Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06083
• Subject: NM_019813.4
• Aligned Length: 1989
• Identities: 1690
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGGCCGGCGTCAGCTTCAGCGGCCACCGCCTGGAGCTGCTGGCGGCTTACGAGGAGGTGATCCGAGAGGAGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGGCGTCAGCTTCAGCGGCCACCGCCTGGAGCTGCTGGCGGCGTACGAGGAGGTGATCCGGGAGGAGAG  74

Query   75  CGCGGCCGACTGGGCTCTGTACACATATGAAGATGGCTCCGATGACCTCAAGCTTGCAGCATCAGGAGAAGGGG  148
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  CGCAGCCGACTGGGCTCTGTACACATACGAGGATGGCTCAGATGACCTCAAGCTTGCAGCGTCAGGAGAAGGGG  148

Query  149  GCTTGCAGGAGCTTTCGGGACACTTTGAGAACCAGAAGGTGATGTACGGCTTCTGCAGTGTCAAGGACTCCCAA  222
            ||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTGCAGGAGCTTTCCGGCCACTTCGAGAACCAGAAAGTGATGTATGGTTTCTGCAGCGTCAAGGACTCCCAA  222

Query  223  GCTGCTCTGCCAAAATACGTGCTCATCAACTGGGTGGGCGAAGATGTGCCTGATGCCCGCAAGTGCGCTTGTGC  296
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GCTGCCCTGCCAAAATATGTGCTCATCAACTGGGTTGGTGAGGATGTGCCTGATGCCCGAAAATGTGCTTGCGC  296

Query  297  CAGCCACGTGGCTAAGGTGGCAGAGTTCTTCCAGGGTGTCGACGTGATCGTGAACGCCAGCAGCGTGGAAGACA  370
            |||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CAGTCATGTGGCCAAGGTGGCTGAATTCTTCCAGGGTGTTGATGTCATTGTGAATGCCAGCAGTGTGGAAGACA  370

Query  371  TAGACGCGGGTGCCATCGGGCAGCGGCTCTCTAACGGGCTGGCGCGACTCTCCAGCCCTGTGCTGCACCGACTG  444
            |.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||..|||||||.|||
Sbjct  371  TCGATGCTGGTGCCATTGGGCAGCGGCTCTCCAATGGACTGGCACGGCTCTCCAGCCCAGTATTGCACCGCCTG  444

Query  445  CGGCTGCGAGAGGATGAGAACGCAGAGCCCGTGGGCACCACCTACCAGAAGACGGATGCAGCTGTGGAAATGAA  518
            ||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  CGCCTTCGGGAGGATGAAAATGCTGAACCGGTGGGTACCACCTACCAGAAGACGGATGCAGCAGTGGAGATGAA  518

Query  519  GCGGATTAACCGAGAGCAGTTCTGGGAGCAGGCCAAGAAGGAAGAAGAGCTGCGGAAGGAGGAGGAGCGGAAGA  592
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGATTAACCGTGAGCAGTTTTGGGAGCAGGCCAAGAAGGAGGAAGAGCTGCGGAAGGAGGAGGAGCGGAAGA  592

Query  593  AGGCCCTGGATGAGAGGCTCAGGTTCGAGCAGGAGCGGATGGAGCAGGAGCGGCAGGAGCAAGAGGAGCGCGAG  666
            ||||.|||||.|..|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  593  AGGCTCTGGACGCCAGGCTCAGGTTTGAACAGGAACGGATGGAGCAGGAGCGGCAGGAGCAGGAAGAACGTGAG  666

Query  667  CGGCGCTACCGGGAGCGGGAGCAGCAGATCGAGGAGCACAGGAGGAAACAGCAGACTTTAGAAGCGGAAGAGGC  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||.|||||.||
Sbjct  667  CGGCGCTACCGGGAGCGGGAGCAGCAGATTGAGGAGCACAGGAGGAAACAGCAGAGTCTGGAAGCTGAAGAAGC  740

Query  741  CAAGAGGCGGTTGAAGGAGCAGTCTATCTTTGGTGACCATCGGGATGAGGAGGAAGAGACCCACATGAAGAAGT  814
            |||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  741  CAAGAGGAGGTTAAAGGAGCAGTCTATCTTTGGTGACCAGCGGGATGAAGAGGAAGAGTCCCAGATGAAGAAGT  814

Query  815  CAGAGTCGGAGGTGGAGGAGGCAGCAGCTATTATTGCCCAGCGGCCTGACAACCCAAGGGAGTTCTTCAAGCAG  888
            |.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||..|||
Sbjct  815  CGGAGTCAGAGGTGGAGGAGGCGGCTGCCATCATTGCCCAGCGGCCTGATAACCCACGGGAGTTCTTCAGACAG  888

Query  889  CAGGAAAGAGTCGCATCGGCCTCTGCGGGCAGCTGTGA------TGTACCCTCGCCCTTCAACCATCGACCAGG  956
            ||||||.||||.|||||||||||||..|||||||||||      ||..||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CAGGAACGAGTGGCATCGGCCTCTGGTGGCAGCTGTGACGCGCCTGCGCCTGCACCCTTCAACCACCGACCAGG  962

Query  957  CAGCCACCTGGACAGCCACCGGAGGATGGCGCCCACTCCCATCCCCACGCGGAGCCCGTCTGACTCCAGCACCG  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  CAGCCACCTGGACAGCCACCGGAGGATGGCACCCACTCCTATTCCCACCCGGAGCCCATCTGATTCCAGCACAG  1036

Query 1031  CCTCCACCCCTGTCGCTGAGCAGATAGAGCGGGCCCTGGATGAGGTCACCTCCTCGCAGCCTCCACCACTGCCA  1104
            ||||.|||||..|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||.
Sbjct 1037  CCTCTACCCCCATCGCTGAGCAGATCGAGAGGGCCCTGGATGAGGTCACATCCTCGCAGCCTCCACCTCCACCT  1110

Query 1105  CCGCCACCCCCACCAGCCCAAGAGACCCAGGAGCCCAGCCCCATCCTAGA---------CAGTGAGGAGACCAG  1169
            ||.|||||.||||||.|.||||||.||||||||.|.|.|||.|.|||.||         |||..|||||.|||.
Sbjct 1111  CCACCACCTCCACCAACTCAAGAGGCCCAGGAGACTACCCCAAGCCTGGATGAAGAGCTCAGCAAGGAGGCCAA  1184

Query 1170  AG---CAGCAGCCCCTCAGGCCTGGGCCGGCCCCAT----GGAGGAGCCCCCTCAGGCACAGGCGCCTCCCCGG  1236
            ||   |||||||.|||.|||.||||||.|||    |    ||..|||||||||||||||||||..|||||||.|
Sbjct 1185  AGTAACAGCAGCTCCTGAGGTCTGGGCTGGC----TGTGCGGCAGAGCCCCCTCAGGCACAGGAACCTCCCCTG  1254

Query 1237  GGGCCAGGCAG--CCCTGCAGAGGACTTGATGTTCATGGAGTCTGCAGAGCAGGCTGTCCTGGCTGCTCCCGTG  1308
            ..||.|.||||  |||||  |||||||.|||||.||..||.|||.||||||||||||.|||||||||.||.|.|
Sbjct 1255  TTGCAAAGCAGCCCCCTG--GAGGACTCGATGTGCACAGAATCTCCAGAGCAGGCTGCCCTGGCTGCCCCTGCG  1326

Query 1309  GAGCCTGCCACAGCTGACGCC------ACGGAGGTCCACGATGCAGCTGACACCATTGAAACTGACACTGCCAC  1376
            ||||||||..|..|||.|.||      .|.||.||||   |||||||||||||||||||.||...|||||||||
Sbjct 1327  GAGCCTGCTGCCTCTGTCACCTCAGTAGCTGATGTCC---ATGCAGCTGACACCATTGAGACCACCACTGCCAC  1397

Query 1377  TGCTGACACCACTGTTGCCAACAACGTACCCCCCGCCGCCACCAGCCTCATTGACCTATGGCCTGGCAACGGGG  1450
            |.|||||||||||.|||||||||||||..||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TACTGACACCACTATTGCCAACAACGTCACCCCTGCCGCTGCCAGCCTCATTGATCTATGGCCTGGCAACGGGG  1471

Query 1451  AAGGGGCCTCCACACTCCAGGGTGAGCCCAGGGCCCCCACGCCACCCTCGGGTACTGAGGTCACCCTGGCAGAG  1524
            |||.||||||.|||||.||||.|||.|||||||..|||||.||||||||.|||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1472  AAGAGGCCTCAACACTTCAGGCTGAACCCAGGGTGCCCACACCACCCTCAGGTGCTGAGGCCTCCCTGGCAGAG  1545

Query 1525  GTGCCCCTGCTGGATGAGGTGGCTCCGGAGCCACTGCTGCCAGCAGGCGAAGGCTGTGCCACCCTTCTCAACTT  1598
            ||||||||||||.||||||..||||.||||||.||||.|||.|.|||||||||||||||.|.||||||.||.||
Sbjct 1546  GTGCCCCTGCTGAATGAGGCCGCTCAGGAGCCGCTGCCGCCGGTAGGCGAAGGCTGTGCTAACCTTCTTAATTT  1619

Query 1599  TGATGAGCTGCCTGAGCCGCCAGCCACCTTCTGTGACCCAGAGGAAGTGGAAGGGGAGCCCCTGGCTGCCCCCC  1672
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|..|.|||.||..|.|||||||||.|||
Sbjct 1620  TGATGAGCTGCCAGAACCTCCAGCCACCTTCTGTGACCCAGAGGAGGAAGTAGGAGAAACGCTGGCTGCCTCCC  1693

Query 1673  AGACCCCAACTCTGCCCTCAGCCCTTGAGGA------------GCTGGAGCAAGAGCAGGAGCCGGAGCCCCAC  1734
            ||..||.||||.||||||||||.||.|||||            |||||||||.||||.||||||.||.||.|||
Sbjct 1694  AGGTCCTAACTATGCCCTCAGCTCTAGAGGAGGTAGATCAGGTGCTGGAGCAGGAGCTGGAGCCAGAACCTCAC  1767

Query 1735  CTGCTAACCAATGGCGAGACCACCCAGAAGGAGGGGACCCAGGCCAGTGAGGGGTACTTCAGTCAATCACAGGA  1808
            |||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1768  CTGCTGACCAATGGAGAGACCACTCAAAAGGAGGGGACCCAGGCCAGCGAAGGATACTTCAGTCAGTCACAGGA  1841

Query 1809  GGAGGAGTTTGCCCAATCGGAAGAGCTCTGTGCCAAGGCTCCGCCTCCTGTGTTCTACAACAAGCCTCCAGAGA  1882
            |||.|||||.||||||||.|||||||..|||||.||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1842  GGAAGAGTTCGCCCAATCAGAAGAGCCATGTGCAAAGGTTCCGCCTCCTGTATTTTACAACAAGCCTCCAGAAA  1915

Query 1883  TCGACATCACATGCTGGGATGCAGACCCAGTTCCAGAAGAGGAGGAGGGCTTCGAGGGTGGTGAT  1947
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  TCGACATCACCTGCTGGGATGCAGACCCAGTTCCTGAAGAGGAAGAGGGCTTCGAGGGTGGTGAT  1980