Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05978
- Subject:
- NM_001349558.2
- Aligned Length:
- 2370
- Identities:
- 2363
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAAAATTACTTGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTAGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC 74
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAATTACTAGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTAGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC 74
Query 75 TGCTCACCACAGCTCCATCAAGGTGATGAGAAACCAAACCAAACACATTGAAGGTGAAACCGAAGTCCATCATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTCACCACAGCTCCATCAAGGTGATGAGAAACCAAACCAAACACATTGAAGGTGAAACCGAAGTCCATCATC 148
Query 149 GTCCCAAAAGGGGATGGGTATGGAATCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGATCCTCAGTATGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTCCCAAAAGGGGATGGGTATGGAATCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGATCCTCAGTATGTT 222
Query 223 GGAAAGCTGCACTCCAATTCTGACAAAGGTGATGGATCTGTCAAGTACATCCTTACTGGAGAGGGTGCTGGGAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAAAGCTGCACTCCAATTCTGACAAAGGTGATGGATCTGTCAAGTACATCCTTACTGGAGAGGGTGCTGGGAC 296
Query 297 TATATTTATCATTGACGATACCACGGGTGATATCCACTCAACAAAAAGCCTAGACAGAGAGCAGAAGACCCACT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATATTTATCATTGACGATACCACGGGTGATATCCACTCAACAAAAAGCCTAGACAGAGAGCAGAAGACCCACT 370
Query 371 ATGTGCTTCATGCTCAAGCTATTGATAGACGTACAAACAAACCTCTTGAGCCTGAATCCGAGTTCATCATCAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGTGCTTCATGCTCAAGCTATTGATAGACGTACAAACAAACCTCTTGAGCCTGAATCCGAGTTCATCATCAAA 444
Query 445 GTGCAAGACATCAATGACAACGCTCCAAAATTCACAGATGGACCATACATTGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGCAAGACATCAATGACAACGCTCCAAAATTCACAGATGGACCATACATTGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA 518
Query 519 TATGGGTACCTCTGTTCTACAGGTGACAGCTACTGATGCAGATGACCCTACCTATGGAAACAGCGCTCGGGTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATGGGTACCTCTGTTCTACAGGTGACAGCTACTGATGCAGATGACCCTACCTATGGAAACAGCGCTCGGGTGG 592
Query 593 TTTACAGCATTCTCCAGGGACAACCCTACTTCTCCGTCGACCCTAAAACAGGAGTTATTAGAACGGCCTTACAT 666
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTACAGCATTCTCCAAGGACAACCCTACTTCTCCGTCGACCCTAAAACAGGAGTTATTAGAACGGCCTTACAT 666
Query 667 AACATGGACGGAGAAGCCAGAGAACATTACTCCGTAGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGAGG 740
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACATGGACAGAGAAGCCAGAGAACATTACTCCGTAGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGAGG 740
Query 741 GCTTTCAGGATCTACAACAGTCAACATCACCTTAACCGATGTCAATGACAACACACCACGCTTTCCTCAAAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTTTCAGGATCTACAACAGTCAACATCACCTTAACCGATGTCAATGACAACCCACCACGCTTTCCTCAAAAAC 814
Query 815 ACTATCAGCTATATGTTCCTGAGTCAGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAGGCAAATGATGCTGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTATCAGCTATATGTTCCTGAGTCAGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAGGCAAATGATGCTGAC 888
Query 889 ACTGGCTCAAATGCTGACATGACCTACTCCATCATAAATGGTGATGGCATGGGAATATTCTCAATCTCCACTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTGGCTCAAATGCTGACATGACCTACTCCATCATAAATGGTGATGGCATGGGAATATTCTCAATCTCCACTGA 962
Query 963 CAAAGAGACCAGAGAAGGAATCCTTTCTTTAAAGAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCATATACCCTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAAGAGACCAGAGAAGGAATCCTTTCTTTAAAGAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCATATACCCTCA 1036
Query 1037 ACATAGAAGGAGCAAATACACATCTTGATTTTCGCTTTTCTCACTTGGGTCCTTTTAAAGATGCTACTATGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACATAGAAGGAGCAAATACACATCTTGATTTTCGCTTTTCTCACTTGGGTCCTTTTAAAGATGCTACTATGCTG 1110
Query 1111 AAGATCATTGTTGGGGATGTAGATGAACCACCACTATTTTCCATGCCTTCCTACCTCATGGAAGTCTACGAAAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGATCATTGTTGGGGATGTAGATGAACCACCACTATTTTCCATGCCTTCCTACCTCATGGAAGTCTACGAAAA 1184
Query 1185 TGCCAAGATTGGGACCGTCGTTGGTACAGTTTTGGCACAAGATCCTGACAGTATTAACAGCTTAGTAAGATACT 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCAAGATTGGGACCGTCGTTGGTACAGTTTTGGCACAAGATCCTGACAGTACTAACAGCTTAGTAAGATACT 1258
Query 1259 TCATCAACTACAATGTTGAAGACGACAGATTTTTCAACATTGATGCCAATACTGGGACCATTAGGACTACAAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCATCAACTACAATGTTGAAGACGACAGATTTTTCAACATTGATGCCAATACTGGGACCATTAGGACTACAAAG 1332
Query 1333 GTTCTCGACAGAGAAGAAACTCCATGGTACAACATCACAGTCACTGCTTCAGAAATTGATAATCCTGATTTGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTCTCGACAGAGAAGAAACTCCATGGTACAACATCACAGTCACTGCTTCAGAAATTGATAATCCTGATTTGCT 1406
Query 1407 GAGCCATGTCACAGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCCGAACTTGCCAGGGAATATGATA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCCATGTCACAGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCCGAACTTGCCAGGGAATATGATA 1480
Query 1481 TTATTGTATGTGAAAATTCTAAGCCTGGCCAGGTTATTCATACCATCAGTGCCACTGATAAAGATGATTTTGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTATTGTATGTGAAAATTCTAAGCCTGGCCAGGTTATTCATACCATCAGTGCCACTGATAAAGATGATTTTGCC 1554
Query 1555 AATGGACCAAGGTTTAACTTCTTTCTTGATGAGCGCCTGCCTGTAAATCCAAACTTCACTCTGAAGGACAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AATGGACCAAGGTTTAACTTCTTTCTTGATGAACGCCTGCCTGTAAATCCAAACTTCACTCTGAAGGACAATGA 1628
Query 1629 AGATAACACAGCCAGCATTCTGACAAGGCGGAGGAGATTTAGTCGAACTGTTCAGGATGTGTATTATCTGCCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGATAACACAGCCAGCATTCTGACAAGGCGGAGGAGATTTAGTCGAACTGTTCAGGATGTGTATTATCTGCCCA 1702
Query 1703 TTATGATCTCTGATGGTGGAATCCCCTCTCTCAGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTATGATCTCTGATGGTGGAATCCCCTCTCTCAGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG 1776
Query 1777 AGAGATGGGCGTGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCGGCTGGTTTGAGTACAGGAGCCTTAAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGAGATGGGCGTGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCGGCTGGTTTGAGTACAGGAGCCTTAAT 1850
Query 1851 CGCTATTCTTCTCTGTGTTCTCATTCTCCTGGCAATTGTGGTACTTTTTATCACCCTGAGGCGCAGCAAAAAAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGCTATTCTTCTCTGTGTTCTCATTCTCCTGGCAATTGTGGTACTTTTTATCACCCTGAGGCGCAGCAAAAAAG 1924
Query 1925 AGCCCTTGATCATTTCAGAAGAGGATGTACGGGAGAACGTGGTCACCTATGATGATGAAGGAGGCGGAGAGGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGCCCTTGATCATTTCAGAAGAGGATGTACGGGAGAACGTGGTCACCTATGATGATGAAGGAGGCGGAGAGGAA 1998
Query 1999 GACACAGGGGCCTTTGACATCACAGCCTTGAGGAATCCTTCTGCTGCTGAGGAGCTCAAGTACCGGAGGGATAT 2072
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GACACAGAGGCCTTTGACATCACAGCCTTGAGGAATCCTTCTGCTGCTGAGGAGCTCAAGTACCGGAGGGATAT 2072
Query 2073 CAGACCTGAAGTGAAGCTCACTCCCAGACACCAGACATCATCCACCCTGGAAAGCATAGATGTTCAGGAATTTA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAGACCTGAAGTGAAGCTCACTCCCAGACACCAGACATCATCCACCCTGGAAAGCATAGATGTTCAGGAATTTA 2146
Query 2147 TTAAGCAAAGACTGGCAGAAGCAGACCTAGACCCTAGCGTTCCCCCTTATGACTCTCTTCAGACTTATGCCTAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTAAGCAAAGACTGGCAGAAGCAGACCTAGACCCTAGCGTTCCCCCTTATGACTCTCTTCAGACTTATGCCTAT 2220
Query 2221 GAGGGTCAGAGATCAGAAGCTGGGTCTATCAGCTCGCTGGATTCAGCAACGACACAATCAGACCAGGATTATCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAGGGTCAGAGATCAGAAGCTGGGTCTATCAGCTCGCTGGATTCAGCAACGACACAATCAGACCAGGATTATCA 2294
Query 2295 CTACCTTGGAGACTGGGGACCCGAGTTTAAAAAGTTAGCTGAACTCTATGGAGAAATAGAATCTGAAAGAACAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTACCTTGGAGACTGGGGACCCGAGTTTAAAAAGTTAGCTGAACTCTATGGAGAAATAGAATCTGAAAGAACAA 2368
Query 2369 CT 2370
||
Sbjct 2369 CT 2370