Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05944
• Subject: NM_001287390.2
• Aligned Length: 1554
• Identities: 1116
• Gaps: 438

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTCAGGACTGCAGCAGCCATCTCTGTGCACCTGGTGGGGCCCCTTCAGGGAAGGAAGGCTGGAGCCCCACT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACTTGGTTCTTGCACCAGACTCAGGTGGCTGAGAAGAATGTTGGATCCCCAGCTCCACGGCCCACCAGCCATC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGGACTGGCAAACCCACAGGAACGGAAGGTTCCTCAGGGACCACAAAGCCCATGTGAGGTCCCTGCTGCTGAA  222

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGCCAAACAGCT  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  223  GGGATTCTGAGGACAGGAGGAGCCAAATTACCTATCCAGGGTCACCCAGCCAAGCTCGCCATGGCCAAACAGCT  296

Query   15  GCAGGCCCGAAGGCTAGACGGGATCGACTACAACCCCTGGGTGGAGTTTGTGAAACTGGCCAGTGAGCATGACG  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGCCCGAAGGCTAGACGGGATCGACTACAACCCCTGGGTGGAGTTTGTGAAACTGGCCAGTGAGCATGACG  370

Query   89  TCGTGAACTTGGGCCAGGGCTTCCCGGATTTCCCACCACCAGACTTTGCCGTGGAAGCCTTTCAGCACGCTGTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGTGAACTTGGGCCAGGGCTTCCCGGATTTCCCACCACCAGACTTTGCCGTGGAAGCCTTTCAGCACGCTGTC  444

Query  163  AGTGGAGACTTCATGCTTAACCAGTACACCAAGACATTT-----------------------------------  201
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  445  AGTGGAGACTTCATGCTTAACCAGTACACCAAGACATTTGGTTACCCACCACTGACGAAGATCCTGGCAAGTTT  518

Query  202  --------------------------------------------------------------------------  201
                                                                                      
Sbjct  519  CTTTGGGGAGCTGCTGGGTCAGGAGATAGACCCGCTCAGGAATGTGCTGGTGACTGTTGGTGGCTATGGGGCCC  592

Query  202  -----------------------------------------GTCATCATCATCGAACCCTTTTTTGACTGCTAC  234
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTTCACAGCCTTCCAGGCCCTGGTGGACGAAGGAGACGAGGTCATCATCATCGAACCCTTTTTTGACTGCTAC  666

Query  235  GAGCCCATGACAATGATGGCAGGGGGTCGTCCTGTGTTTGTGTCCCTGAAGCCGGGTCCCATCCAGAATGGAGA  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCCCATGACAATGATGGCAGGGGGTCGTCCTGTGTTTGTGTCCCTGAAGCCGGGTCCCATCCAGAATGGAGA  740

Query  309  ACTGGGTTCCAGCAGCAACTGGCAGCTGGACCCCATGGAGCTGGCCGGCAAATTCACATCACGCACCAAAGCCC  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTGGGTTCCAGCAGCAACTGGCAGCTGGACCCCATGGAGCTGGCCGGCAAATTCACATCACGCACCAAAGCCC  814

Query  383  TGGTCCTCAACACCCCCAACAACCCCCTGGGCAAGGTGTTCTCCAGGGAAGAGCTGGAGCTGGTGGCCAGCCTT  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTCCTCAACACCCCCAACAACCCCCTGGGCAAGGTGTTCTCCAGGGAAGAGCTGGAGCTGGTGGCCAGCCTT  888

Query  457  TGCCAGCAGCATGACGTGGTGTGTATCACTGATGAAGTCTACCAGTGGATGGTCTACGACGGGCACCAGCACAT  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCCAGCAGCATGACGTGGTGTGTATCACTGATGAAGTCTACCAGTGGATGGTCTACGACGGGCACCAGCACAT  962

Query  531  CAGCATTGCCAGCCTCCCTGGCATGTGGGAACGGACCCTGACCATCGGCAGCGCCGGCAAGACCTTCAGCGCCA  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCATTGCCAGCCTCCCTGGCATGTGGGAACGGACCCTGACCATCGGCAGCGCCGGCAAGACCTTCAGCGCCA  1036

Query  605  CTGGCTGGAAGGTGGGCTGGGTCCTGGGTCCAGATCACATCATGAAGCACCTGCGGACCGTGCACCAGAACTCC  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGCTGGAAGGTGGGCTGGGTCCTGGGTCCAGATCACATCATGAAGCACCTGCGGACCGTGCACCAGAACTCC  1110

Query  679  GTCTTCCACTGCCCCACGCAGAGCCAGGCTGCAGTAGCCGAGAGCTTTGAACGGGAGCAGCTGCTCTTCCGCCA  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCTTCCACTGCCCCACGCAGAGCCAGGCTGCAGTAGCCGAGAGCTTTGAACGGGAGCAGCTGCTCTTCCGCCA  1184

Query  753  ACCCAGCAGCTACTTTGTGCAGTTCCCGCAGGCCATGCAGCGCTGCCGTGACCACATGATACGTAGCCTACAGT  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCCAGCAGCTACTTTGTGCAGTTCCCGCAGGCCATGCAGCGCTGCCGTGACCACATGATACGTAGCCTACAGT  1258

Query  827  CAGTGGGCCTGAAGCCCATCATCCCTCAGGGCAGCTACTTCCTCATCACAGACATCTCAGACTTCAAGAGGAAG  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTGGGCCTGAAGCCCATCATCCCTCAGGGCAGCTACTTCCTCATCACAGACATCTCAGACTTCAAGAGGAAG  1332

Query  901  ATGCCTGACTTGCCTGGAGCTGTGGATGAGCCCTATGACAGACGCTTCGTCAAGTGGATGATCAAGAACAAGGG  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGCCTGACTTGCCTGGAGCTGTGGATGAGCCCTATGACAGACGCTTCGTCAAGTGGATGATCAAGAACAAGGG  1406

Query  975  CTTGGTGGCCATCCCTGTCTCCATCTTCTATAGTGTGCCACATCAGAAGCACTTTGACCACTATATCCGCTTCT  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTGGTGGCCATCCCTGTCTCCATCTTCTATAGTGTGCCACATCAGAAGCACTTTGACCACTATATCCGCTTCT  1480

Query 1049  GTTTTGTGAAGGATGAAGCCACGCTCCAGGCCATGGACGAGAAGCTGCGGAAGTGGAAGGTGGAACTCTGGCCC  1122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1481  GTTTTGTGAAGGATGAAGCCACGCTCCAGGCCATGGACGAGAAGCTGCGGAAGTGGAAGGTGGAACTC------  1548