAGAAAATTGCCAAGTCTATGAAAA  148
                                                                              |||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------------------------------ATGAAAA  7

Query 149  TGGTAGCGGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAGAGAGAGCTGAAACCAGCTCGAATATATGGATTGGGATCTTTA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   8  TGGTAGCGGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAGAGAGAGCTGAAACCAGCTCGAATATATGGATTGGGATCTTTA  81

Query 223  GCTCTGTATGAAAAAGCTGATATCAAGGGGCCTGAAGACAAGAAGAAACACCTCCTTATTGGTGTGTCCTCAGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  82  GCTCTGTATGAAAAAGCTGATATCAAGGGGCCTGAAGACAAGAAGAAACACCTCCTTATTGGTGTGTCCTCAGA  155

Query 297  TCGAGGACTGTGTGGTGCTATTCATTCCTCCATTGCTAAACAGATGAAAAGCGAGGTTGCTACACTAACAGCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156  TCGAGGACTGTGTGGTGCTATTCATTCCTCCATTGCTAAACAGATGAAAAGCGAGGTTGCTACACTAACAGCAG  229

Query 371  CTGGGAAAGAAGTTATGCTTGTTGGAATTGGTGACAAAATCAGAGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230  CTGGGAAAGAAGTTATGCTTGTTGGAATTGGTGACAAAATCAGAGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAG  303

Query 445  TTTCTGGTGGCATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAGCCCCCCACTTTTGGAGATGCGTCAGTCATTGCCCTTGAATT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304  TTTCTGGTGGCATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAGCCCCCCACTTTTGGAGATGCGTCAGTCATTGCCCTTGAATT  377

Query 519  ACTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCCATCATCTTTAATAAATTCAGGTCTGTCATCTCCTATAAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378  ACTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCCATCATCTTTAATAAATTCAGGTCTGTCATCTCCTATAAGA  451

Query 593  CAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCCCTTAATACCGTTGCAAGTGCTGACAGCATGAGTATCTATGACGATATTGAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452  CAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCCCTTAATACCGTTGCAAGTGCTGACAGCATGAGTATCTATGACGATATTGAT  525

Query 667  GCTGACGTGCTGCAAAATTACCAAGAATACAATCTGGCCAACATCATCTACTACTCTCTGAAGGAGTCCACCAC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526  GCTGACGTGCTGCAAAATTACCAAGAATACAATCTGGCCAACATCATCTACTACTCTCTGAAGGAGTCCACCAC  599

Query 741  TAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCCAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600  TAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCCAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGA  673

Query 815  CATTGACATTCAACCGTACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAAGAGTTGATTGAAATTATCTCTGGTGCTGCAGCT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674  CATTGACATTCAACCGTACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAAGAGTTGATTGAAATTATCTCTGGTGCTGCAGCT  747

Query 889  CTGGAT  894
           |||   
Sbjct 748  CTG---  750