Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05976
• Subject: XM_017312550.1
• Aligned Length: 2204
• Identities: 1862
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  -----------ATGCAGCCGAGAACTCCG-------CTCGTT-------CTGTGCGTTC--------TCCTGTC  41
                       |||||||.|   .|||||       || .||       |.|||.||.|        |.|||.|
Sbjct    1  ATGGAGCACAGATGCAGCAG---CCTCCGGGATGTCCT-ATTGAGTCAGCAGTGTGTACTGGTGAAATTCTGGC  70

Query   42  C----------------------CAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTTGGACTGCACTCCTGGATTT  93
            |                      .|||||||.|||.|.||.||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct   71  CATCCGCAGTGATTACAGCATGTGAGGTGCTCCTGGTCACGTCTGCAGATGATCTGGAGTGCACCCCTGGATTC  144

Query   94  CAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAATTCTAAACTTGACCTTCAG  167
            ||||.|||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|..|.||||||||||||||||.
Sbjct  145  CAGCGGAAAGTGTTACACATCCACCAGCCTGCCGAATTCATCGAGGACCAGCCTGTCCTAAACTTGACCTTCAA  218

Query  168  TGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAGGTGAACAGCGATGGCGGCT  241
            ||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||..||
Sbjct  219  TGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGTCTCAAGCCCACACTTCAAGGTGAACAGCGACGGCACCT  292

Query  242  TAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGCACGGACCCCCCATGCGGAAGAT  315
            ||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||..||||.||.|||||.|||||.
Sbjct  293  TAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGACCCTGTTTGTCCATGCGAGGACTCCTCATGCTGAAGAC  366

Query  316  ATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATATATTTAAATTTGCAAGAAC  389
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  367  ATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATATCTTTAAATTTGCAAGGAC  440

Query  390  TTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTT  463
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  441  ATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTGTCCCCCATCTTGATCCCAGAGAACCAGAGACAGCCCT  514

Query  464  TCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTCCAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGA  537
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  515  TCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACAGACCCGAAGGGTCCAAGTTCCGGCTCACCGGGAAGGGA  588

Query  538  GTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGAGCGTCTCCATGACACGGACCTTGGA  611
            |||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  589  GTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGCAGTGTCTCCGTGACACGGACCCTGGA  662

Query  612  CAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTCAATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGG  685
            |||||||...||||||..|||||||||.|.||||||.|||||.||||.||.||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  663  CAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGAAACCACGGATGCCAGTGGCAAAACTCTGGAAGGGCCAG  736

Query  686  TGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTTTCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCAC  759
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  737  TGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACAACAGACCCATCTTCCGGGAAGGCCCTTACATCGGCCAT  810

Query  760  GTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATGCAGATGACCCAGCCACCGA  833
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  811  GTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCGTTTGATGCAGATGACCCGGCTACTGA  884

Query  834  TAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCCAACATGTTCTACATCGATC  907
            .|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  885  CAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCTAACATGTTCTACATCGATC  958

Query  908  CTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGAGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTAT  981
            |.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  959  CCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGGGAGACTCTGGAAAACCCCAAGTAT  1032

Query  982  GAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAACAGGCACGGCCACAGCCACGATCAT  1055
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 1033  GAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTGGATGTCGGACTGACAGGCACAGCCACAGCCACCATCGT  1106

Query 1056  GATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTG  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1107  GATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTGGAGGAGGGAGCTG  1180

Query 1130  TGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCACAGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACC  1203
            ||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1181  TGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAGACGACCCTACCACAGGAGCCTGGAGGGCTGCATACACC  1254

Query 1204  ATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTCAAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGT  1277
            ||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1255  ATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCACAGACCAACGAGGGCATGCTCTCTGT  1328

Query 1278  TGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATCAAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCG  1351
            .|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1329  GGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCACACCCTGCTGATCAAAGTGGAGAATGAGGACCCACTGG  1402

Query 1352  TACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCACTGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCA  1425
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1403  TACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAACTGTCCACATCACAGTCCTGGATGTCAACGAGGGACCA  1476

Query 1426  GTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTGTGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAA  1499
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1477  GTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAGGAGAACATCTCTGTGGGCAGTGTGCTGCTGACAGTGAA  1550

Query 1500  TGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTTTACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGA  1573
            ||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1551  TGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTATCAGGTACTCTATCTACAAGGACCCAGCAGGCTGGCTGA  1624

Query 1574  ATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCGTGAGTCCACATTTGTCGACAACAGC  1647
            .|||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.||||.|||.|||||||.
Sbjct 1625  GTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAGCTGTGTTGGACCGGGAGTCCCCATTCGTCCACAACAGT  1698

Query 1648  GTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTACGGGCACTGGGACTTTGCTGATAAC  1721
            ||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1699  GTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGCAACCCTCCTGCAACTGGCACCGGGACTCTGCTGATAAC  1772

Query 1722  CCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCTGAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACC  1795
            |||.||||||.|.||||||||.||.||..||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1773  CCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTACCCAACTGTGGCTGAGGTCTGCGATGATGCCAGAAACC  1846

Query 1796  TCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATACAGATCCTTTCAAATTTGAAATCCAC  1869
            ||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct 1847  TCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACCTTCACCCCAACACAGACCCCTTCAAGTTTGAGATTCAT  1920

Query 1870  AAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATACACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCA  1943
            |||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1921  AAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAAATCAACAACACCCACGCCCTCGTGAGCCTTCTTCA  1994

Query 1944  AAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAACCACCCATGACGAATATCA  2017
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1995  GAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAGCCACCCATGACGAACATCA  2068

Query 2018  CAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGCGGCGGGGGCCCTGCGCTTC  2091
            |.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|.||
Sbjct 2069  CGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACTCCAAAGTGGACTGCAACGGGGCTGGGGCCCTGCACCTC  2142

Query 2092  AGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG-----  2139
            ||     ||||||     |.||||||.||...|||.||||||||  |||||.|     
Sbjct 2143  AG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCCTCAGCTTA--TTGTCAGGTCTG  2193