Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05903
• Subject: NM_001725.3
• Aligned Length: 1461
• Identities: 1447
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGAACTTGGCCAGGGGCCCTTGCAACGCGCCGAGATGGGCGTCCCTGATGGTGCTGGTCGCCATAGG  74
                        .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------ATGGCCAGGGGCCCTTGCAACGCGCCGAGATGGGCGTCCCTGATGGTGCTGGTCGCCATAGG  62

Query   75  CACCGCCGTGACAGCGGCCGTCAACCCTGGCGTCGTGGTCAGGATCTCCCAGAAGGGCCTGGACTACGCCAGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  CACCGCCGTGACAGCGGCCGTCAACCCTGGCGTCGTGGTCAGGATCTCCCAGAAGGGCCTGGACTACGCCAGCC  136

Query  149  AGCAGGGGACGGCCGCTCTGCAGAAGGAGCTGAAGAGGATCAAGATTCCTGACTACTCAGACAGCTTTAAGATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  AGCAGGGGACGGCCGCTCTGCAGAAGGAGCTGAAGAGGATCAAGATTCCTGACTACTCAGACAGCTTTAAGATC  210

Query  223  AAGCATCTTGGGAAGGGGCATTATAGCTTCTACAGCATGGACATCCGTGAATTCCAGCTTCCCAGTTCCCAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  AAGCATCTTGGGAAGGGGCATTATAGCTTCTACAGCATGGACATCCGTGAATTCCAGCTTCCCAGTTCCCAGAT  284

Query  297  AAGCATGGTGCCCAATGTGGGCCTTAAGTTCTCCATCAGCAACGCCAATATCAAGATCAGCGGGAAATGGAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  AAGCATGGTGCCCAATGTGGGCCTTAAGTTCTCCATCAGCAACGCCAATATCAAGATCAGCGGGAAATGGAAGG  358

Query  371  CACAAAAGAGATTCTTAAAAATGAGCGGCAATTTTGACCTGAGCATAGAAGGCATGTCCATTTCGGCTGATCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  CACAAAAGAGATTCTTAAAAATGAGCGGCAATTTTGACCTGAGCATAGAAGGCATGTCCATTTCGGCTGATCTG  432

Query  445  AAGCTGGGCAGTAACCCCACGTCAGGCAAGCCCACCATCACCTGCTCCAGCTGCAGCAGCCACATCAACAGTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  AAGCTGGGCAGTAACCCCACGTCAGGCAAGCCCACCATCACCTGCTCCAGCTGCAGCAGCCACATCAACAGTGT  506

Query  519  CCACGTGCACATCTCAAAGAGCAAAGTGGGGTGGCTGATCCAACTCTTCCACAAAAAAATTGAGTCTGCGCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  CCACGTGCACATCTCAAAGAGCAAAGTGGGGTGGCTGATCCAACTCTTCCACAAAAAAATTGAGTCTGCGCTTC  580

Query  593  GAAACAAGATGAACAGCCAGGTCTGCGAGAAAGTGACCAATTCTGTATCCTCCAAGCTGCAACCTTATTTCCAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  581  GAAACAAGATGAACAGCCAGGTCTGCGAGAAAGTGACCAATTCTGTATCCTCCGAGCTGCAACCTTATTTCCAG  654

Query  667  ACTCTGCCAGTAATGACCAAAATAGATTCTGTGGCTGGAATCAACTATGGTCTGGTGGCACCTCCAGCAACCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  ACTCTGCCAGTAATGACCAAAATAGATTCTGTGGCTGGAATCAACTATGGTCTGGTGGCACCTCCAGCAACCAC  728

Query  741  GGCTGAGACCCTGGATGTACAGATGAAGGGGGAGTTTTACAGTGAGAACCACCACAATCCACCTCCCTTTGCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GGCTGAGACCCTGGATGTACAGATGAAGGGGGAGTTTTACAGTGAGAACCACCACAATCCACCTCCCTTTGCTC  802

Query  815  CACCAGTGATGGAGTTTCCCGCTGCCCATGACCGCATGGTATACCTGGGCCTCTCAGACTACTTCTTCAACACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  CACCAGTGATGGAGTTTCCCGCTGCCCATGACCGCATGGTATACCTGGGCCTCTCAGACTACTTCTTCAACACA  876

Query  889  GCCGGGCTTGTATACCAAGAGGCTGGGGTCTTGAAGATGACCCTTAGAGATGACATGATTCCAAAGGAGTCCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GCCGGGCTTGTATACCAAGAGGCTGGGGTCTTGAAGATGACCCTTAGAGATGACATGATTCCAAAGGAGTCCAA  950

Query  963  ATTTCGACTGACAACCAAGTTCTTTGGAACCTTCCTACCTGAGGTGGCCAAGAAGTTTCCCAACATGAAGATAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  ATTTCGACTGACAACCAAGTTCTTTGGAACCTTCCTACCTGAGGTGGCCAAGAAGTTTCCCAACATGAAGATAC  1024

Query 1037  AGATCCATGTCTCAGCCTCCACCCCGCCACACCTGTCTGTGCAGCCCACCGGCCTTACCTTCTACCCTGCCGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  AGATCCATGTCTCAGCCTCCACCCCGCCACACCTGTCTGTGCAGCCCACCGGCCTTACCTTCTACCCTGCCGTG  1098

Query 1111  GATGTCCAGGCCTTTGCCGTCCTCCCCAACTCCTCCCTGGCTTCCCTCTTCCTGATTGGCATGCACACAACTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GATGTCCAGGCCTTTGCCGTCCTCCCCAACTCCTCCCTGGCTTCCCTCTTCCTGATTGGCATGCACACAACTGG  1172

Query 1185  TTCCATGGAGGTCAGCGCCGAGTCCAACAGGCTTGTTGGAGAGCTCAAGCTGGATAGGCTGCTCCTGGAACTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  TTCCATGGAGGTCAGCGCCGAGTCCAACAGGCTTGTTGGAGAGCTCAAGCTGGATAGGCTGCTCCTGGAACTGA  1246

Query 1259  AGCACTCAAATATTGGCCCCTTCCCGGTTGAATTGCTGCAGGATATCATGAACTACATTGTACCCATTCTTGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  AGCACTCAAATATTGGCCCCTTCCCGGTTGAATTGCTGCAGGATATCATGAACTACATTGTACCCATTCTTGTG  1320

Query 1333  CTGCCCAGGGTTAACGAGAAACTACAGAAAGGCTTCCCTCTCCCGACGCCGGCCAGAGTCCAGCTCTACAACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  CTGCCCAGGGTTAACGAGAAACTACAGAAAGGCTTCCCTCTCCCGACGCCGGCCAGAGTCCAGCTCTACAACGT  1394

Query 1407  AGTGCTTCAGCCTCACCAGAACTTCCTGCTGTTCGGTGCAGACGTTGTCTATAAA  1461
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  AGTGCTTCAGCCTCACCAGAACTTCCTGCTGTTCGGTGCAGACGTTGTCTATAAA  1449