Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06012
Subject:
NM_000391.4
Aligned Length:
1689
Identities:
1688
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGGACTCCAAGCCTGCCTCCTAGGGCTCTTTGCCCTCATCCTCTCTGGCAAATGCAGTTACAGCCCGGAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACTCCAAGCCTGCCTCCTAGGGCTCTTTGCCCTCATCCTCTCTGGCAAATGCAGTTACAGCCCGGAGCC  74

Query   75  CGACCAGCGGAGGACGCTGCCCCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGTGCGGACCCTGAGGAAGAGCTGAGTCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGACCAGCGGAGGACGCTGCCCCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGTGCGGACCCTGAGGAAGAGCTGAGTCTCA  148

Query  149  CCTTTGCCCTGAGACAGCAGAATGTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCCAGCTCTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTTTGCCCTGAGACAGCAGAATGTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCCAGCTCTCCT  222

Query  223  CAATACGGAAAATACCTGACCCTAGAGAATGTGGCTGATCTGGTGAGGCCATCCCCACTGACCCTCCACACGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAATACGGAAAATACCTGACCCTAGAGAATGTGGCTGATCTGGTGAGGCCATCCCCACTGACCCTCCACACGGT  296

Query  297  GCAAAAATGGCTCTTGGCAGCCGGAGCCCAGAAGTGCCATTCTGTGATCACACAGGACTTTCTGACTTGCTGGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAAAAATGGCTCTTGGCAGCCGGAGCCCAGAAGTGCCATTCTGTGATCACACAGGACTTTCTGACTTGCTGGC  370

Query  371  TGAGCATCCGACAAGCAGAGCTGCTGCTCCCTGGGGCTGAGTTTCATCACTATGTGGGAGGACCTACGGAAACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAGCATCCGACAAGCAGAGCTGCTGCTCCCTGGGGCTGAGTTTCATCACTATGTGGGAGGACCTACGGAAACC  444

Query  445  CATGTTGTAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCACAGGCCTTGGCCCCCCATGTGGACTTTGTGGGGGGACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGTTGTAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCACAGGCCTTGGCCCCCCATGTGGACTTTGTGGGGGGACT  518

Query  519  GCACCGTTTTCCCCCAACATCATCCCTGAGGCAACGTCCTGAGCCGCAGGTGACAGGGACTGTAGGCCTGCATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACCGTTTTCCCCCAACATCATCCCTGAGGCAACGTCCTGAGCCGCAGGTGACAGGGACTGTAGGCCTGCATC  592

Query  593  TGGGGGTAACCCCCTCTGTGATCCGTAAGCGATACAACTTGACCTCACAAGACGTGGGCTCTGGCACCAGCAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGGGTAACCCCCTCTGTGATCCGTAAGCGATACAACTTGACCTCACAAGACGTGGGCTCTGGCACCAGCAAT  666

Query  667  AACAGCCAAGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAGCAGTATTTCCATGACTCAGACCTGGCTCAGTTCATGCGCCTCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACAGCCAAGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAGCAGTATTTCCATGACTCAGACCTGGCTCAGTTCATGCGCCTCTT  740

Query  741  CGGTGGCAACTTTGCACATCAGGCATCAGTAGCCCGTGTGGTTGGACAACAGGGCCGGGGCCGGGCCGGGATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGGTGGCAACTTTGCACATCAGGCATCAGTAGCCCGTGTGGTTGGACAACAGGGCCGGGGCCGGGCCGGGATTG  814

Query  815  AGGCCAGTCTAGATGTGCAGTACCTGATGAGTGCTGGTGCCAACATCTCCACCTGGGTCTACAGTAGCCCTGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCCAGTCTAGATGTGCAGTACCTGATGAGTGCTGGTGCCAACATCTCCACCTGGGTCTACAGTAGCCCTGGC  888

Query  889  CGGCATGAGGGACAGGAGCCCTTCCTGCAGTGGCTCATGCTGCTCAGTAATGAGTCAGCCCTGCCACATGTGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGCATGAGGGACAGGAGCCCTTCCTGCAGTGGCTCATGCTGCTCAGTAATGAGTCAGCCCTGCCACATGTGCA  962

Query  963  TACTGTGAGCTATGGAGATGATGAGGACTCCCTCAGCAGCGCCTACATCCAGCGGGTCAACACTGAGCTCATGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTGTGAGCTATGGAGATGATGAGGACTCCCTCAGCAGCGCCTACATCCAGCGGGTCAACACTGAGCTCATGA  1036

Query 1037  AGGCTGCCGCTCGGGGTCTCACCCTGCTCTTCGCCTCAGGTGACAGTGGGGCCGGGTGTTGGTCTGTCTCTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGCTGCCGCTCGGGGTCTCACCCTGCTCTTCGCCTCAGGTGACAGTGGGGCCGGGTGTTGGTCTGTCTCTGGA  1110

Query 1111  AGACACGAGTTCCGCCCTACCTTCCCTGCCTCCAGCCCCTATGTCACCACAGTGGGAGGCACATCCTTCCAGGA  1184
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGACACCAGTTCCGCCCTACCTTCCCTGCCTCCAGCCCCTATGTCACCACAGTGGGAGGCACATCCTTCCAGGA  1184

Query 1185  ACCTTTCCTCATCACAAATGAAATTGTTGACTATATCAGTGGTGGTGGCTTCAGCAATGTGTTCCCACGGCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCTTTCCTCATCACAAATGAAATTGTTGACTATATCAGTGGTGGTGGCTTCAGCAATGTGTTCCCACGGCCTT  1258

Query 1259  CATACCAGGAGGAAGCTGTAACGAAGTTCCTGAGCTCTAGCCCCCACCTGCCACCATCCAGTTACTTCAATGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATACCAGGAGGAAGCTGTAACGAAGTTCCTGAGCTCTAGCCCCCACCTGCCACCATCCAGTTACTTCAATGCC  1332

Query 1333  AGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTGGCTGCACTTTCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACAGAGTGCCCATTCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTGGCTGCACTTTCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACAGAGTGCCCATTCC  1406

Query 1407  ATGGGTGTCCGGAACCTCGGCCTCTACTCCAGTGTTTGGGGGGATCCTATCCTTGATCAATGAGCACAGGATCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATGGGTGTCCGGAACCTCGGCCTCTACTCCAGTGTTTGGGGGGATCCTATCCTTGATCAATGAGCACAGGATCC  1480

Query 1481  TTAGTGGCCGCCCCCCTCTTGGCTTTCTCAACCCAAGGCTCTACCAGCAGCATGGGGCAGGACTCTTTGATGTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAGTGGCCGCCCCCCTCTTGGCTTTCTCAACCCAAGGCTCTACCAGCAGCATGGGGCAGGACTCTTTGATGTA  1554

Query 1555  ACCCGTGGCTGCCATGAGTCCTGTCTGGATGAAGAGGTAGAGGGCCAGGGTTTCTGCTCTGGTCCTGGCTGGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCCGTGGCTGCCATGAGTCCTGTCTGGATGAAGAGGTAGAGGGCCAGGGTTTCTGCTCTGGTCCTGGCTGGGA  1628

Query 1629  TCCTGTAACAGGCTGGGGAACACCCAACTTCCCAGCTTTGCTGAAGACTCTACTCAACCCC  1689
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCCTGTAACAGGCTGGGGAACACCCAACTTCCCAGCTTTGCTGAAGACTCTACTCAACCCC  1689