Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05978
• Subject: XM_006520097.3
• Aligned Length: 2370
• Identities: 1532
• Gaps: 645

Alignment

Query    1  ATGAAAATTACTTGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTAGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC  74
            ||||.||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAATTACGAGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTCGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC  74

Query   75  TGCTCACCACAGCTCCATCAAGGTGATGAGAAACCAAACCAAACACATTGAAGGTGAAACCGAAGTCCATCATC  148
            ||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  TGCTCACCACAGCTCCATTAAGGTGACCAGAAACCAAACCAAACACACTGAAGGGGAAACTGAAGTACACCATC  148

Query  149  GTCCCAAAAGGGGATGGGTATGGAATCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGATCCTCAGTATGTT  222
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  GTCCCAAGAGGGGATGGGTATGGAACCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGACCCACAGTATGTT  222

Query  223  GGAAAGCTGCACTCCAATTCTGACAAAGGTGATGGATCTGTCAAGTACATCCTTACTGGAGAGGGTGCTGGGAC  296
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  223  GGAAAACTGCACTCCAACTCCGACAAAGGTGATGGTTCTGTCAAGTACATCCTGACTGGAGAAGGGGCCGGGAC  296

Query  297  TATATTTATCATTGACGATACCACGGGTGATATCCACTCAACAAAAAGCCTAGACAGAGAGCAGAAGACCCACT  370
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TATATTTATCATTGATGACACCACAGGTGACATCCACTCAACCAAAAGCCTGGACAGAGAGCAGAAGACTCACT  370

Query  371  ATGTGCTTCATGCTCAAGCTATTGATAGACGTACAAACAAACCTCTTGAGCCTGAATCCGAGTTCATCATCAAA  444
            |||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTGCTCCATGCCCAGGCTATTGACAGACGGACAAACAAGCCTCTTGAACCTGAGTCTGAGTTCATCATCAAA  444

Query  445  GTGCAAGACATCAATGACAACGCTCCAAAATTCACAGATGGACCATACATTGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA  518
            ||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCAAGATATTAATGACAATGCCCCAAAGTTCACAGATGGACCATACATCGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA  518

Query  519  TATGGGTACCTCTGTTCTACAGGTGACAGCTACTGATGCAGATGACCCTACCTATGGAAACAGCGCTCGGGTGG  592
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  519  TATGGGTACCTCTGTTCTGCAGGTGACAGCTACAGATGCAGATGACCCCACCTATGGGAACAGTGCTCGAGTTG  592

Query  593  TTTACAGCATTCTCCAGGGACAACCCTACTTCTCCGTCGACCCTAAAACAGGAGTTATTAGAACGGCCTTACAT  666
            |||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||.||||.||.|||||.
Sbjct  593  TTTACAGTATCCTGCAAGGACAACCTTATTTCTCTGTAGATCCTAAAACAGGAGTCATTCGAACAGCTTTACAC  666

Query  667  AACATGGACGGAGAAGCCAGAGAACATTACTCCGTAGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGAGG  740
            ||||||||..|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AACATGGATAGAGAAGCCAGAGAGCATTACTCAGTGGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGCGG  740

Query  741  GCTTTCAGGATCTACAACAGTCAACATCACCTTAACCGATGTCAATGACAACACACCACGCTTTCCTCAAAAAC  814
            .|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||
Sbjct  741  ACTTTCTGGATCCACCACTGTCAATATTACCTTGACTGATGTCAATGACAACCCACCACGGTTCCCACAGAAAC  814

Query  815  ACTATCAGCTATATGTTCCTGAGTCAGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAGGCAAATGATGCTGAC  888
            |||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  ACTATCAACTGTATGTTCCTGAGTCTGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAAGCAAATGATGCAGAC  888

Query  889  ACTGGCTCAAATGCTGACATGACCTACTCCATCATAAATGGTGATGGCATGGGAATATTCTCAATCTCCACTGA  962
            ||.||.||||||||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||.||.|||.|.|||||.||||||||.||
Sbjct  889  ACAGGATCAAATGCAGATATGACCTACTCCATCACTAATGGAGACGGGATTGGAGTGTTCTCTATCTCCACGGA  962

Query  963  CAAAGAGACCAGAGAAGGAATCCTTTCTTTAAAGAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCATATACCCTCA  1036
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  963  CAAGGACACCAGAGAAGGAATACTTTCCTTAAAAAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCTTACACACTCA  1036

Query 1037  ACATAGAAGGAGCAAATACACATCTTGATTTTCGCTTTTCTCACTTGGGTCCTTTTAAAGATGCTACTATGCTG  1110
            ||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1037  ACATTGAAGGAGCAAACACACATCTGGATTTCCGTTTTTCCCACTTGGGTCCATTTAAGGATGCCACCATGCTG  1110

Query 1111  AAGATCATTGTTGGGGATGTAGATGAACCACCACTATTTTCCATGCCTTCCTACCTCATGGAAGTCTACGAAAA  1184
            |||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  AAGGTTATTGTTGGGGATGTGGATGAGCCACCACTCTTTTCTATGCCTTCCTATGTCATGGAAGTCTATGAAAA  1184

Query 1185  TGCCAAGATTGGGACCGTCGTTGGTACAGTTTTGGCACAAGATCCTGACAGTATTAACAGCTTAGTAAGATACT  1258
            |||||||||||||||..|.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||||||..|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  TGCCAAGATTGGGACAATTGTTGGCACTGTCTTGGCTCAGGATCCAGACAGTGCTAACAGCTTAGTAAGGTATT  1258

Query 1259  TCATCAACTACAATGTTGAAGACGACAGATTTTTCAACATTGATGCCAATACTGGGACCATTAGGACTACAAAG  1332
            |||||||..|||.|..||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||..||||.
Sbjct 1259  TCATCAATCACAGTACTGAAGAGGAGAGATTTTTCAATATTGATGCCAATACTGGAACCATTAAGACATCAAAA  1332

Query 1333  GTTCTCGACAGAGAAGAAACTCCATGGTACAACATCACAGTCACTGCTTCAGAAATTGATAATCCTGATTTGCT  1406
            ||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||..||.||||||||||||||
Sbjct 1333  GTACTGGATAGAGAAGAAACACCATGGTACAATATCACAGTGACTGCTTCAGAAAACGACAATCCTGATTTGCT  1406

Query 1407  GAGCCATGTCACAGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCCGAACTTGCCAGGGAATATGATA  1480
            ||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCCATGTCTCCGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCTGAACTTGCCAGGGAATATGATA  1480

Query 1481  TTATTGTATGTGAAAATTCTAAGCCTGGCCAGGTTATTCATACCATCAGTGCCACTGATAAAGATGATTTTGCC  1554
            ||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  TTGTTGTCTGTGAGAATTCTAAGCCTGGTCAGGTTATCCACACCATCACTGCCACTGATAAAGATGACTTTGCC  1554

Query 1555  AATGGACCAAGGTTTAACTTCTTTCTTGATGAGCGCCTGCCTGTAAATCCAAACTTCACTCTGAAGGACAATGA  1628
            ||||||||.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555  AATGGACCGAGATTTCATTTTTTTCTTGATGAGCGCCTGCCCATGAACCCAAATTTCACACTTAAGGACAATGA  1628

Query 1629  AGATAACACAGCCAGCATTCTGACAAGGCGGAGGAGATTTAGTCGAACTGTTCAGGATGTGTATTATCTGCCCA  1702
                                                                                      
Sbjct 1629  --------------------------------------------------------------------------  1628

Query 1703  TTATGATCTCTGATGGTGGAATCCCCTCTCTCAGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG  1776
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  --------------------------------AGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG  1670

Query 1777  AGAGATGGGCGTGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCGGCTGGTTTGAGTACAGGAGCCTTAAT  1850
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||                   
Sbjct 1671  AGAGATGGGCGCGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCCGCTGGTT-------------------  1725

Query 1851  CGCTATTCTTCTCTGTGTTCTCATTCTCCTGGCAATTGTGGTACTTTTTATCACCCTGAGGCGCAGCAAAAAAG  1924
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 1925  AGCCCTTGATCATTTCAGAAGAGGATGTACGGGAGAACGTGGTCACCTATGATGATGAAGGAGGCGGAGAGGAA  1998
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 1999  GACACAGGGGCCTTTGACATCACAGCCTTGAGGAATCCTTCTGCTGCTGAGGAGCTCAAGTACCGGAGGGATAT  2072
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 2073  CAGACCTGAAGTGAAGCTCACTCCCAGACACCAGACATCATCCACCCTGGAAAGCATAGATGTTCAGGAATTTA  2146
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 2147  TTAAGCAAAGACTGGCAGAAGCAGACCTAGACCCTAGCGTTCCCCCTTATGACTCTCTTCAGACTTATGCCTAT  2220
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 2221  GAGGGTCAGAGATCAGAAGCTGGGTCTATCAGCTCGCTGGATTCAGCAACGACACAATCAGACCAGGATTATCA  2294
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 2295  CTACCTTGGAGACTGGGGACCCGAGTTTAAAAAGTTAGCTGAACTCTATGGAGAAATAGAATCTGAAAGAACAA  2368
                                                                                      
Sbjct 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725

Query 2369  CT  2370
              
Sbjct 1726  --  1725