Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05976
• Subject: XM_011248295.1
• Aligned Length: 2168
• Identities: 1798
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT  74
            |||.||.|.||||                                                   ||.||||   
Sbjct    1  ATGAAGTCAAGAA---------------------------------------------------CAAAAGA---  20

Query   75  GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTG--AGGACCAG--  144
             .||    ||.||||||          |||        ||.||.|.||| ||||||.||.||  .||..|.|  
Sbjct   21  -AAC----CTGCTGGAT----------AGT--------TCTATTACCCA-CTGAATGCAATGTATGGTGCTGTC  70

Query  145  --------TCAATTCTAAACT-------TGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGT  203
                    ||.|||    |||       |||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.|||||
Sbjct   71  TCTGTGGCTCCATT----ACTGATGATGTGACCTTCAATGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGT  140

Query  204  CTCGAGCCCATACTTCAAGGTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAA  277
            |||.||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..|
Sbjct  141  CTCAAGCCCACACTTCAAGGTGAACAGCGACGGCACCTTAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGA  214

Query  278  CTCTGTTCGTCCATGCACGGACCCCCCATGCGGAAGATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATC  351
            |.|||||.||||||||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  215  CCCTGTTTGTCCATGCGAGGACTCCTCATGCTGAAGACATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATC  288

Query  352  CAGGGCTCCTTGCAGGATATATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGT  425
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  CAGGGCTCCTTGCAGGATATCTTTAAATTTGCAAGGACATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGT  362

Query  426  ATCTCCCATTTTAATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACA  499
            .||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  363  GTCCCCCATCTTGATCCCAGAGAACCAGAGACAGCCCTTCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACA  436

Query  500  GGCCAGAAAGGTCCAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAAT  573
            |.||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  437  GACCCGAAGGGTCCAAGTTCCGGCTCACCGGGAAGGGAGTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAAT  510

Query  574  GAGAACACAGGGAGCGTCTCCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGA  647
            |||||||||||.||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...||||||..|||||||||.|.||||||
Sbjct  511  GAGAACACAGGCAGTGTCTCCGTGACACGGACCCTGGACAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGA  584

Query  648  GACCACTGATGTCAATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACA  721
            .|||||.||||.||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  585  AACCACGGATGCCAGTGGCAAAACTCTGGAAGGGCCAGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACA  658

Query  722  ACCGACCGATCTTTCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATG  795
            ||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  659  ACAGACCCATCTTCCGGGAAGGCCCTTACATCGGCCATGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATG  732

Query  796  CGGATGACAGCCTTTGATGCAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGAC  869
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||
Sbjct  733  CGGATGACAGCGTTTGATGCAGATGACCCGGCTACTGACAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGAC  806

Query  870  GCCTGACAAGCCATCTCCCAACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTG  943
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  807  GCCTGACAAGCCATCTCCTAACATGTTCTACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTG  880

Query  944  CGCTGCTGGACCGAGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTG  1017
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct  881  CGCTGCTGGACCGGGAGACTCTGGAAAACCCCAAGTATGAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTG  954

Query 1018  GATGTTGGATTAACAGGCACGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCAC  1091
            |||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  GATGTCGGACTGACAGGCACAGCCACAGCCACCATCGTGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCAC  1028

Query 1092  CAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGG  1165
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1029  CAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTGGAGGAGGGAGCTGTGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAG  1102

Query 1166  ATGACCCCGCCACAGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATC  1239
            |.|||||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1103  ACGACCCTACCACAGGAGCCTGGAGGGCTGCATACACCATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATC  1176

Query 1240  CACACCAACCCTCAAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCA  1313
            |||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1177  CACACCAACCCACAGACCAACGAGGGCATGCTCTCTGTGGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCA  1250

Query 1314  CACCCTGCTGATCAAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCA  1387
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1251  CACCCTGCTGATCAAAGTGGAGAATGAGGACCCACTGGTACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAA  1324

Query 1388  CCGTCCACATCACTGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAG  1461
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 1325  CTGTCCACATCACAGTCCTGGATGTCAACGAGGGACCAGTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAG  1398

Query 1462  GAGGACCTCTCTGTGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCAT  1535
            |||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1399  GAGAACATCTCTGTGGGCAGTGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTAT  1472

Query 1536  CAGGTATTCTGTTTACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAG  1609
            ||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1473  CAGGTACTCTATCTACAAGGACCCAGCAGGCTGGCTGAGTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAG  1546

Query 1610  CTGTGCTGGACCGTGAGTCCACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGC  1683
            |||||.|||||||.||||||.||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1547  CTGTGTTGGACCGGGAGTCCCCATTCGTCCACAACAGTGTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGC  1620

Query 1684  AACCCTCCCGCTACGGGCACTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTA  1757
            ||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.||..|||||||
Sbjct 1621  AACCCTCCTGCAACTGGCACCGGGACTCTGCTGATAACCCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTA  1694

Query 1758  CCCCACAGTAGCTGAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATC  1831
            |||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1695  CCCAACTGTGGCTGAGGTCTGCGATGATGCCAGAAACCTCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACC  1768

Query 1832  TTCACCCGAATACAGATCCTTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCC  1905
            |||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769  TTCACCCCAACACAGACCCCTTCAAGTTTGAGATTCATAAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCC  1842

Query 1906  AAGATCAACAATACACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCAT  1979
            ||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843  AAAATCAACAACACCCACGCCCTCGTGAGCCTTCTTCAGAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCAT  1916

Query 1980  GGTGACAGATTCAGGGAAACCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATT  2053
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1917  GGTGACAGATTCAGGGAAGCCACCCATGACGAACATCACGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACT  1990

Query 2054  CCAAAGTGGACTGCAACGCGGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCT  2122
            ||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|.||||     ||||||     |.||||||.||...|||.
Sbjct 1991  CCAAAGTGGACTGCAACGGGGCTGGGGCCCTGCACCTCAG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCC  2059

Query 2123  TCAGCTTAGCTTGTCTG-----  2139
            ||||||||  |||||.|     
Sbjct 2060  TCAGCTTA--TTGTCAGGTCTG  2079