Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06056
- Subject:
- XM_011248663.2
- Aligned Length:
- 1298
- Identities:
- 1105
- Gaps:
- 67
Alignment
Query 1 ATGGAGCTGAGAGTCGGGAACAGGTACCGGCTGGGCCGGAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT 74
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGAGGGTCGGGAACAGGTACCGACTGGGCCGCAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT 74
Query 75 CGGTACGGACATTGCTGCAGGAGAAGAGGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACACCCTCAGCTCC 148
||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CGGTACGGACATTGCTGCGGGAGAAGAAGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACATCCTCAGCTCC 148
Query 149 ACATTGAGAGCAAAATCTACAAGATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCCACCATCAGATGGTGCGGGGCAGAG 222
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 ACATTGAGAGCAAGATCTACAAAATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCTACCATCAGATGGTGTGGGGCTGAG 222
Query 223 GGGGACTACAACGTCATGGTGATGGAGCTGCTGGGGCCAAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGCTCCAGGAA 296
|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 GGGGACTACAATGTCATGGTGATGGAGCTACTGGGACCCAGCCTGGAAGACCTGTTCAACTTCTGTTCAAGGAA 296
Query 297 ATTCAGCCTCAAAACCGTCCTGCTGCTTGCTGACCAAATGATCAGTCGCATCGAATACATTCATTCAAAGAACT 370
.||.||.||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GTTTAGTCTCAAAACTGTTCTGTTGCTTGCTGACCAAATGATAAGTCGTATTGAGTACATTCATTCGAAGAATT 370
Query 371 TCATCCACCGGGATGTGAAGCCAGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTGTACATCATC 444
|.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 TTATCCACCGAGATGTGAAGCCAGATAACTTCCTCATGGGGCTGGGAAAGAAAGGCAACCTGGTCTACATCATT 444
Query 445 GACTTCGGGCTGGCCAAGAAGTACCGGGATGCACGCACCCACCAGCACATCCCCTATCGTGAGAACAAGAACCT 518
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GACTTTGGGCTGGCCAAGAAGTATCGGGATGCACGCACCCACCAGCATATCCCCTATCGAGAGAACAAGAACCT 518
Query 519 CACGGGGACGGCGCGGTACGCCTCCATCAACACGCACCTTGGAATTGAACAATCCCGAAGAGATGACTTGGAGT 592
|||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 CACAGGGACAGCACGCTATGCCTCCATCAACACGCACCTTGGCATTGAACAATCTCGAAGGGATGACTTGGAGT 592
Query 593 CTCTGGGCTACGTGCTAATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCTGCCACCAAGAGA 666
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 CTCTGGGGTACGTGCTGATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCCGCCACCAAGAGG 666
Query 667 CAGAAATACGAAAGGATTAGCGAGAAGAAAATGTCCACCCCCATCGAAGTGTTGTGTAAAGGCTACCCTTCCGA 740
|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 667 CAGAAGTATGAGAGGATCAGTGAGAAGAAGATGTCCACTCCCATTGAAGTGCTGTGCAAGGGCTATCCTTCTGA 740
Query 741 ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTGCGTTTTGACGACAAGCCTGACTACTCGTACCTGCGGCAGC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct 741 ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTACGTTTTGATGACAAACCTGACTACTCCTACCTGAGACAGC 814
Query 815 TTTTCCGGAATCTGTTCCATCGCCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT 888
|.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTCAGAAATCTGTTCCATCGCCAAGGCTTCTCCTACGACTATGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT 888
Query 889 GCCAGCCGGGCCGCCGATGACGCCGAGCGGGAGCGCAGGGACCGAGAGGAGCGGCTGAGACACTCGCGGAACCC 962
|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.||..|.||||||||.|||||.||
Sbjct 889 GCCAGCCGGGCTGCAGATGATGCTGAGCGGGAACGCCGGGATCGAGAAGAACGATTAAGACACTCCCGGAATCC 962
Query 963 GGCTACCCGCGGCCTCCCTTCCACAGCCTCCGGCCGCCTGCGGGGGACGCAGGAAGTGGCTCCCCCCACACCCC 1036
.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 963 AGCCACTCGTGGCCTCCCTTCTACAGCTTCCGGCCGTCTGCGGGGAACCCAGGAAGTGGCTCCCCCAACGCCCC 1036
Query 1037 TCACCCCTACCTCACACACGGCTAACACCTCCCCCCGGCCTGTCTCCGGCATGGAGAGAGAGCGGAAAGTGAGT 1110
|.||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct 1037 TTACCCCTACCTCACACACGGCCAACACCTCTCCGAGGCCTGTCTCTGGCATGGAACGAGAACGGAAAGTGAGT 1110
Query 1111 ATGCGGCTGCACCGCGGGGCCCCCGTCAACATCTCCTCGTCCGACCTCACAGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT 1184
||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGCGGCTGCACCGTGGGGCCCCAGTCAACGTCTCCTCATCTGATCTCACGGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT 1184
Query 1185 GTCCACCTCACAGATTCCTGG-TCGGG----TGGCTTCCAGTGGTCT-TCAGTCTGTC---------------G 1237
|||||||||||||| || .|.|| |||| |||| ||.|.||| | |
Sbjct 1185 GTCCACCTCACAGA-----GGAGCAGGGACATGGC--------GTCTCTCCGGCTG-CACGCGGCCCGCCAAGG 1244
Query 1238 TGC-----ACCGA--------------------------- 1245
||| .||||
Sbjct 1245 TGCCCGCTGCCGACCCCAGCGCCCACGACGTACCACCTAC 1284