Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06073
• Subject: NM_000777.5
• Aligned Length: 1518
• Identities: 1343
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGATCTCATCCCAAACTTGGCCGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGATACTCCTCTATCTATA  74
            |||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74

Query   75  TGGAACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATG  148
            |||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG  148

Query  149  CTTTGTCCTTCCGTAAGGG-CTATTGGACGTTTGACATGGAATGTTATAAAAAGTATAGAAAAGTCTGGGGTAT  221
            .||||||||..|||.|||| || .||||..|||||||..||.||.||||||||||||.|||||.|.|||||.|.
Sbjct  149  TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCT-CTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAAC  221

Query  222  TTATGACTGTCAACAGCCTATGCTGGCTATCACAGATCCCGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTT  295
            .|||||..||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GTATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTT  295

Query  296  ATTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTCGGGCCAGTGGGATTTATGAAAAATGCCATCTCTATAGCTGAGGAT  369
            ||||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  296  ATTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGAT  369

Query  370  GAAGAATGGAAGAGAATACGATCATTGCTGTCTCCAACATTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTAT  443
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct  370  GAAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCAT  443

Query  444  CATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGA  517
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  444  CATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGA  517

Query  518  AACACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAGCATCGACTCTCTCAAC  591
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  518  AAGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAAC  591

Query  592  AATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTAATCCATTAGATCCATTCGTTCTCTC  665
            |||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.||||..|...|||||||||||..|||||||
Sbjct  592  AATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTC  665

Query  666  AATAAAAGTCTTTCCATTCCTTACCCCAATTCTTGAAGCATTAAATATCACTGTGTTTCCAAGAAAAGTT---A  736
            |||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||   |||||.|   |
Sbjct  666  AATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCC---AAAAGATACCA  736

Query  737  TAAGTTTTCTAACAAAATCTGTAAAACAG-ATAAAAGAAGGTCGCCTCAAAGAGACACAAAAGCACCGAGTGGA  809
            |||.||||.|||..|||||||| |||||| ||.||..||.||||||||||.||.|.|||||||||||||.|.||
Sbjct  737  TAAATTTTTTAAGTAAATCTGT-AAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGA  809

Query  810  TTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGACTCTGAGACCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC  883
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC  883

Query  884  TCATGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCTTTCATTATATAT  957
            ||...|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|.|||||
Sbjct  884  TCGCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATAT  957

Query  958  GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAAGTGCAGAAGGAAATTGATACAGTTTTACCCAATAAGGCACC  1031
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct  958  GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACC  1031

Query 1032  ACCCACCTATGATACTGTGCTACAGTTGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAG  1105
            |||.|||||||||.|.|||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  ACCTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAG  1105

Query 1106  TTGCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAAATCAATGGGATGTTTATTCCCAAAGGGGTGGTG  1179
            |||||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||....||
Sbjct 1106  TTGCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATG  1179

Query 1180  GTGATGATTCCAAGCTATGTTCTTCATCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAG  1253
            |||.|||||||||..||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1180  GTGGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAG  1253

Query 1254  GTTCAGTAAAAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCA  1327
            |||||||   |||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1254  GTTCAGT---AAGAAGAAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCA  1324

Query 1328  TTGGCATGAGGTTTGCTCTCGTGAACATGAAACTTGCTCTAGTCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCT  1401
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TTGGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCT  1398

Query 1402  TGTAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATT----ACGCTTTGGAGGACTTCTTCTAACAGAAAAACCCATTGTTC  1471
            |||||||||||||||||||||.|||||||    ||||    .|||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1399  TGTAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGACACGC----AAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTC  1468

Query 1472  TAAAGGCTGAGTCAAGGGATGAGACCGTAAGTGGAGCC  1509
            ||||||..||.|||||.||||..|||.|||||||||..
Sbjct 1469  TAAAGGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1506